More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1398 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 504 aa  991    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  59.05 
 
 		 517 aa  514  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  41.53 
 
 		 489 aa  306  7e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  38.43 
 
 		 500 aa  297  3e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0926  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.71 
 
 		 490 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1966  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.88 
 
 		 487 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1993  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.88 
 
 		 487 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.702751  normal  0.0246521 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.21 
 
 		 432 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0553  secretion protein HlyD  38.53 
 
 		 450 aa  239  5.999999999999999e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.38 
 
 		 496 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.82 
 
 		 496 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15871  membrane fusion protein  37.9 
 
 		 357 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0747  secretion protein HlyD  37.23 
 
 		 357 aa  160  6e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.554021  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1965  secretion protein HlyD  29.79 
 
 		 388 aa  157  5.0000000000000005e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.455875 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.07 
 
 		 467 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08701  membrane fusion protein  40.37 
 
 		 392 aa  147  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12131  membrane fusion protein  32.53 
 
 		 356 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.502636 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1441  RND family efflux transporter MFP subunit  27.65 
 
 		 634 aa  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.64 
 
 		 500 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13281  membrane fusion protein  34.78 
 
 		 353 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.403546  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1235  secretion protein HlyD  33.91 
 
 		 353 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.681968  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.8 
 
 		 505 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13141  membrane fusion protein  34.35 
 
 		 353 aa  140  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13031  membrane fusion protein  33.79 
 
 		 353 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3725  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.69 
 
 		 516 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.183704 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3671  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.41 
 
 		 516 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.68 
 
 		 448 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  30.05 
 
 		 509 aa  130  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0694  secretion protein HlyD  36.15 
 
 		 417 aa  130  6e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.459164  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4736  secretion protein HlyD  29.89 
 
 		 510 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325985  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  31.74 
 
 		 395 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  31.35 
 
 		 344 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  28.53 
 
 		 329 aa  121  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  29.56 
 
 		 335 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.83 
 
 		 509 aa  120  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  25.18 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  32.29 
 
 		 335 aa  118  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.88 
 
 		 432 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0906  secretion protein HlyD  25.26 
 
 		 449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101628  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  28.35 
 
 		 329 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2093  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  28.77 
 
 		 428 aa  114  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000985853 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  26.68 
 
 		 489 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  28.66 
 
 		 344 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  27.1 
 
 		 345 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2377  RND family efflux transporter MFP subunit  26.57 
 
 		 609 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.40782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2328  secretion protein HlyD  28.22 
 
 		 398 aa  109  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  31.03 
 
 		 333 aa  109  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  28.9 
 
 		 328 aa  109  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  28.9 
 
 		 328 aa  109  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3640  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  30.52 
 
 		 434 aa  108  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.800892  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1544  secretion protein HlyD family protein  28.1 
 
 		 504 aa  107  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  25.16 
 
 		 417 aa  106  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1791  secretion protein HlyD  25.82 
 
 		 402 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  30.17 
 
 		 333 aa  104  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.15 
 
 		 404 aa  104  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  32.96 
 
 		 320 aa  103  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  26.29 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0775  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.7 
 
 		 479 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1719  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.24 
 
 		 517 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0477  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  27.27 
 
 		 405 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  26.04 
 
 		 426 aa  101  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  27.55 
 
 		 368 aa  101  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  25.06 
 
 		 407 aa  101  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.88 
 
 		 428 aa  100  6e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.97 
 
 		 462 aa  100  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  25.29 
 
 		 390 aa  100  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0010  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  27.9 
 
 		 439 aa  100  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.860595 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1469  secretion protein HlyD  26.13 
 
 		 421 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.910926 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.03 
 
 		 407 aa  99.8  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  30.22 
 
 		 354 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  26.74 
 
 		 328 aa  99.8  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3892  secretion protein HlyD family protein  26.21 
 
 		 352 aa  98.6  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2731  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  28.03 
 
 		 607 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  28.54 
 
 		 449 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.19 
 
 		 448 aa  98.6  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  28.25 
 
 		 339 aa  98.2  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02540  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.46 
 
 		 481 aa  98.2  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0229793  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1833  RND family efflux transporter MFP subunit  25.72 
 
 		 464 aa  97.8  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.36059  unclonable  0.000000000906287 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0452  secretion protein HlyD family protein  27.68 
 
 		 375 aa  97.8  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  30.36 
 
 		 345 aa  97.4  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  30.36 
 
 		 345 aa  97.4  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  24.68 
 
 		 403 aa  97.1  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  28 
 
 		 331 aa  96.7  8e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2249  secretion protein HlyD  30.42 
 
 		 399 aa  96.3  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0210413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0102  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.2 
 
 		 465 aa  96.3  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  29.15 
 
 		 359 aa  96.7  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.1 
 
 		 426 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03344  acriflavin resistance protein  25.3 
 
 		 417 aa  96.3  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  28.7 
 
 		 335 aa  95.5  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  28.69 
 
 		 443 aa  95.5  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1759  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.07 
 
 		 457 aa  95.5  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0495  secretion protein HlyD  31.4 
 
 		 323 aa  95.5  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1793  hypothetical protein  27.02 
 
 		 347 aa  95.5  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0463341  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2511  hypothetical protein  30.38 
 
 		 334 aa  95.5  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  24.46 
 
 		 359 aa  95.1  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  27.75 
 
 		 331 aa  94.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  25.52 
 
 		 424 aa  94.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  27.75 
 
 		 331 aa  94.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0259  secretion protein HlyD  23.99 
 
 		 327 aa  94.4  4e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.689376  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  27.75 
 
 		 331 aa  94  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>