82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1923 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  100 
 
 		 527 aa  1063    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  48.52 
 
 		 568 aa  450  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  38.33 
 
 		 578 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  36.04 
 
 		 629 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  34.48 
 
 		 542 aa  211  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  34.19 
 
 		 539 aa  201  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  33.27 
 
 		 491 aa  196  8.000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  33.09 
 
 		 574 aa  187  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  34.31 
 
 		 533 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  30.67 
 
 		 624 aa  181  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  30.63 
 
 		 550 aa  177  5e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  31.93 
 
 		 639 aa  176  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  30.74 
 
 		 563 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  31.38 
 
 		 531 aa  173  5.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  32.55 
 
 		 561 aa  170  6e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  28.23 
 
 		 658 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  30.5 
 
 		 581 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  29.53 
 
 		 571 aa  166  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  29.44 
 
 		 591 aa  163  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  29.87 
 
 		 551 aa  163  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  30 
 
 		 529 aa  160  5e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  30.63 
 
 		 548 aa  159  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  30.2 
 
 		 600 aa  157  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  30.83 
 
 		 543 aa  157  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  31.6 
 
 		 643 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  28.6 
 
 		 593 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  46.7 
 
 		 572 aa  153  7e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  29.59 
 
 		 550 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  30.2 
 
 		 555 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  28.68 
 
 		 581 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  28.68 
 
 		 581 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  39.26 
 
 		 530 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  41.35 
 
 		 531 aa  143  9e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  42.53 
 
 		 518 aa  142  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  38.87 
 
 		 543 aa  140  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  27.81 
 
 		 508 aa  136  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  41.56 
 
 		 500 aa  135  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  40.41 
 
 		 622 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  42 
 
 		 606 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  36.18 
 
 		 544 aa  134  5e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  37.87 
 
 		 645 aa  133  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  45.05 
 
 		 604 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  43.41 
 
 		 641 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  37.45 
 
 		 632 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  39.67 
 
 		 510 aa  132  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  41.27 
 
 		 475 aa  130  9.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  42.47 
 
 		 666 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  42.47 
 
 		 666 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  33.64 
 
 		 513 aa  129  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  34.98 
 
 		 589 aa  128  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  39.15 
 
 		 586 aa  126  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  39.15 
 
 		 586 aa  126  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  37.66 
 
 		 514 aa  123  7e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  38.26 
 
 		 524 aa  122  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  42.62 
 
 		 531 aa  121  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  37.15 
 
 		 561 aa  120  7.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  36.76 
 
 		 528 aa  119  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  35.21 
 
 		 518 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  47.97 
 
 		 188 aa  104  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  31.05 
 
 		 450 aa  84  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3571  S-layer domain protein  34.62 
 
 		 262 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2542  S-layer domain protein  34.62 
 
 		 262 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0876667 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1122  S-layer domain protein  43.04 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  32.75 
 
 		 515 aa  73.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  32.37 
 
 		 515 aa  71.6  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  35 
 
 		 437 aa  53.9  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  27.34 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0779  carbohydrate-selective porin OprB  22.59 
 
 		 467 aa  51.2  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000860096  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1757  porin-like protein  33.33 
 
 		 332 aa  51.2  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1028  hypothetical protein  22.51 
 
 		 409 aa  51.2  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  27.15 
 
 		 432 aa  50.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  28.39 
 
 		 426 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04791  hypothetical protein  31.21 
 
 		 333 aa  47.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0282732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  24.44 
 
 		 440 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  26.32 
 
 		 449 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2751  carbohydrate-selective porin OprB  23.2 
 
 		 446 aa  45.8  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.202947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  32.67 
 
 		 485 aa  45.8  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  32.58 
 
 		 255 aa  45.4  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  28.19 
 
 		 414 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1512  hypothetical protein  27.56 
 
 		 431 aa  45.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.486809  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  29.14 
 
 		 432 aa  45.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  32.77 
 
 		 673 aa  44.7  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>