260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2093 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2093  integrase family protein  100 
 
 
385 aa  803    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.379176  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2497  integrase family protein  39.95 
 
 
384 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.355652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3161  integrase family protein  31.71 
 
 
403 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0145  integrase family protein  33.15 
 
 
363 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0766756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  31.32 
 
 
356 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3235  Phage integrase  28.9 
 
 
395 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4324  integrase family protein  29.61 
 
 
396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1704  integrase family protein  28.23 
 
 
391 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01743  normal  0.0235893 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2605  integrase family protein  30.51 
 
 
376 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0311051  normal  0.282598 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3092  Phage integrase  28.87 
 
 
386 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000712508  normal  0.602347 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2621  integrase family protein  29.2 
 
 
382 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000432273  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3943  putative integrase  34.54 
 
 
209 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0697  integrase family protein  25.07 
 
 
387 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  28.63 
 
 
433 aa  95.9  9e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  26.23 
 
 
396 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24051  hypothetical protein  25.27 
 
 
368 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  32.8 
 
 
471 aa  84  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2575  Phage integrase  39.68 
 
 
147 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  29.73 
 
 
392 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  29.73 
 
 
392 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  30.46 
 
 
397 aa  80.9  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  24.14 
 
 
428 aa  80.1  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  31.32 
 
 
411 aa  79.3  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  30.98 
 
 
414 aa  79  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  30.26 
 
 
412 aa  78.2  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02901  hypothetical protein  25 
 
 
354 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.338381 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  30 
 
 
435 aa  77.8  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  29.12 
 
 
391 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  28.93 
 
 
401 aa  76.6  0.0000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  30.16 
 
 
407 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  28.8 
 
 
356 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  29.74 
 
 
407 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  28.14 
 
 
297 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  28.14 
 
 
297 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  26.95 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  27.35 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  27.59 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  26.25 
 
 
292 aa  70.1  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000402051  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  25.11 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  28.79 
 
 
386 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5056  Phage integrase  29.76 
 
 
473 aa  67.4  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.343108 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  22.49 
 
 
430 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  22.49 
 
 
446 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  22.49 
 
 
446 aa  67.4  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0800  Phage integrase  28.26 
 
 
369 aa  64.7  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  27.27 
 
 
354 aa  64.3  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2325  phage integrase family protein  26.55 
 
 
403 aa  64.3  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633234  hitchhiker  0.0000214757 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  27.44 
 
 
357 aa  63.5  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  27.98 
 
 
363 aa  63.9  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3063  integrase family protein  25.23 
 
 
257 aa  63.2  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000494154  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  22.5 
 
 
426 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  25.67 
 
 
374 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  30.65 
 
 
371 aa  62.4  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  29.35 
 
 
390 aa  61.2  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  26.27 
 
 
384 aa  60.8  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  22.25 
 
 
431 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  28.49 
 
 
325 aa  60.5  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  24.58 
 
 
359 aa  59.7  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  26.32 
 
 
401 aa  59.7  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  25.81 
 
 
378 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  26.32 
 
 
402 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  23.57 
 
 
334 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  24.89 
 
 
362 aa  57  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  23.51 
 
 
428 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1451  integrase family protein  26.32 
 
 
371 aa  57  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  27.27 
 
 
300 aa  56.6  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  27.71 
 
 
414 aa  55.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  27.75 
 
 
353 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  27.51 
 
 
375 aa  55.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  25.89 
 
 
420 aa  55.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  28.93 
 
 
292 aa  55.1  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  30.19 
 
 
433 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  30.3 
 
 
381 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  24.68 
 
 
251 aa  54.3  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1973  integrase family protein  31.84 
 
 
450 aa  54.7  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0126366 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  29.75 
 
 
209 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  29.75 
 
 
381 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  28.79 
 
 
379 aa  53.9  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2377  phage integrase family protein  26.51 
 
 
397 aa  53.9  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.101211  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2126  integrase family protein  29.61 
 
 
449 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  24.44 
 
 
403 aa  53.9  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0163  integrase family protein  26.32 
 
 
342 aa  53.5  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.70922  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2577  integrase  28.65 
 
 
216 aa  53.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.922481 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1994  integrase family protein  28.09 
 
 
315 aa  53.1  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000947418  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0768  integrase family protein  27.46 
 
 
397 aa  52.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2018  integrase family protein  25.94 
 
 
452 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  27.12 
 
 
407 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  24.12 
 
 
367 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  27.59 
 
 
391 aa  52.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.33 
 
 
294 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  22.95 
 
 
393 aa  52.4  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03598  site-specific recombinase, phage integrase family protein  21.93 
 
 
380 aa  52.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.951563  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0598  integrase family protein  24.03 
 
 
283 aa  51.2  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  26.64 
 
 
463 aa  51.2  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  28.65 
 
 
367 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0335  phage integrase family protein  31.36 
 
 
356 aa  50.8  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  23.5 
 
 
390 aa  50.8  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  29.83 
 
 
443 aa  50.8  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0878  phage integrase  30.46 
 
 
429 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  27.86 
 
 
377 aa  50.8  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>