122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1416 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1416  protein of unknown function UPF0016  100 
 
 
205 aa  400  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000085126  normal  0.0435338 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2812  hypothetical protein  53.11 
 
 
207 aa  204  9e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0442217  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0667  hypothetical protein  51.2 
 
 
233 aa  197  7.999999999999999e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.142799  normal  0.0573866 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_6052  predicted protein  47.87 
 
 
218 aa  168  4e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.388708  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1990  hypothetical protein  45.54 
 
 
220 aa  160  9e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.302563 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15159  predicted protein  39.9 
 
 
210 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000205164  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_6595  predicted protein  42.19 
 
 
230 aa  134  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213111  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31737  predicted protein  41.67 
 
 
212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452882  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45794  predicted protein  35.06 
 
 
286 aa  125  3e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12265  predicted protein  38.83 
 
 
208 aa  107  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.166201  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7690  predicted protein  38.38 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.113136  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4726  protein of unknown function UPF0016  33.33 
 
 
270 aa  88.2  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04690  vacuole protein, putative  42.86 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04814  UPF0016 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07080)  54.05 
 
 
516 aa  78.6  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0310386  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  30.77 
 
 
192 aa  77  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0167  hypothetical protein  32.32 
 
 
196 aa  73.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0395  hypothetical protein  29.9 
 
 
216 aa  71.6  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000330292  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2016  hypothetical protein  31.47 
 
 
256 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0262  protein of unknown function UPF0016  30.5 
 
 
199 aa  67.8  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235138  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01050  predicted membrane protein  31.09 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10240  predicted membrane protein  31.03 
 
 
192 aa  64.7  0.0000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4708  hypothetical protein  32.83 
 
 
261 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.667531  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1312  hypothetical protein  26.96 
 
 
216 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  29.44 
 
 
192 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1998  hypothetical protein  29.85 
 
 
200 aa  63.2  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.579109  normal  0.0445396 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2448  protein of unknown function UPF0016  29.63 
 
 
196 aa  62  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848775  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5105  protein of unknown function UPF0016  29.65 
 
 
197 aa  62.4  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.440587 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1084  protein of unknown function UPF0016  27.45 
 
 
215 aa  62.4  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1237  protein of unknown function UPF0016  27.55 
 
 
218 aa  62  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1390  protein of unknown function UPF0016  25.98 
 
 
216 aa  61.6  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.023314  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0327  hypothetical protein  27.37 
 
 
190 aa  60.8  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0155  protein of unknown function UPF0016  31.66 
 
 
238 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.915442  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6459  hypothetical protein  30.53 
 
 
360 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0933  hypothetical protein  29.57 
 
 
201 aa  59.7  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413996  normal  0.753002 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1056  hypothetical protein  25.47 
 
 
231 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0551  protein of unknown function UPF0016  26.92 
 
 
195 aa  58.2  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000259464  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2260  hypothetical protein  30.98 
 
 
195 aa  58.2  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  29.52 
 
 
196 aa  57.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2117  hypothetical protein  32.61 
 
 
194 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0157  protein of unknown function UPF0016  31 
 
 
205 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.907985  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1345  protein of unknown function UPF0016  25 
 
 
212 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0794  hypothetical protein  25.98 
 
 
213 aa  55.8  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552893  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2039  protein of unknown function UPF0016  24.5 
 
 
196 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.589069  hitchhiker  0.00000000898807 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2616  hypothetical protein  33.77 
 
 
239 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2663  hypothetical protein  28.27 
 
 
204 aa  53.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5425  hypothetical protein  27.5 
 
 
235 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0533  hypothetical protein  27.84 
 
 
187 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559116  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1430  hypothetical protein  27.27 
 
 
186 aa  52.4  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000236998  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0516  protein of unknown function UPF0016  28.14 
 
 
187 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113311  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0745  hypothetical protein  29.57 
 
 
189 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0996219  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0488  hypothetical protein  28.14 
 
 
205 aa  51.6  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0667  hypothetical protein  28.16 
 
 
191 aa  51.2  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  28.57 
 
 
191 aa  51.2  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0115  hypothetical protein  24.51 
 
 
189 aa  51.2  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.454945  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2417  hypothetical protein  35.4 
 
 
132 aa  51.2  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  29.59 
 
 
190 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  29.59 
 
 
190 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0575  hypothetical protein  26.84 
 
 
184 aa  50.1  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  29.59 
 
 
190 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  29.59 
 
 
190 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  29.59 
 
 
190 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  29.59 
 
 
190 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  29.59 
 
 
190 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13884  transmembrane protein  30.81 
 
 
302 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0360  hypothetical protein  29.35 
 
 
185 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0760  hypothetical protein  25.25 
 
 
194 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0788  hypothetical protein  25.25 
 
 
194 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.632611 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4428  hypothetical protein  25.25 
 
 
194 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6418  protein of unknown function UPF0016  28.93 
 
 
198 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00518335  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4337  hypothetical protein  29.17 
 
 
188 aa  48.9  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0802  hypothetical protein  25.74 
 
 
194 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0125  protein of unknown function UPF0016  25.62 
 
 
235 aa  48.5  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0237504  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  26.18 
 
 
185 aa  48.5  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0241  hypothetical protein  26.67 
 
 
191 aa  48.5  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5046  hypothetical protein  27 
 
 
235 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5134  hypothetical protein  27 
 
 
235 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0853146  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2416  hypothetical protein  27.66 
 
 
205 aa  48.1  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1664  protein of unknown function UPF0016  28.5 
 
 
211 aa  48.1  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.508745  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  26.18 
 
 
185 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0590  membrane protein-like  37.08 
 
 
115 aa  47  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0431355  normal  0.533065 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4890  hypothetical protein  29.32 
 
 
196 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0782  hypothetical protein  29.65 
 
 
195 aa  46.6  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.527529  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3189  hypothetical protein  24.87 
 
 
184 aa  47  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.372005  normal  0.740442 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  26.88 
 
 
190 aa  46.2  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  26.67 
 
 
190 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0880  hypothetical protein  26.7 
 
 
218 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0892  hypothetical protein  26.7 
 
 
218 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209746  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2378  hypothetical protein  31.37 
 
 
138 aa  45.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4713  hypothetical protein  25.74 
 
 
194 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133421  normal  0.150702 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0591  membrane protein-like  34.48 
 
 
108 aa  46.2  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0615374  normal  0.537899 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0688  hypothetical protein  27.18 
 
 
190 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155693  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0094  hypothetical protein  30.21 
 
 
190 aa  45.8  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169792 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  24.88 
 
 
204 aa  45.4  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  26.4 
 
 
234 aa  45.4  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0538  hypothetical protein  27.42 
 
 
190 aa  45.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0976  hypothetical protein  27.42 
 
 
190 aa  45.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0349597 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1017  hypothetical protein  27.42 
 
 
218 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2940  hypothetical protein  30.35 
 
 
186 aa  45.1  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.835594  normal  0.0290979 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0521  protein of unknown function UPF0016  28.14 
 
 
187 aa  45.1  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0577  hypothetical protein  30.81 
 
 
193 aa  44.7  0.0009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.188553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>