More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1813 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1813  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  100 
 
 
293 aa  604  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.869871 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6028  transcriptional regulator, IclR family  39.65 
 
 
546 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0187184  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6939  gluconolactonase  40.57 
 
 
308 aa  218  7e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000441161  normal  0.601759 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3586  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  39.71 
 
 
569 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63579  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3160  senescence marker protein-30 (SMP-30)  41.34 
 
 
289 aa  217  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1987  SMP-30/CGR1 family protein  39.58 
 
 
288 aa  217  2e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5252  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  42.22 
 
 
281 aa  214  9e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0015  gluconolactonase  38.87 
 
 
288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2314  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  37.14 
 
 
295 aa  206  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122885  normal  0.0745328 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2259  gluconolactonase  41.81 
 
 
315 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0162749  unclonable  0.0000000178231 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1040  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  38.54 
 
 
312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3214  gluconolactonase  37.85 
 
 
290 aa  194  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3534  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  38.65 
 
 
299 aa  194  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0305763 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0279  gluconolactonase  39.24 
 
 
295 aa  192  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.27578  normal  0.327592 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0519  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.13 
 
 
285 aa  189  4e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.530056  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2566  regucalcin family protein  34.49 
 
 
300 aa  189  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3696  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  37.14 
 
 
296 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2611  regucalcin family protein  35.34 
 
 
300 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00251849  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0063  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.92 
 
 
292 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2337  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.41 
 
 
289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.992536  normal  0.0209348 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2649  regucalcin family protein  34.49 
 
 
300 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00899995  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2759  regucalcin family protein  34.15 
 
 
300 aa  183  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000386621 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2681  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  36.01 
 
 
574 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2373  regucalcin-like protein  34.34 
 
 
303 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2611  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  36.91 
 
 
309 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.170386 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2339  regucalcin-like protein  33.8 
 
 
300 aa  179  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2571  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  35.99 
 
 
299 aa  172  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.233694  normal  0.0110739 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  35.79 
 
 
300 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0724481  normal  0.472468 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0453  gluconolactonase  37.06 
 
 
289 aa  169  7e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2994  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.49 
 
 
304 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.412095  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2014  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.75 
 
 
289 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.169753  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3300  gluconolactonase  37.25 
 
 
291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.875463 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2186  senescence marker protein-30 (SMP-30)  36.51 
 
 
292 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00122  regucalcin  34.04 
 
 
303 aa  166  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.235017  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4675  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.92 
 
 
318 aa  166  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0075  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.22 
 
 
289 aa  166  5e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.72815 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2143  hypothetical protein  34.91 
 
 
291 aa  166  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4002  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  35.09 
 
 
293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2755  hypothetical protein  33.8 
 
 
303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.334703  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3407  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36.14 
 
 
300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13947  normal  0.0742686 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3453  gluconolactonase  34.71 
 
 
297 aa  163  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.222045 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2046  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  37.12 
 
 
302 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00681526  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0353  putative senescence marker protein-30 (SMP-30)  36.23 
 
 
295 aa  162  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000291446  hitchhiker  0.0000011261 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3531  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  34.38 
 
 
309 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0747  senescence marker protein-30 (SMP-30)  37.5 
 
 
284 aa  161  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5444  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.99 
 
 
295 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00675978 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3664  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.04 
 
 
304 aa  159  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000466286  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4190  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.07 
 
 
301 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4078  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.07 
 
 
301 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1362  Xylono-1,4-lactonase  34.16 
 
 
294 aa  159  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2670  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.6 
 
 
574 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.142476  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2584  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.75 
 
 
304 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5175  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  37.32 
 
 
296 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0979633  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3180  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain protein  35.52 
 
 
346 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.61 
 
 
330 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.15283  hitchhiker  0.000142623 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1727  gluconolactonase  34.27 
 
 
296 aa  156  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1529  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.1 
 
 
292 aa  156  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3322  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.84 
 
 
294 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0550  L-arabinonolactonase  35.59 
 
 
304 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621286  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1974  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.67 
 
 
302 aa  155  9e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.18647  hitchhiker  0.00196761 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2536  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.83 
 
 
346 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0398  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.04 
 
 
302 aa  154  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.993472 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3342  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  37.32 
 
 
294 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88627  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2001  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.67 
 
 
302 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00903181  hitchhiker  0.0000000314659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2088  hypothetical protein  34.67 
 
 
300 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000545594 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1052  senescence marker protein-30 family protein  32.41 
 
 
294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3491  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  35.34 
 
 
281 aa  152  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00470  conserved hypothetical protein  32.53 
 
 
315 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0358  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.74 
 
 
305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.60058  normal  0.0997512 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1799  gluconolactonase  34.13 
 
 
309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328228  hitchhiker  0.000281102 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0568  regucalcin family protein  33.56 
 
 
291 aa  151  1e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4241  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.99 
 
 
293 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.557262  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4867  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.33 
 
 
309 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0126426  normal  0.175747 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1592  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.76 
 
 
300 aa  149  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0241  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.21 
 
 
291 aa  149  5e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4476  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.95 
 
 
290 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0784664  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4143  gluconolactonase  36.74 
 
 
291 aa  146  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.670498  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1170  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain protein  32 
 
 
293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482172  normal  0.0648021 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1567  senescence marker protein-30 (SMP-30)  36.07 
 
 
294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.382911  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1625  senescence marker protein-30 family protein  35.31 
 
 
310 aa  145  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0122  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.68 
 
 
308 aa  146  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.271646  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0517  gluconolactonase  31.88 
 
 
311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05363  hypothetical protein  34.85 
 
 
296 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00449707 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4591  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.63 
 
 
300 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253275 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1188  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.14 
 
 
292 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.227591  normal  0.0804871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0514  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.98 
 
 
294 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2750  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.8 
 
 
280 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2881  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.31 
 
 
302 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.204717  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5221  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  35.56 
 
 
300 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5638  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  35.56 
 
 
300 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700082  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2099  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.03 
 
 
291 aa  144  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.83958 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1204  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.14 
 
 
293 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1323  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.75 
 
 
287 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198758  normal  0.707681 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0419  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.11 
 
 
296 aa  143  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5506  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.94 
 
 
293 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0235  gluconolactonase  32.88 
 
 
323 aa  143  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0901  senescence marker protein-30 (SMP-30)  30.93 
 
 
294 aa  142  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.936604  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2995  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.41 
 
 
302 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2812  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.41 
 
 
302 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2591  gluconolactonase  31.6 
 
 
312 aa  142  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000189317  normal  0.0284024 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>