More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1401 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
217 aa  434  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  63.08 
 
 
219 aa  271  5e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  60.09 
 
 
218 aa  258  6e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  63.59 
 
 
211 aa  249  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  52.29 
 
 
223 aa  209  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  53.02 
 
 
222 aa  207  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.88 
 
 
216 aa  206  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  51.69 
 
 
220 aa  206  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.76 
 
 
218 aa  198  4e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.24 
 
 
217 aa  193  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.29 
 
 
217 aa  193  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.86 
 
 
239 aa  192  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  46.51 
 
 
215 aa  191  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  46.51 
 
 
215 aa  191  6e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  46.51 
 
 
215 aa  191  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  46.51 
 
 
215 aa  191  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  46.51 
 
 
215 aa  191  6e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  46.05 
 
 
215 aa  190  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.76 
 
 
225 aa  189  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  46.05 
 
 
215 aa  189  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  46.05 
 
 
215 aa  189  3e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  46.05 
 
 
215 aa  189  3e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  50.71 
 
 
223 aa  189  3e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  46.05 
 
 
215 aa  188  6e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  43.66 
 
 
220 aa  187  9e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.93 
 
 
219 aa  187  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  46.6 
 
 
218 aa  186  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  50 
 
 
218 aa  186  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6211  response regulator receiver protein  47.91 
 
 
239 aa  185  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  43.13 
 
 
222 aa  185  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.57 
 
 
221 aa  184  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 
226 aa  184  7e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  49.06 
 
 
221 aa  184  7e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 
225 aa  184  7e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  48.36 
 
 
226 aa  183  2e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.71 
 
 
216 aa  182  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  5.48978e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  49.29 
 
 
221 aa  182  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  2.10563e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 
217 aa  182  4e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  49.03 
 
 
218 aa  182  4e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
216 aa  182  5e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.47 
 
 
226 aa  181  8e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  48.08 
 
 
221 aa  181  9e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.17 
 
 
241 aa  180  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1633  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.83 
 
 
241 aa  180  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  50 
 
 
216 aa  181  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  47.85 
 
 
213 aa  180  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.48 
 
 
226 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  41.71 
 
 
216 aa  181  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.6 
 
 
230 aa  181  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.12 
 
 
225 aa  180  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4575  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.82 
 
 
224 aa  179  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.703378  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.11 
 
 
222 aa  180  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.13 
 
 
229 aa  180  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  48.57 
 
 
230 aa  179  3e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  46.01 
 
 
234 aa  179  3e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  47.87 
 
 
219 aa  179  3e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0232  response regulator receiver protein  46.6 
 
 
213 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  47.09 
 
 
228 aa  178  5e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  44.55 
 
 
228 aa  178  6e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  45.54 
 
 
216 aa  178  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21900  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  48.15 
 
 
230 aa  177  9e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00486265  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  48.31 
 
 
215 aa  177  9e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  46.6 
 
 
215 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  49.05 
 
 
230 aa  177  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4134  two component LuxR family transcriptional regulator  44.16 
 
 
250 aa  177  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4366  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.71 
 
 
225 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  40.49 
 
 
208 aa  177  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.92 
 
 
215 aa  177  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  50.69 
 
 
226 aa  176  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5788  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.07 
 
 
214 aa  176  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.785726 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2375  DNA-binding response regulator, LuxR family  44.02 
 
 
209 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.44 
 
 
224 aa  176  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.62 
 
 
225 aa  176  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.05 
 
 
218 aa  176  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.98 
 
 
224 aa  176  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.12 
 
 
234 aa  176  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  46.45 
 
 
220 aa  176  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  44.23 
 
 
210 aa  175  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  3.08683e-08  hitchhiker  3.50245e-10 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.76 
 
 
228 aa  175  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2848  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.71 
 
 
212 aa  175  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3601  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 
222 aa  175  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.324048  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7843  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.05 
 
 
231 aa  175  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.176081 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  48.79 
 
 
212 aa  175  5e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.2 
 
 
230 aa  175  5e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  44.23 
 
 
210 aa  174  6e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.36266e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2601  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.44 
 
 
234 aa  175  6e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.1212  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  44.23 
 
 
210 aa  174  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  45.63 
 
 
207 aa  174  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.63 
 
 
222 aa  175  6e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  44.23 
 
 
210 aa  174  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  44.23 
 
 
210 aa  174  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  9.42452e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  44.23 
 
 
210 aa  174  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  4.40829e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  44.23 
 
 
210 aa  174  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  5.38049e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.95 
 
 
225 aa  174  7e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1972  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.5 
 
 
217 aa  174  8e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  7.94288e-08  unclonable  3.32591e-08 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  44.23 
 
 
210 aa  174  8e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  3.32221e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  48.84 
 
 
227 aa  174  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  45.54 
 
 
234 aa  174  1e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3768  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.7 
 
 
223 aa  174  1e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.28303  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.71 
 
 
230 aa  174  1e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>