More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1422 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1422  response regulator receiver protein  100 
 
 		 119 aa  243  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.153955  normal  0.123704 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  62.18 
 
 		 119 aa  167  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  54.62 
 
 		 121 aa  138  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  50.42 
 
 		 121 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  50.42 
 
 		 121 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  49.15 
 
 		 120 aa  124  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  45.38 
 
 		 121 aa  124  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 121 aa  123  8.000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 121 aa  121  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 124 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  45.69 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 120 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  46.22 
 
 		 122 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  46.22 
 
 		 122 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  45.13 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  44.95 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 125 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0717  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 115 aa  107  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4605  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 120 aa  103  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509614 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  40 
 
 		 120 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  43.1 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 125 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  39.13 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4285  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 122 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4345  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 122 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 121 aa  98.2  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  41.07 
 
 		 121 aa  96.7  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0912  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 118 aa  95.1  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.616011 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 121 aa  94.7  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 121 aa  94  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  40 
 
 		 121 aa  93.6  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2622  response regulator receiver  38.26 
 
 		 123 aa  92.8  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0743  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1777  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.03 
 
 		 226 aa  92.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0722021  normal  0.591414 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.66 
 
 		 236 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0670  response regulator receiver domain-containing protein  38.26 
 
 		 122 aa  92.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00691443  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  37.29 
 
 		 122 aa  92  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01603  PilH  35.29 
 
 		 120 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.376187  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 		 230 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0479  response regulator receiver modulated serine phosphatase  41.53 
 
 		 529 aa  91.3  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 		 230 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  35.71 
 
 		 230 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1842  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 122 aa  90.9  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.808404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  36.75 
 
 		 120 aa  90.9  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 121 aa  90.9  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  37.93 
 
 		 121 aa  90.5  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  35.4 
 
 		 121 aa  90.5  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.66 
 
 		 235 aa  90.5  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2264  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  41.88 
 
 		 525 aa  90.5  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  36.52 
 
 		 460 aa  90.1  9e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0504  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.66 
 
 		 427 aa  89.7  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4410  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 131 aa  88.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.686937 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3778  response regulator receiver domain-containing protein  39.66 
 
 		 124 aa  89.4  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 239 aa  89.4  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0834  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 226 aa  88.2  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.6033  unclonable  0.00000000040546 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4483  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 226 aa  88.6  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.759432  decreased coverage  0.000734691 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0415  two component transcriptional regulator  35.71 
 
 		 231 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2266  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  34.75 
 
 		 230 aa  87.8  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0522  response regulator receiver domain-containing protein  35.96 
 
 		 120 aa  87.8  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0515  response regulator receiver protein  36.61 
 
 		 120 aa  88.2  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.163432  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.98 
 
 		 236 aa  87.8  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0707  two component transcriptional regulator  35.59 
 
 		 227 aa  87.4  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 123 aa  87.8  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1751  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.19 
 
 		 234 aa  87.4  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1382  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 302 aa  87.4  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.89 
 
 		 236 aa  87  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000906935 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0653  two-component response regulator PhoB  37.07 
 
 		 230 aa  87  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.131558  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  34.48 
 
 		 229 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.45 
 
 		 226 aa  86.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  35.34 
 
 		 234 aa  86.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 255 aa  86.7  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3838  response regulator receiver domain-containing protein  40.68 
 
 		 234 aa  86.7  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000539223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  35.34 
 
 		 234 aa  86.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.21 
 
 		 310 aa  86.3  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  35.29 
 
 		 128 aa  85.9  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3691  two component transcriptional regulator  40.68 
 
 		 230 aa  85.9  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  37.93 
 
 		 229 aa  85.9  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  34.75 
 
 		 234 aa  85.9  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1464  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 579 aa  85.9  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3661  two component transcriptional regulator  38.79 
 
 		 226 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.394742  normal  0.594777 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0467  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  35.29 
 
 		 121 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>