More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1682 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1682  ribosomal protein S6  100 
 
 		 106 aa  217  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3887  30S ribosomal protein S6  61.46 
 
 		 117 aa  126  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311083  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  61.05 
 
 		 108 aa  125  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4893  30S ribosomal protein S6  56.48 
 
 		 108 aa  125  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  62.64 
 
 		 107 aa  114  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  57.89 
 
 		 176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21891  30S ribosomal protein S6  55.21 
 
 		 138 aa  111  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1316  30S ribosomal protein S6  55.91 
 
 		 138 aa  110  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0742  30S ribosomal protein S6  55.43 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.035409  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0713  30S ribosomal protein S6  54.35 
 
 		 124 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18971  30S ribosomal protein S6  53.76 
 
 		 155 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2677  30S ribosomal protein S6  54.84 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30071  30S ribosomal protein S6  52.69 
 
 		 124 aa  103  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.319395 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19161  30S ribosomal protein S6  50.54 
 
 		 174 aa  103  9e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18431  30S ribosomal protein S6  51.61 
 
 		 172 aa  103  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.800944 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2306  30S ribosomal protein S6  51.61 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1799  30S ribosomal protein S6  49.46 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18971  30S ribosomal protein S6  50.54 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  43.48 
 
 		 95 aa  89.4  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  41.86 
 
 		 98 aa  84.7  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 95 aa  84.3  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  48.86 
 
 		 95 aa  82.8  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  41.3 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 96 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 96 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 95 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  42.39 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  39.56 
 
 		 94 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4537  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287316  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0413  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 98 aa  74.7  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000259691  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0424  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 98 aa  74.7  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4504  ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 210 aa  73.6  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0007  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 98 aa  73.6  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000068559  hitchhiker  0.0000000000002413 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  37.5 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  37.5 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1728  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000419207  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  37.5 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  32 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  36.73 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0044  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 98 aa  70.5  0.000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  38.61 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  36.36 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  34.83 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2186  30S ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 117 aa  70.1  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1714  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  35.56 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0739  ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0945845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  36.26 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  34.09 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  34.09 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3482  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676473  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0741  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  0.125363 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1830  ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.776664  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  41.67 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2503  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000597267  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2024  30S ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.359562  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  37.5 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0139  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1666  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15324  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1772  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  31.82 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1094  ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380454  normal  0.02861 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2824  30S ribosomal protein S6  33.68 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2446  30S ribosomal protein S6  33.68 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045402 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1114  ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263419  normal  0.860444 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0569  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 148 aa  63.5  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1412  30S ribosomal protein S6  30.68 
 
 		 101 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000404173  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0055  ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000548177  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0010  30S ribosomal protein S6  35.35 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1212  30S ribosomal protein S6  31.46 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.709191 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1197  30S ribosomal protein S6  32.22 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.358566  normal  0.0253087 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1352  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 132 aa  62  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0105388  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1416  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  33.68 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1054  30S ribosomal protein S6  32.22 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1131  30S ribosomal protein S6  32.95 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.999974  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4637  30S ribosomal protein S6  30 
 
 		 134 aa  62  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>