32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1799 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1799  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 103 aa  207  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3774  transcriptional regulator, XRE family  53.49 
 
 		 94 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0502189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4414  transcriptional regulator, XRE family  56.25 
 
 		 99 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.514306 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4734  XRE family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 82 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.138063  normal  0.154831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3627  transcriptional regulator, XRE family  43.04 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4293  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 239 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2500  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 69 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000069797  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3770  transcriptional regulator, XRE family  56.25 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_264  hypothetical protein  38.89 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0746  transcriptional regulator, XRE family  43.14 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.376996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3947  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5367  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.216549 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3876  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03356  hypothetical protein  50 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4931  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.724146 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03405  predicted transcriptional regulator  50 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4051  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3756  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0157  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3971  putative transcriptional regulator  47.5 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2833  hypothetical protein  38.18 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0161  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5216  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5139  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 97 aa  42.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.576626  normal  0.0207575 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3108  N-6 DNA methylase  40.98 
 
 		 610 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2054  hypothetical protein  34.69 
 
 		 255 aa  42.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000229491  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0269  XRE family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.506568  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 380 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1852  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00565598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0955  XRE family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 232 aa  41.2  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0068  hypothetical protein  31.08 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0182  putative transcriptional regulator  31.08 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>