More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1915 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 365 aa  753    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  60.86 
 
 		 368 aa  438  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11141  hypothetical protein  50.34 
 
 		 324 aa  286  4e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  39.63 
 
 		 339 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  42.77 
 
 		 322 aa  234  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  36.86 
 
 		 317 aa  227  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  27.43 
 
 		 318 aa  152  8e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1156  periplasmic solute binding protein  32.63 
 
 		 303 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  32.96 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  31.6 
 
 		 317 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  32.19 
 
 		 514 aa  149  9e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  31.92 
 
 		 290 aa  145  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  28.75 
 
 		 309 aa  143  5e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  31.8 
 
 		 296 aa  143  6e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  29.07 
 
 		 307 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  30.56 
 
 		 306 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  29.38 
 
 		 293 aa  139  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  27.22 
 
 		 328 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  29.76 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  31.15 
 
 		 290 aa  138  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.19 
 
 		 349 aa  138  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  30.5 
 
 		 290 aa  138  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  29.39 
 
 		 302 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  31.01 
 
 		 282 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  30.88 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  28.91 
 
 		 300 aa  133  5e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  32.41 
 
 		 292 aa  132  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3046  periplasmic solute binding protein  32.33 
 
 		 336 aa  132  9e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205239  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  30.74 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  30.67 
 
 		 298 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  28.21 
 
 		 301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  32.17 
 
 		 310 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  30.31 
 
 		 316 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  29.48 
 
 		 333 aa  128  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  28.57 
 
 		 326 aa  127  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  28.87 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0989  periplasmic solute binding protein  30.22 
 
 		 295 aa  127  4.0000000000000003e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  30.31 
 
 		 316 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.64 
 
 		 320 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1232  periplasmic solute binding protein  29.49 
 
 		 347 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  30.31 
 
 		 316 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  30.31 
 
 		 316 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  29.97 
 
 		 316 aa  126  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  29.97 
 
 		 316 aa  126  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  29.9 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2184  ABC transporter substrate binding protein (zinc)  29.22 
 
 		 308 aa  123  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2291  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  28.43 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  25.61 
 
 		 310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  29.13 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  28.62 
 
 		 310 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  33.55 
 
 		 307 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 321 aa  119  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  34.56 
 
 		 346 aa  119  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  25.87 
 
 		 298 aa  119  7e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  33.68 
 
 		 309 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  29.69 
 
 		 304 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  27.13 
 
 		 316 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  25.52 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  27.83 
 
 		 316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  27.53 
 
 		 318 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1015  solute binding protein  29.28 
 
 		 310 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  26.83 
 
 		 316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  25.61 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  32.78 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  26.15 
 
 		 317 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  29.79 
 
 		 341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  26.15 
 
 		 317 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  30.28 
 
 		 296 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  28.02 
 
 		 325 aa  116  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  30.27 
 
 		 309 aa  116  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  26.59 
 
 		 328 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  28.37 
 
 		 303 aa  115  8.999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  29.7 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  30.34 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  30.38 
 
 		 506 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  32.76 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  25.18 
 
 		 314 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  28.04 
 
 		 292 aa  114  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  27.24 
 
 		 292 aa  114  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  29.15 
 
 		 304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0024  periplasmic solute binding protein  28.24 
 
 		 312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  0.178577 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  29.15 
 
 		 304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  26.32 
 
 		 316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3491  periplasmic solute binding protein  27.21 
 
 		 323 aa  113  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.171763  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  31.54 
 
 		 325 aa  112  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  25.68 
 
 		 300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18350  periplasmic solute binding protein  26.17 
 
 		 308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000303257  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2781  periplasmic solute binding protein  28.79 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2846  periplasmic solute binding protein  28.74 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  27.78 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1674  adhesion protein, putative  27.3 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0484174  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3183  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 371 aa  110  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0392805  normal  0.124808 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2718  periplasmic solute binding protein  28.97 
 
 		 344 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  26.4 
 
 		 344 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1015  periplasmic solute binding protein  28.52 
 
 		 293 aa  109  6e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  31.64 
 
 		 292 aa  109  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1533  periplasmic solute binding protein  31.14 
 
 		 308 aa  109  6e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.411014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2168  periplasmic solute binding protein  30.33 
 
 		 333 aa  109  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0250158  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2600  periplasmic solute binding protein  30.51 
 
 		 316 aa  109  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  27.34 
 
 		 313 aa  109  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>