126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1140 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1140  permease  100 
 
 
336 aa  651    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3208  permease  64.66 
 
 
350 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.757693  normal  0.643119 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4808  permease  63.99 
 
 
350 aa  416  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1506  permease  61.18 
 
 
343 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1479  permease  61.18 
 
 
343 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0434  hypothetical protein  61.45 
 
 
335 aa  397  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.313959 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3807  permease  59.94 
 
 
362 aa  397  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4946  permease  58.75 
 
 
341 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0263  permease  43.13 
 
 
328 aa  225  9e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0261  permease  42.81 
 
 
328 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4086  permease  46.01 
 
 
325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29321  permease  41.09 
 
 
318 aa  189  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1540  permease  33.95 
 
 
298 aa  179  9e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000982093  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1518  permease  33.53 
 
 
288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2041  hypothetical protein  33.99 
 
 
298 aa  172  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0774693  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1359  permease  40.85 
 
 
323 aa  170  3e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0336  permease  36.71 
 
 
346 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1837  hypothetical protein  30.72 
 
 
371 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.249688  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0729  ABC transporter, permease protein, putative  30.77 
 
 
300 aa  168  1e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3268  hypothetical protein  34.31 
 
 
298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.685443  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2084  hypothetical protein  33.99 
 
 
298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2120  hypothetical protein  33.99 
 
 
298 aa  166  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1904  hypothetical protein  33.99 
 
 
298 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000637927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1867  permease  33.99 
 
 
298 aa  166  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000789875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1857  permease  33.99 
 
 
298 aa  166  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000013234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2051  hypothetical protein  33.99 
 
 
298 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1901  permease  33.99 
 
 
298 aa  166  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00015094  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2152  hypothetical protein  33.99 
 
 
298 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0383281  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3567  hypothetical protein  30.09 
 
 
325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.705614  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1600  permease  39.02 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1632  hypothetical protein  30.07 
 
 
325 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.426451  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1762  hypothetical protein  30.07 
 
 
325 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1812  hypothetical protein  30.07 
 
 
324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1610  permease  30.07 
 
 
324 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1777  hypothetical protein  29.78 
 
 
325 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1694  permease  35.49 
 
 
358 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000186998  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2648  permease  32.02 
 
 
288 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0714  permease  33 
 
 
300 aa  157  3e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.846704  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0044  permease family protein  29.23 
 
 
297 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0584  permease, putative  31.44 
 
 
312 aa  153  2.9999999999999998e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0045  putative permease  28.57 
 
 
297 aa  152  8e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.151776  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0047  permease  32.08 
 
 
524 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898812  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3005  permease  28.85 
 
 
524 aa  140  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1859  permease  32.03 
 
 
342 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3199  permease  30.97 
 
 
370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192294  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1259  permease  32.99 
 
 
334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0187  permease-like protein  33.23 
 
 
343 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2851  permease  33.77 
 
 
352 aa  120  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2656  permease  33.77 
 
 
350 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000475427  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0016  hypothetical protein  28.53 
 
 
364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000539047 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2796  permease  31.33 
 
 
368 aa  113  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250331  normal  0.1662 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1875  hypothetical protein  34.01 
 
 
357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5330  permease  29.59 
 
 
332 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2194  permease  46.23 
 
 
365 aa  89.4  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  25.62 
 
 
363 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  25.08 
 
 
358 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  24.76 
 
 
352 aa  79.3  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  23.88 
 
 
357 aa  79  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  25.39 
 
 
356 aa  75.9  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0014  permease  23.24 
 
 
451 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  25.83 
 
 
402 aa  73.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0298  permease  20 
 
 
423 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1797  permease  24.12 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323943  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0446  permease  21.75 
 
 
433 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.302988 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0757  permease  25.08 
 
 
367 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  25.88 
 
 
620 aa  63.5  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0563  permease  24.04 
 
 
633 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  26.14 
 
 
365 aa  58.2  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1966  hypothetical protein  23.4 
 
 
378 aa  58.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  24.37 
 
 
363 aa  57.4  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  27.74 
 
 
293 aa  57.4  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  21.88 
 
 
296 aa  57  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4253  permease  30.69 
 
 
342 aa  56.6  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.261414  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  21.72 
 
 
315 aa  55.8  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0580  hypothetical protein  28.19 
 
 
475 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0665  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF318 domain protein)  21.21 
 
 
324 aa  52.4  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0434  permease  28.93 
 
 
461 aa  52  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  21.27 
 
 
308 aa  51.2  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0721  permease  26.61 
 
 
302 aa  51.6  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3410  permease  32.94 
 
 
474 aa  50.8  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03565  permease  24.31 
 
 
391 aa  50.8  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4074  putative permease  25.47 
 
 
366 aa  49.3  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  25.71 
 
 
294 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0173  hypothetical protein  21.97 
 
 
300 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.589564  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1645  permease  30.83 
 
 
350 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701842  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  25.11 
 
 
316 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  27.07 
 
 
330 aa  49.3  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  24.61 
 
 
318 aa  48.5  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  20.4 
 
 
319 aa  48.9  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0289  permease  21.97 
 
 
300 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  22.66 
 
 
367 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  22.83 
 
 
335 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2907  hypothetical protein  26.96 
 
 
611 aa  47.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3942  permease  21.97 
 
 
354 aa  47.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3859  permease  31.07 
 
 
300 aa  47.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210987  normal  0.0366228 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  31.52 
 
 
317 aa  46.6  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1783  permease  24.71 
 
 
362 aa  47  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  28.18 
 
 
311 aa  47  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3797  putative permease  22.18 
 
 
333 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.236031 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0397  hypothetical protein  32.91 
 
 
490 aa  46.2  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>