More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1928 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1928  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
652 aa  1340    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18674  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  44.66 
 
 
2361 aa  163  9e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 
742 aa  148  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  39.9 
 
 
430 aa  148  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 
725 aa  142  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  36.84 
 
 
431 aa  140  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.15 
 
 
508 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  38.65 
 
 
387 aa  136  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 
468 aa  131  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
490 aa  129  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0890149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  33.64 
 
 
422 aa  127  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2612  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 
391 aa  127  6e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 
412 aa  127  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 
517 aa  126  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
372 aa  126  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  36.54 
 
 
412 aa  124  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 
682 aa  124  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4745  Histidine kinase  39.9 
 
 
362 aa  124  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.65465  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  38.89 
 
 
413 aa  124  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1308  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 
381 aa  121  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000110665  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 
407 aa  120  7.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1687  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  29.21 
 
 
643 aa  120  7.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461201  normal  0.659068 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  33.33 
 
 
1033 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3373  histidine kinase  33.64 
 
 
1048 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228028  normal  0.520662 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  33.33 
 
 
1031 aa  119  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0174  histidine kinase  37.33 
 
 
432 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 
748 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  36.68 
 
 
397 aa  117  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  27.59 
 
 
373 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 
440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1842  histidine kinase  30.5 
 
 
529 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.93 
 
 
665 aa  114  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  30.61 
 
 
462 aa  114  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 
463 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2927  histidine kinase  35.75 
 
 
717 aa  112  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.340579  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 
397 aa  111  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2339  histidine kinase  36.04 
 
 
1009 aa  111  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  29.95 
 
 
391 aa  110  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
445 aa  110  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0927  Histidine kinase  30.99 
 
 
407 aa  110  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163259  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
574 aa  110  9.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1601  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 
581 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 
464 aa  108  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 
682 aa  108  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 
411 aa  108  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  29.8 
 
 
392 aa  108  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 
357 aa  107  8e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.414543  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  28.63 
 
 
388 aa  106  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 
469 aa  106  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_373  sensor histidine kinase  33.98 
 
 
357 aa  106  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0559697  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 
352 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1033  Histidine kinase  31.22 
 
 
395 aa  105  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0431  sensory box sensor histidine kinase  33.98 
 
 
357 aa  105  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.431568  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 
564 aa  105  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0718  histidine kinase  31.43 
 
 
433 aa  105  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  36.71 
 
 
403 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
546 aa  104  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 
552 aa  104  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.191431 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.57 
 
 
421 aa  104  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3812  histidine kinase  27.09 
 
 
402 aa  104  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00313261 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
399 aa  104  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  31.86 
 
 
391 aa  103  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1204  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.84 
 
 
779 aa  103  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2170  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 
438 aa  103  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.289043  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 
591 aa  103  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
401 aa  103  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0347  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
442 aa  103  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0286068  normal  0.880673 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  30.1 
 
 
351 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  30.1 
 
 
351 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  30.1 
 
 
351 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  30.1 
 
 
351 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  30.1 
 
 
351 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 
412 aa  102  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  30.63 
 
 
405 aa  102  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5427  histidine kinase  34.13 
 
 
437 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.315335 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  32.27 
 
 
381 aa  102  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  32.27 
 
 
381 aa  102  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 
548 aa  102  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 
401 aa  101  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 
401 aa  101  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 
403 aa  100  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  30.1 
 
 
351 aa  100  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 
401 aa  100  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  34.34 
 
 
325 aa  100  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  30.1 
 
 
351 aa  100  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  29.61 
 
 
351 aa  100  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3162  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 
381 aa  100  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.541775  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5536  sensor histidine kinase  22.64 
 
 
523 aa  100  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1385  sensor histidine kinase  26.72 
 
 
377 aa  99.4  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00939681  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1935  Histidine kinase  34.17 
 
 
364 aa  99.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  30.1 
 
 
351 aa  99.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 
425 aa  99  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2326  histidine kinase  29.08 
 
 
396 aa  99.4  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 
526 aa  99  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 
381 aa  98.6  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982334  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3087  PAS sensor signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 
312 aa  99  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.230742  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6981  histidine kinase  35.2 
 
 
389 aa  98.6  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.69549  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.68 
 
 
591 aa  98.6  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0165579 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3088  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 
618 aa  98.2  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 
370 aa  97.8  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>