More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1513 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_03301  UvrD/REP helicase  55.32 
 
 
809 aa  872    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.479147  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4154  ATP-dependent DNA helicase PcrA  61.81 
 
 
781 aa  1004    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.906632 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25591  UvrD/REP helicase  57.62 
 
 
802 aa  872    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1669  ATP-dependent DNA helicase Rep  56.18 
 
 
805 aa  900    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03281  UvrD/REP helicase  51.65 
 
 
802 aa  799    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3361  ATP-dependent DNA helicase Rep  66.88 
 
 
772 aa  1084    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.876798 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  100 
 
 
797 aa  1640    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  59.04 
 
 
798 aa  919    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0178  ATP-dependent DNA helicase Rep  59.29 
 
 
796 aa  923    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.349073  normal  0.0817623 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03831  UvrD/REP helicase  56.39 
 
 
805 aa  900    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.209332  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0306  ATP-dependent DNA helicase Rep  51.44 
 
 
802 aa  809    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2168  ATP-dependent DNA helicase Rep  62.55 
 
 
794 aa  1018    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03371  UvrD/REP helicase  52.11 
 
 
802 aa  820    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03271  UvrD/REP helicase  51.44 
 
 
802 aa  807    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4844  ATP-dependent DNA helicase PcrA  64.79 
 
 
776 aa  1067    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4114  ATP-dependent DNA helicase PcrA  61.68 
 
 
781 aa  1003    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4232  ATP-dependent DNA helicase Rep  61.69 
 
 
781 aa  994    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.491131  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1525  ATP-dependent DNA helicase PcrA  60.1 
 
 
772 aa  978    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.93 
 
 
729 aa  590  1e-167  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.62 
 
 
755 aa  586  1e-166  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.24 
 
 
732 aa  575  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.29 
 
 
737 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.61 
 
 
715 aa  573  1.0000000000000001e-162  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.28 
 
 
751 aa  569  1e-161  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.05 
 
 
785 aa  567  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.05 
 
 
741 aa  565  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.03 
 
 
751 aa  566  1e-160  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.98 
 
 
730 aa  561  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.44 
 
 
730 aa  561  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.44 
 
 
730 aa  561  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  42.36 
 
 
707 aa  558  1e-157  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.9 
 
 
742 aa  557  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.51 
 
 
725 aa  556  1e-157  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.02 
 
 
718 aa  556  1e-157  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  40.99 
 
 
731 aa  555  1e-157  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.8 
 
 
747 aa  553  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.75 
 
 
741 aa  553  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  40.12 
 
 
739 aa  550  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.08 
 
 
729 aa  549  1e-155  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.32 
 
 
753 aa  547  1e-154  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.5 
 
 
757 aa  546  1e-154  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  40.94 
 
 
757 aa  547  1e-154  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  39.57 
 
 
753 aa  543  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  39.58 
 
 
744 aa  544  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  40.58 
 
 
736 aa  545  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.55 
 
 
751 aa  542  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  41.32 
 
 
768 aa  544  1e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.67 
 
 
751 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  39.55 
 
 
751 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.67 
 
 
747 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.67 
 
 
751 aa  542  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.55 
 
 
759 aa  537  1e-151  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.78 
 
 
747 aa  537  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.83 
 
 
753 aa  537  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.12 
 
 
711 aa  533  1e-150  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.43 
 
 
756 aa  532  1e-150  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  42.52 
 
 
807 aa  533  1e-150  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.79 
 
 
773 aa  531  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.15 
 
 
831 aa  528  1e-148  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.05 
 
 
766 aa  527  1e-148  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.62 
 
 
763 aa  526  1e-148  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  38.82 
 
 
762 aa  523  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  40.05 
 
 
705 aa  524  1e-147  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  39.9 
 
 
770 aa  521  1e-146  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.72 
 
 
786 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.87 
 
 
765 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.82 
 
 
738 aa  512  1e-144  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  40.95 
 
 
706 aa  512  1e-144  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  39.34 
 
 
762 aa  514  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  39.77 
 
 
738 aa  513  1e-144  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.85 
 
 
694 aa  509  1e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.73 
 
 
858 aa  510  1e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  38.5 
 
 
738 aa  512  1e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.34 
 
 
768 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.9 
 
 
754 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.8 
 
 
838 aa  503  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.97 
 
 
806 aa  503  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.32 
 
 
748 aa  504  1e-141  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0389  UvrD/REP helicase  39.57 
 
 
759 aa  504  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  39.41 
 
 
771 aa  502  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  39.18 
 
 
737 aa  502  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000978375  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.3 
 
 
795 aa  499  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  39.45 
 
 
741 aa  500  1e-140  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  37.42 
 
 
779 aa  502  1e-140  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.97 
 
 
851 aa  499  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  39.61 
 
 
714 aa  496  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.74 
 
 
781 aa  498  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4710  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.05 
 
 
784 aa  498  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.65 
 
 
772 aa  494  9.999999999999999e-139  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.47 
 
 
833 aa  494  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3593  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.73 
 
 
797 aa  494  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.420917  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0076  UvrD/REP helicase  37.82 
 
 
732 aa  489  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111848  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4330  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.18 
 
 
785 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.82343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0059  UvrD/REP helicase  38.08 
 
 
731 aa  492  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5097000000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.24 
 
 
758 aa  491  1e-137  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.15 
 
 
830 aa  489  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4416  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.18 
 
 
785 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.464468  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  38.52 
 
 
746 aa  486  1e-136  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1861  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.93 
 
 
780 aa  487  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.213031 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.42 
 
 
829 aa  488  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>