215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0959 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0959  UspA domain protein  100 
 
 
131 aa  264  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0112634  normal  0.295172 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0087  UspA domain protein  59.29 
 
 
137 aa  160  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.270919 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0090  UspA domain protein  57.86 
 
 
137 aa  158  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4276  UspA domain-containing protein  60 
 
 
135 aa  157  7e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413814  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1585  UspA domain protein  56.93 
 
 
137 aa  154  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0149125 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0771  hypothetical protein  57.78 
 
 
135 aa  152  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.584879  normal  0.0448473 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3375  hypothetical protein  50.74 
 
 
136 aa  137  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1115  hypothetical protein  50.38 
 
 
126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.198517  normal  0.698975 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27981  universal stress protein  46.56 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  31.43 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  30.5 
 
 
143 aa  60.5  0.000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  29.41 
 
 
154 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
128 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  33.56 
 
 
146 aa  57.8  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 
142 aa  57.4  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  35.21 
 
 
156 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  30.63 
 
 
164 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  29.94 
 
 
180 aa  54.3  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0913  UspA domain-containing protein  34.78 
 
 
138 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.455185 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  29.66 
 
 
173 aa  54.3  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 
141 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  30 
 
 
164 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  35 
 
 
153 aa  53.9  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  32.62 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0700  hypothetical protein  31.39 
 
 
306 aa  52.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00113643  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  28.47 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0620  UspA domain-containing protein  26.62 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  30.22 
 
 
140 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  28.57 
 
 
154 aa  52  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  32.14 
 
 
144 aa  51.6  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  28.86 
 
 
157 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  32.85 
 
 
147 aa  51.6  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
138 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  32.33 
 
 
136 aa  52  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16290  universal stress protein UspA-like protein  26.53 
 
 
148 aa  51.2  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000127865  hitchhiker  0.0000372029 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1769  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00594463  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 
145 aa  50.8  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  31.91 
 
 
153 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  32.62 
 
 
153 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  32.62 
 
 
153 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  38.1 
 
 
173 aa  50.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2411  UspA domain protein  29.08 
 
 
146 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000128611  normal  0.369799 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3500  UspA domain protein  45.61 
 
 
283 aa  50.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  29.2 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  34.31 
 
 
300 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  26.52 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4076  UspA domain protein  44.83 
 
 
287 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.686885  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4486  hypothetical protein  48.15 
 
 
306 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  30.94 
 
 
295 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0340  UspA domain protein  27.39 
 
 
160 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2073  UspA domain protein  31.65 
 
 
161 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.338106  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  35.94 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  29.79 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  26.57 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  33.09 
 
 
297 aa  48.5  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  28.26 
 
 
304 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  28.06 
 
 
139 aa  48.1  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  30.77 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 
145 aa  48.9  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0271  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 
250 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00141886  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  25.19 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0473  hypothetical protein  47.37 
 
 
282 aa  48.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.203309  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.01 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  31.85 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0501  UspA domain-containing protein  47.37 
 
 
283 aa  48.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  28.37 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  25.76 
 
 
145 aa  47.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  29.66 
 
 
148 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1861  hypothetical protein  26.92 
 
 
282 aa  47.4  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 
145 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  30.34 
 
 
152 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3141  hypothetical protein  44.44 
 
 
297 aa  47.4  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  30.3 
 
 
290 aa  47.4  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0674  UspA domain-containing protein  29.2 
 
 
143 aa  47  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  25 
 
 
141 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  28.37 
 
 
142 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  24.46 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  27.86 
 
 
140 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  28.26 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  30.3 
 
 
282 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  32.37 
 
 
281 aa  46.2  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2454  UspA domain protein  43.86 
 
 
283 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  28.06 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  31.94 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  29.5 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3655  UspA domain protein  43.86 
 
 
283 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00313868  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0023  universal stress protein  27.54 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2164  UspA domain protein  40.24 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0031  UspA domain protein  27.97 
 
 
163 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.781417  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.99 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>