More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0993 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0993  DNA polymerase III, delta prime subunit  100 
 
 		 325 aa  646    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.124546  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3025  DNA polymerase III subunit delta'  53.73 
 
 		 317 aa  327  2.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384123  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1565  DNA polymerase III subunit delta'  54.49 
 
 		 320 aa  321  8e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1963  DNA polymerase III subunit delta'  54.04 
 
 		 320 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00141399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1573  DNA polymerase III subunit delta'  52.47 
 
 		 319 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1549  DNA polymerase III subunit delta'  52.47 
 
 		 319 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3164  DNA polymerase III subunit delta'  51.39 
 
 		 318 aa  299  5e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0094  DNA polymerase III subunit delta'  56.65 
 
 		 311 aa  278  6e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26481  DNA polymerase III subunit delta'  44.85 
 
 		 326 aa  246  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.937616 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0313  DNA polymerase III subunit delta'  44.51 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2379  DNA polymerase III subunit delta'  45.82 
 
 		 314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.955046 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02011  DNA polymerase III subunit delta'  37.12 
 
 		 319 aa  222  6e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.847421 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1495  DNA polymerase III subunit delta'  37.12 
 
 		 319 aa  218  7.999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0414246  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01431  DNA polymerase III subunit delta'  34.56 
 
 		 325 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.519241 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5515  DNA polymerase III delta prime subunit  35.71 
 
 		 306 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.279148 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01571  DNA polymerase III subunit delta'  31.38 
 
 		 319 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.499348  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0084  DNA polymerase III subunit delta'  35.05 
 
 		 307 aa  166  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0131  DNA polymerase III subunit delta'  28.34 
 
 		 319 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.363524  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01481  DNA polymerase III subunit delta'  28.03 
 
 		 320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0343458  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01461  DNA polymerase III subunit delta'  27.69 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.18 
 
 		 335 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  34.54 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  30.9 
 
 		 373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000014932 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.07 
 
 		 320 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.6 
 
 		 326 aa  106  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.76 
 
 		 343 aa  105  9e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1360  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.02 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09200  hypothetical protein  31.88 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0621212 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.54 
 
 		 383 aa  104  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1961  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.76 
 
 		 359 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.617101  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.36 
 
 		 331 aa  99.4  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.51 
 
 		 320 aa  99  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.51 
 
 		 320 aa  99  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.17 
 
 		 354 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0379488 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3588  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.56 
 
 		 351 aa  96.7  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0515  DNA-directed DNA polymerase  29.02 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0983279  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.6 
 
 		 324 aa  94  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1702  DNA polymerase III subunit delta'  31.08 
 
 		 374 aa  93.6  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468151  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4573  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.7 
 
 		 395 aa  93.6  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.33 
 
 		 344 aa  93.2  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.95 
 
 		 323 aa  92  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0548  DNA-directed DNA polymerase  31.51 
 
 		 389 aa  92.4  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.713623  normal  0.229669 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.87 
 
 		 358 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  31.2 
 
 		 326 aa  91.7  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.38 
 
 		 329 aa  90.9  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  30.28 
 
 		 389 aa  91.7  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2254  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.26 
 
 		 391 aa  91.3  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0268836  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0042  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.77 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0152578  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.87 
 
 		 318 aa  90.9  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.3 
 
 		 589 aa  90.9  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2074  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.33 
 
 		 648 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0076  ATPase  29.53 
 
 		 429 aa  90.1  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.872704 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0389  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.83 
 
 		 485 aa  90.1  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1351  DNA-directed DNA polymerase  31.63 
 
 		 365 aa  89.7  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.916733  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.98 
 
 		 363 aa  89.4  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0585  DNA polymerase III, gamma and tau subunits, putative  27.4 
 
 		 559 aa  89.4  8e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1386  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.05 
 
 		 550 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  31.1 
 
 		 339 aa  89  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0511  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.81 
 
 		 343 aa  88.6  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1761  DNA polymerase III subunits gamma/tau  32.31 
 
 		 292 aa  89  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.96322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.29 
 
 		 327 aa  89  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3922  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.52 
 
 		 575 aa  88.6  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0150926  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2293  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.69 
 
 		 644 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.566282  normal  0.158563 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2118  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.97 
 
 		 650 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000251378  normal  0.316515 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_524  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  26.94 
 
 		 562 aa  87.8  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.98 
 
 		 363 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1940  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.51 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.792182  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  27.67 
 
 		 320 aa  87.4  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3199  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.02 
 
 		 613 aa  86.7  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000104981  normal  0.61313 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1535  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.33 
 
 		 599 aa  86.3  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0912  DNA polymerase III, tau subunit  30.39 
 
 		 652 aa  86.3  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.850857 
 
 
-
 
NC_002936  DET0535  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.9 
 
 		 339 aa  85.9  8e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0506  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.89 
 
 		 538 aa  85.9  8e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0559  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.94 
 
 		 570 aa  85.9  8e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.42957  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0093  DNA polymerase III subunit delta'  26.94 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1602  DNA-directed DNA polymerase  32.73 
 
 		 388 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.772153 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2135  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.57 
 
 		 737 aa  85.1  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.96 
 
 		 641 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.196255 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18671  DNA polymerase, gamma and tau subunits  29.63 
 
 		 584 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.181287  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0194  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.62 
 
 		 614 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0821  DNA polymerase III subunit delta'  28.19 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.114263  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2608  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.59 
 
 		 610 aa  84  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0026  DNA polymerase III subunit delta'  31.77 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0961  DNA polymerase III subunit delta'  29.91 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.220444  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0993  DNA polymerase III subunit delta'  29.91 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00641  DNA polymerase, gamma and tau subunits  30.93 
 
 		 604 aa  83.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  29.63 
 
 		 586 aa  83.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.28 
 
 		 559 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0028  DNA-directed DNA polymerase  30.28 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0584307 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0058  DNA-directed DNA polymerase  32.61 
 
 		 625 aa  83.2  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.78 
 
 		 427 aa  82.8  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0027  DNA polymerase III subunit delta'  32.99 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0985  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  27.87 
 
 		 382 aa  82.8  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3592  DNA polymerase III subunit delta'  30.28 
 
 		 373 aa  82.8  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.57935 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.12 
 
 		 340 aa  82.4  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0715  DNA-directed DNA polymerase  31.31 
 
 		 389 aa  82.4  0.000000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402884  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17841  DNA polymerase, gamma and tau subunits  29.29 
 
 		 578 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0062  DNA polymerase III, tau subunit  31.49 
 
 		 614 aa  82  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0008  DNA polymerase III gamma-tau subunits  25.17 
 
 		 669 aa  81.6  0.00000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.167579  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0921  DNA polymerase III subunit delta'  30.87 
 
 		 381 aa  82  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>