More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1664 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  100 
 
 
407 aa  838  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  83.05 
 
 
418 aa  711  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  84.28 
 
 
406 aa  713  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  84.44 
 
 
405 aa  716  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  6.08264e-05  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  82.06 
 
 
406 aa  704  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  83.54 
 
 
457 aa  692  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  84.69 
 
 
405 aa  717  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  84.69 
 
 
405 aa  715  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  72.86 
 
 
455 aa  613  1e-174  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  73.11 
 
 
452 aa  613  1e-174  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  70.17 
 
 
446 aa  608  1e-173  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  69.93 
 
 
446 aa  606  1e-172  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  69.19 
 
 
446 aa  602  1e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  69.88 
 
 
468 aa  594  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  70.9 
 
 
449 aa  593  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  68.69 
 
 
445 aa  579  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  69.42 
 
 
443 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  69.42 
 
 
443 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119498  geranylgeranyl reductase  67.99 
 
 
462 aa  547  1e-154  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50650  predicted protein  63.02 
 
 
463 aa  516  1e-145  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  43.6 
 
 
421 aa  333  3e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  43 
 
 
406 aa  310  3e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  41.75 
 
 
406 aa  307  2e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  41.69 
 
 
379 aa  283  3e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  41.32 
 
 
379 aa  278  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  39.7 
 
 
380 aa  268  1e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  39.45 
 
 
380 aa  264  2e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  39.51 
 
 
380 aa  263  6e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  40.39 
 
 
380 aa  258  2e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  39.52 
 
 
380 aa  255  1e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  38.96 
 
 
400 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0167  geranylgeranyl reductase  38.52 
 
 
393 aa  233  4e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  38.68 
 
 
394 aa  231  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  36.64 
 
 
400 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  37.78 
 
 
394 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  37.78 
 
 
394 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1721  geranylgeranyl reductase  37.4 
 
 
401 aa  221  1e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889725  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  37.53 
 
 
394 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1304  geranylgeranyl reductase  36.81 
 
 
400 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  36.81 
 
 
402 aa  213  6e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  39.76 
 
 
405 aa  212  8e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6424  geranylgeranyl reductase  35.94 
 
 
403 aa  209  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5367  geranylgeranyl reductase  36.24 
 
 
397 aa  208  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.707854 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1854  geranylgeranyl reductase  34.62 
 
 
408 aa  206  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0189229 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2063  geranylgeranyl reductase  36.2 
 
 
399 aa  203  5e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.104109 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4822  geranylgeranyl reductase  35.71 
 
 
397 aa  198  1e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.0333239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5289  geranylgeranyl reductase  35.71 
 
 
397 aa  197  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.683475  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2779  geranylgeranyl reductase  36.98 
 
 
330 aa  185  1e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0629  geranylgeranyl reductase  35.03 
 
 
413 aa  164  2e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978932  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  29.55 
 
 
375 aa  105  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  30.03 
 
 
378 aa  100  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  4.24296e-05 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  26.38 
 
 
387 aa  96.7  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  30.28 
 
 
381 aa  93.6  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  26.23 
 
 
390 aa  92.8  9e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  28.17 
 
 
384 aa  92.8  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.25722e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  26.45 
 
 
390 aa  90.5  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  27.02 
 
 
390 aa  90.1  7e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  28.94 
 
 
396 aa  89.7  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  25.52 
 
 
395 aa  89  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  25.58 
 
 
390 aa  88.6  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  28.33 
 
 
396 aa  87.8  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  26.27 
 
 
382 aa  87  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  26.21 
 
 
391 aa  85.9  1e-15  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  28.96 
 
 
418 aa  85.1  2e-15  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  29.38 
 
 
424 aa  84.7  3e-15  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  26.8 
 
 
368 aa  84.3  4e-15  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  26.96 
 
 
389 aa  83.6  6e-15  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  25.95 
 
 
399 aa  82  2e-14  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  24.74 
 
 
408 aa  81.6  2e-14  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  28.3 
 
 
362 aa  80.9  3e-14  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  7.05466e-05 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  27.34 
 
 
419 aa  81.3  3e-14  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  24.94 
 
 
391 aa  80.5  5e-14  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08531  dehydrogenases (flavoproteins)  29.01 
 
 
398 aa  80.1  6e-14  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.741714  hitchhiker  0.00186449 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  27.03 
 
 
402 aa  80.1  7e-14  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  30.07 
 
 
385 aa  79  1e-13  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  26.76 
 
 
382 aa  79.3  1e-13  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  25.82 
 
 
385 aa  77.4  4e-13  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  25.35 
 
 
425 aa  77  5e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  21.89 
 
 
396 aa  76.3  8e-13  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  7.99674e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  27.76 
 
 
403 aa  75.5  2e-12  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  23.51 
 
 
391 aa  75.5  2e-12  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 
384 aa  74.3  3e-12  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  24.1 
 
 
406 aa  74.3  4e-12  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  25.36 
 
 
348 aa  73.9  5e-12  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  27.53 
 
 
430 aa  73.6  5e-12  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  27.1 
 
 
374 aa  73.2  7e-12  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  27.55 
 
 
379 aa  73.2  7e-12  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4237  putative oxidoreductase  27.27 
 
 
356 aa  72.4  1e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 
432 aa  71.2  3e-11  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  23.89 
 
 
402 aa  71.2  3e-11  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1434  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  26.5 
 
 
436 aa  71.6  3e-11  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  9.88984e-05  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1370  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  26.09 
 
 
434 aa  71.2  3e-11  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  24.55 
 
 
392 aa  70.1  7e-11  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  33.68 
 
 
384 aa  70.1  7e-11  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  30.34 
 
 
341 aa  69.7  8e-11  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  23.53 
 
 
370 aa  69.7  8e-11  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  23.53 
 
 
398 aa  68.9  1e-10  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  27.27 
 
 
431 aa  68.6  2e-10  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  26.89 
 
 
382 aa  68.6  2e-10  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  27.37 
 
 
398 aa  68.2  3e-10  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>