More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0944 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
290 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal  0.307929 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0563  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  76.6 
 
 
294 aa  408  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.22835  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.72 
 
 
299 aa  221  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0526  ABC-type sugar transport systems permease components-like  43.66 
 
 
293 aa  221  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
306 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.39 
 
 
299 aa  212  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655631 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.38 
 
 
299 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.426381  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4983  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  37.25 
 
 
310 aa  197  1.0000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.62 
 
 
353 aa  197  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.75 
 
 
305 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.3 
 
 
295 aa  194  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000506379  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.52 
 
 
295 aa  194  1e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0077  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.43 
 
 
311 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.22 
 
 
307 aa  193  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  41.22 
 
 
307 aa  193  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.39 
 
 
291 aa  193  3e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0196347  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4638  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.92 
 
 
308 aa  193  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000461706  normal  0.23331 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.52 
 
 
309 aa  192  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.5 
 
 
313 aa  191  9e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.73 
 
 
318 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0625824  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.37 
 
 
297 aa  191  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2365  sugar ABC transporter, permease protein  36.97 
 
 
288 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7347  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  40.41 
 
 
320 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1051  lactose transport system permease protein  37.76 
 
 
306 aa  191  2e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.390377  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.16 
 
 
311 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.14 
 
 
317 aa  189  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.38 
 
 
309 aa  189  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.59 
 
 
300 aa  189  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1449  lactose transport system permease protein  39.07 
 
 
290 aa  189  5.999999999999999e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0650773 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1942  sugar ABC transporter, permease protein  43.61 
 
 
287 aa  188  9e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.07 
 
 
293 aa  188  9e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.563461  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2587  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.98 
 
 
314 aa  187  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000137508  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03080  permease component of ABC-type sugar transporter  41.75 
 
 
322 aa  187  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.72 
 
 
294 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.72 
 
 
294 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.200183 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 
318 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949955  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.63 
 
 
352 aa  186  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.86 
 
 
279 aa  185  9e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.983189  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00881  ABC transporter sugar permease  40.97 
 
 
294 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0244413  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1606  ABC transporter sugar permease  40.71 
 
 
293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.77 
 
 
293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.990678  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6155  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.02 
 
 
314 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.602871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6903  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.28 
 
 
324 aa  182  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156181  normal  0.0141251 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.49 
 
 
306 aa  182  6e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.72 
 
 
310 aa  182  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.79 
 
 
320 aa  182  7e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0230008  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3147  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.48 
 
 
319 aa  181  9.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00382098  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.72 
 
 
298 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15561  putative lactose transporter  43.29 
 
 
302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.334934 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1315  ABC transporter, permease protein  37.86 
 
 
301 aa  179  4e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2918  ABC-type sugar transport system, permease component  38.91 
 
 
305 aa  179  5.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.7 
 
 
316 aa  178  8e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0204  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.14 
 
 
299 aa  178  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.169553 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 
296 aa  178  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000283647  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1775  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.83 
 
 
309 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.114297  normal  0.0929805 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.71 
 
 
308 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172129  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.74 
 
 
292 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12077  sugar ABC transporter membrane protein  39.07 
 
 
300 aa  177  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.6 
 
 
311 aa  177  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17058  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.7 
 
 
313 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000239391  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 
316 aa  177  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.130846  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 
310 aa  176  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.155614  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2847  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 
305 aa  176  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.661532 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0737  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
293 aa  176  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.27 
 
 
313 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00226923  hitchhiker  0.00373728 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2523  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.38 
 
 
309 aa  176  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325465  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.79 
 
 
334 aa  176  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.17709  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21160  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.17 
 
 
314 aa  176  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103465  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.56 
 
 
312 aa  176  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.24 
 
 
293 aa  176  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0462  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.7 
 
 
301 aa  176  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0599651  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.09 
 
 
318 aa  176  6e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 
420 aa  175  6e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
310 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.114113  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.68 
 
 
310 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181942  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.16 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.01 
 
 
294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.692762  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0339  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.76 
 
 
420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37 
 
 
317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0647  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.56 
 
 
325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.27 
 
 
294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1290  ABC transporter, permease protein  38.15 
 
 
311 aa  172  5.999999999999999e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1549  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  37.58 
 
 
317 aa  172  7.999999999999999e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.649517  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.22 
 
 
305 aa  171  9e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00457854  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
318 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.18 
 
 
315 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0308401  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.03 
 
 
310 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2863  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.55 
 
 
356 aa  171  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.45 
 
 
304 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0461  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.84 
 
 
301 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0667876 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.59 
 
 
308 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84186  normal  0.48209 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1523  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.21 
 
 
321 aa  169  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2545  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.54 
 
 
316 aa  170  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.637107  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.85 
 
 
306 aa  169  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0924232  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3596  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.74 
 
 
325 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295531  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.31 
 
 
316 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.922708  normal  0.915782 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.53 
 
 
303 aa  169  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.013229  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1182  sugar ABC transporter, permease protein, putative  38.13 
 
 
319 aa  168  9e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.547049  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.63 
 
 
314 aa  168  9e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>