43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1457 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1457  CsgG family protein, putative  100 
 
 
330 aa  648    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1695  hypothetical protein  45.86 
 
 
332 aa  244  9.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3644  curli production assembly/transport component CsgG  48.26 
 
 
340 aa  238  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8014  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2162  curli production assembly/transport component CsgG  32.53 
 
 
327 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0328897  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0374  Curli production assembly/transport component CsgG  29.15 
 
 
305 aa  95.9  9e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1195  hypothetical protein  28.18 
 
 
315 aa  89.7  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00195714  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4674  curli production assembly/transport component CsgG  30.45 
 
 
337 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.501006  normal  0.0721593 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0420  Curli production assembly/transport component CsgG  29.01 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690548  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0419  Curli production assembly/transport component CsgG  28.67 
 
 
321 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0391  curli production assembly/transport component CsgG  29.64 
 
 
320 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1501  hypothetical protein  31.18 
 
 
228 aa  60.8  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129872 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1717  curli production assembly/transport component CsgG  29.45 
 
 
240 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000937383  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05526  hypothetical protein  27.16 
 
 
322 aa  56.6  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1105  Curli production assembly/transport component CsgG  26.74 
 
 
239 aa  53.9  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000129155  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1518  Curli production assembly/transport component CsgG  33.75 
 
 
209 aa  53.1  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000284024  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4121  curli production assembly/transport component CsgG  24.05 
 
 
323 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15901  hypothetical protein  31.58 
 
 
275 aa  52.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0109  CsgG family protein  26.46 
 
 
225 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136515  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0086  periplasmic protein  25.42 
 
 
435 aa  52.4  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3005  curli production assembly/transport component CsgG  28.8 
 
 
253 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2391  twin-arginine translocation pathway signal  28.8 
 
 
253 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3024  curli production assembly/transport component CsgG  28.8 
 
 
225 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2999  curli production assembly/transport component CsgG  28.8 
 
 
225 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3889  csgG family protein  26.01 
 
 
225 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.816763  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3970  csgG family protein  26.01 
 
 
225 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2914  curli production assembly/transport component CsgG  28.8 
 
 
225 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49802  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0418  hypothetical protein  22.26 
 
 
551 aa  51.2  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.051405 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3082  putative curli production assembly/transport component CsgG  25.45 
 
 
301 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.601979  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1651  putative curli production assembly/transport component CsgG  25.45 
 
 
301 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3467  putative curli production assembly/transport component CsgG  25.45 
 
 
301 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2891  curli production assembly/transport component CsgG, putative  27.84 
 
 
207 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1763  putative curli production assembly/transport component CsgG  22.13 
 
 
324 aa  48.9  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281584  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00570  putative lipoprotein  27.27 
 
 
228 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27192  normal  0.120076 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3786  hypothetical protein  24.58 
 
 
321 aa  47  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0180472  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0666  curli production assembly/transport component CsgG  21.38 
 
 
490 aa  46.6  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0323  TPR repeat-containing protein  37.7 
 
 
212 aa  46.6  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00135307  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0651  hypothetical protein  28.57 
 
 
334 aa  46.6  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0048  putative lipoprotein  27.92 
 
 
228 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3206  curli production assembly/transport component CsgG, putative  27.27 
 
 
207 aa  46.2  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5339  CsgG family protein  33.03 
 
 
224 aa  46.2  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0449  hypothetical protein  23.59 
 
 
394 aa  44.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.964964  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1250  CsgG family protein  24.16 
 
 
227 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0322  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
401 aa  43.1  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000024467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>