More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1678 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  72.02 
 
 
423 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1678  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 
426 aa  878    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02841  serine hydroxymethyltransferase  73.08 
 
 
416 aa  652    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  75.12 
 
 
411 aa  645    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  77.21 
 
 
424 aa  662    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2076  serine hydroxymethyltransferase  82.2 
 
 
427 aa  711    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.745833  hitchhiker  0.000706319 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  79.95 
 
 
425 aa  704    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4802  serine hydroxymethyltransferase  85.61 
 
 
427 aa  726    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  79.95 
 
 
425 aa  704    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  75.06 
 
 
429 aa  650    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  76.72 
 
 
431 aa  657    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  81.67 
 
 
427 aa  717    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  72.75 
 
 
423 aa  636    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  75.62 
 
 
411 aa  647    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  77.49 
 
 
425 aa  697    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  78.04 
 
 
427 aa  700    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  71.53 
 
 
423 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  71.29 
 
 
423 aa  628  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  63.75 
 
 
411 aa  554  1e-157  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  63.41 
 
 
415 aa  547  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  60.96 
 
 
418 aa  538  9.999999999999999e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 
412 aa  535  1e-151  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  62.53 
 
 
412 aa  536  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  64.22 
 
 
420 aa  536  1e-151  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  61.96 
 
 
417 aa  534  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  60.68 
 
 
412 aa  531  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  60.68 
 
 
412 aa  531  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  60.19 
 
 
412 aa  528  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 
413 aa  529  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  63.48 
 
 
413 aa  530  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  61.96 
 
 
437 aa  529  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  60.83 
 
 
419 aa  529  1e-149  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  61.72 
 
 
429 aa  526  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  59.18 
 
 
413 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  60.83 
 
 
417 aa  527  1e-148  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 
415 aa  526  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  61.74 
 
 
427 aa  525  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0256  serine hydroxymethyltransferase  62.53 
 
 
411 aa  525  1e-148  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.666958 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  60.29 
 
 
415 aa  524  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  58.7 
 
 
413 aa  521  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 
412 aa  523  1e-147  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  58.94 
 
 
413 aa  523  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  58.94 
 
 
414 aa  522  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  58.94 
 
 
413 aa  523  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  61.92 
 
 
415 aa  523  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  58.7 
 
 
413 aa  522  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  58.94 
 
 
414 aa  520  1e-146  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  59.37 
 
 
415 aa  518  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  60.43 
 
 
438 aa  518  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  59.61 
 
 
415 aa  519  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  58.7 
 
 
414 aa  519  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  58.7 
 
 
414 aa  520  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2075  serine hydroxymethyltransferase  61.27 
 
 
415 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0834  serine hydroxymethyltransferase  61.27 
 
 
415 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3250  serine hydroxymethyltransferase  61.27 
 
 
415 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  61.27 
 
 
415 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  58.7 
 
 
413 aa  519  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3234  serine hydroxymethyltransferase  61.27 
 
 
415 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  59.85 
 
 
415 aa  520  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1579  serine hydroxymethyltransferase  61.39 
 
 
431 aa  520  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  61.27 
 
 
415 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  61.17 
 
 
410 aa  521  1e-146  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  61.27 
 
 
415 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  59.08 
 
 
415 aa  519  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  60.19 
 
 
439 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  60.19 
 
 
438 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1827  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 
430 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.752619  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 
412 aa  514  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  59.47 
 
 
412 aa  515  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  58.8 
 
 
413 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  59.8 
 
 
415 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  60.64 
 
 
417 aa  517  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0775  serine hydroxymethyltransferase  60.78 
 
 
415 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0739852  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0806  serine hydroxymethyltransferase  60.78 
 
 
415 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0323  serine hydroxymethyltransferase  60.78 
 
 
415 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  60.92 
 
 
410 aa  517  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  59.02 
 
 
415 aa  516  1.0000000000000001e-145  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2581  serine hydroxymethyltransferase  60.29 
 
 
415 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  59.81 
 
 
431 aa  514  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  59.76 
 
 
417 aa  513  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  58.98 
 
 
422 aa  512  1e-144  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  59.61 
 
 
413 aa  512  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  59.31 
 
 
417 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2927  serine hydroxymethyltransferase  60.54 
 
 
415 aa  513  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  61.12 
 
 
417 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3895  serine hydroxymethyltransferase  60.78 
 
 
415 aa  514  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0821  serine hydroxymethyltransferase  61.61 
 
 
431 aa  513  1e-144  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1379  serine hydroxymethyltransferase  60.78 
 
 
415 aa  513  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2449  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 
415 aa  512  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  59.76 
 
 
417 aa  512  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6867  glycine hydroxymethyltransferase  60.28 
 
 
431 aa  513  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.592385 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  60.19 
 
 
431 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0700  serine hydroxymethyltransferase  60.54 
 
 
431 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0504784  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  59.81 
 
 
432 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0373  serine hydroxymethyltransferase  61.48 
 
 
419 aa  512  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.238829  normal  0.155765 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0683  serine hydroxymethyltransferase  60.54 
 
 
431 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  57.97 
 
 
413 aa  514  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  60.88 
 
 
417 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4270  serine hydroxymethyltransferase  59.41 
 
 
417 aa  510  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8588  serine hydroxymethyltransferase  60.67 
 
 
420 aa  508  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>