More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1002 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  100 
 
 
932 aa  1911    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  91.4 
 
 
674 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  41.42 
 
 
913 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  45.51 
 
 
1051 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  55.71 
 
 
1183 aa  247  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 
1093 aa  247  9e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 
1093 aa  245  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
991 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  39.51 
 
 
744 aa  237  9e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  41.99 
 
 
912 aa  231  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  39.61 
 
 
790 aa  227  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  51.92 
 
 
585 aa  219  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 
1051 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  35.31 
 
 
783 aa  213  9e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5074  signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 
479 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.473035 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 
488 aa  211  5e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 
681 aa  211  6e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 
1676 aa  208  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 
771 aa  208  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 
551 aa  208  4e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  30.79 
 
 
892 aa  204  7e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 
788 aa  197  6e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 
572 aa  196  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 
1654 aa  193  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  32.1 
 
 
1210 aa  191  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  31.02 
 
 
819 aa  191  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  33.87 
 
 
754 aa  191  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 
839 aa  190  9e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  34.25 
 
 
918 aa  190  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  31.86 
 
 
886 aa  190  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 
815 aa  190  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  43.52 
 
 
964 aa  189  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  33.13 
 
 
1182 aa  188  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  35.73 
 
 
526 aa  187  7e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  33.91 
 
 
1239 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  32.3 
 
 
449 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
547 aa  184  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 
1390 aa  184  9.000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  36.58 
 
 
1253 aa  183  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 
945 aa  182  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  42.67 
 
 
3706 aa  180  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 
872 aa  180  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  29.91 
 
 
657 aa  177  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  43.32 
 
 
1714 aa  175  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6270  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 
952 aa  174  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988146  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 
764 aa  174  5.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 
834 aa  174  7.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  31.39 
 
 
676 aa  174  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
1246 aa  173  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 
657 aa  172  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 
727 aa  173  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  43.84 
 
 
1668 aa  171  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  34.97 
 
 
704 aa  170  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  31.49 
 
 
1248 aa  168  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 
347 aa  168  4e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  43.96 
 
 
613 aa  168  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
1177 aa  168  5e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  28.34 
 
 
682 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.24 
 
 
939 aa  167  8e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 
524 aa  167  8e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  44.12 
 
 
1663 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1219  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  44.5 
 
 
792 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 
382 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  41.44 
 
 
439 aa  166  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  30.43 
 
 
492 aa  166  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2792  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.52 
 
 
930 aa  166  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.111634 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  39.63 
 
 
941 aa  165  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
980 aa  164  7e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  31.35 
 
 
746 aa  164  8.000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  31.46 
 
 
945 aa  160  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  40.48 
 
 
1560 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  41.58 
 
 
2693 aa  158  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  40.19 
 
 
767 aa  156  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 
771 aa  154  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 
215 aa  153  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4302  signal transduction histidine kinase  43.86 
 
 
343 aa  153  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219335  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 
535 aa  153  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  56.3 
 
 
1305 aa  151  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 
1227 aa  150  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  40.29 
 
 
732 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 
532 aa  149  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  30.45 
 
 
936 aa  144  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0368  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.74 
 
 
695 aa  144  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0590374 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 
909 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  30.03 
 
 
1047 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 
878 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4715  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.37 
 
 
1350 aa  142  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726459  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  35.51 
 
 
1289 aa  142  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
1291 aa  141  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
924 aa  140  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.15 
 
 
969 aa  139  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2986  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.96 
 
 
1228 aa  138  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.387618 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0181  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.98 
 
 
837 aa  137  8e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.415169  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  39.63 
 
 
723 aa  137  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 
856 aa  136  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  34 
 
 
800 aa  135  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01755  putative two-component member protein  29.97 
 
 
1111 aa  134  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  40.59 
 
 
782 aa  134  9e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 
832 aa  133  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 
752 aa  133  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0114486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>