112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2214 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  100 
 
 
643 aa  1283    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  50.55 
 
 
624 aa  536  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  47.26 
 
 
571 aa  498  1e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  46.15 
 
 
622 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  41.6 
 
 
658 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  38.36 
 
 
578 aa  300  5e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  39.07 
 
 
629 aa  300  5e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  37.97 
 
 
563 aa  291  3e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  38.27 
 
 
604 aa  289  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  37.82 
 
 
581 aa  280  8e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  35.04 
 
 
639 aa  277  4e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  36.71 
 
 
533 aa  270  5e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  36.86 
 
 
542 aa  265  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  34.22 
 
 
550 aa  261  3e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  35.81 
 
 
539 aa  259  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  34.93 
 
 
491 aa  259  1e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  34.78 
 
 
574 aa  252  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  35.77 
 
 
531 aa  248  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  33.39 
 
 
581 aa  240  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  33.39 
 
 
581 aa  240  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  35.8 
 
 
530 aa  238  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  35.78 
 
 
531 aa  238  2e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  35.87 
 
 
606 aa  238  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  34.52 
 
 
529 aa  236  7e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  34.06 
 
 
510 aa  235  2.0000000000000002e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  34.35 
 
 
543 aa  228  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  32.49 
 
 
513 aa  226  1e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  45.32 
 
 
561 aa  224  3e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  32.62 
 
 
500 aa  221  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  32.64 
 
 
586 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  32.64 
 
 
586 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  33.33 
 
 
551 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  32.95 
 
 
641 aa  218  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  32.94 
 
 
548 aa  217  5e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  40.85 
 
 
572 aa  217  5.9999999999999996e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  32.67 
 
 
543 aa  216  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  34.02 
 
 
518 aa  214  3.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  34.01 
 
 
561 aa  210  8e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  30.76 
 
 
593 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  31.52 
 
 
550 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  33.23 
 
 
666 aa  203  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  33.23 
 
 
666 aa  203  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  31.51 
 
 
555 aa  200  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  31.29 
 
 
531 aa  199  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  29.42 
 
 
591 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  31.09 
 
 
600 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  30.88 
 
 
518 aa  191  2.9999999999999997e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  43.1 
 
 
524 aa  191  5e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  42.81 
 
 
528 aa  188  2e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  31.42 
 
 
568 aa  188  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  45.49 
 
 
475 aa  185  3e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  29.96 
 
 
508 aa  182  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  41.92 
 
 
514 aa  181  2.9999999999999997e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  29.1 
 
 
589 aa  172  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  33.18 
 
 
632 aa  170  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  33.49 
 
 
645 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  31.83 
 
 
527 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  38.46 
 
 
544 aa  154  4e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  57.78 
 
 
188 aa  152  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  30.86 
 
 
450 aa  97.8  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  38.51 
 
 
515 aa  97.4  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  37.93 
 
 
515 aa  95.1  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1122  S-layer domain protein  53.62 
 
 
261 aa  94  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3571  S-layer domain protein  54.41 
 
 
262 aa  90.9  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2542  S-layer domain protein  54.41 
 
 
262 aa  90.9  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0876667 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  26.26 
 
 
437 aa  85.9  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  27.88 
 
 
485 aa  76.6  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  24.75 
 
 
432 aa  74.7  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  35.58 
 
 
440 aa  70.9  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  25.05 
 
 
426 aa  68.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  32.52 
 
 
449 aa  66.6  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  36.19 
 
 
416 aa  66.2  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  24.84 
 
 
414 aa  64.7  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  23.84 
 
 
432 aa  64.7  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  38.39 
 
 
946 aa  63.5  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  36.45 
 
 
932 aa  62  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  37.5 
 
 
919 aa  59.3  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  34.82 
 
 
673 aa  58.2  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  48.89 
 
 
1036 aa  56.6  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  29.41 
 
 
415 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  35.23 
 
 
255 aa  56.2  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18981  hypothetical protein  23.39 
 
 
390 aa  54.7  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0047  S-layer domain-containing protein  41.67 
 
 
468 aa  53.9  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498121  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0176  S-layer domain-containing protein  43.64 
 
 
343 aa  53.5  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000342894  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3023  S-layer domain-containing protein  36.17 
 
 
408 aa  52.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.80605  normal  0.105642 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  31.53 
 
 
784 aa  53.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  28.7 
 
 
361 aa  51.6  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1028  hypothetical protein  24.04 
 
 
409 aa  51.2  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  25 
 
 
441 aa  50.8  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0098  S-layer domain protein  30.48 
 
 
424 aa  50.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0443  S-layer domain-containing protein  39.29 
 
 
400 aa  50.4  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000189503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0458  S-layer domain-containing protein  39.29 
 
 
400 aa  50.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000061041  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1024  S-layer domain-containing protein  26.36 
 
 
403 aa  49.3  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000117034  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  28.21 
 
 
330 aa  49.7  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1096  S-layer domain-containing protein  26.36 
 
 
403 aa  49.3  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000091055  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  40.68 
 
 
413 aa  49.3  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18280  S-layer domain protein  29.5 
 
 
186 aa  48.9  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000785925  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  41.07 
 
 
1821 aa  48.9  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  40.68 
 
 
414 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  46.67 
 
 
548 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>