More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0936 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0936  general secretion pathway protein  100 
 
 
155 aa  315  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  48.91 
 
 
176 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  48.91 
 
 
176 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  33.9 
 
 
176 aa  89.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  33.55 
 
 
187 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0937  type 4 prepilin-like protein  45 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  40 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  40 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0938  type 4 prepilin-like protein  43.33 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.141756  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0263  pilin polypeptide  41.25 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.62 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4969  general secretion pathway protein H  31.48 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.25 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.32 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2564  hypothetical protein  36.36 
 
 
177 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569226 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  30.83 
 
 
172 aa  63.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.86 
 
 
161 aa  62.4  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3168  prepilin-type cleavage/methylation  30.5 
 
 
130 aa  62  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.27 
 
 
154 aa  61.6  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  37.66 
 
 
155 aa  61.6  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3549  type 4 prepilin-like protein  35.23 
 
 
177 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  34.94 
 
 
145 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  34.94 
 
 
145 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  34.94 
 
 
145 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.85 
 
 
172 aa  60.8  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0049  pilin polypeptide PilA-like  41.67 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0965276  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40 
 
 
165 aa  61.2  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  27.78 
 
 
167 aa  60.5  0.000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.73 
 
 
165 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4066  general secretion pathway protein H  39.13 
 
 
179 aa  58.9  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0048  pilin polypeptide PilA-like  41.67 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.335089  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.36 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  37.66 
 
 
150 aa  59.7  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  39.76 
 
 
163 aa  58.5  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  40.91 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.66 
 
 
168 aa  58.9  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.88 
 
 
175 aa  58.2  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.99 
 
 
169 aa  58.2  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  34.33 
 
 
156 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  33.71 
 
 
155 aa  57.8  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  40 
 
 
158 aa  57.4  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.36 
 
 
171 aa  57.4  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4063  general secretion pathway protein H  37.5 
 
 
75 aa  56.6  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.49 
 
 
170 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  29.76 
 
 
158 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  37.29 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  37.29 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  34.29 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1432  type II secretion systen protein G  30.95 
 
 
209 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  35.71 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2590  general secretion pathway protein G  34.57 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.5 
 
 
163 aa  55.5  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  36.49 
 
 
168 aa  56.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  29.27 
 
 
182 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.47 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.78 
 
 
161 aa  55.1  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  37.29 
 
 
154 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  40.68 
 
 
142 aa  55.5  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  37.36 
 
 
133 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  30.65 
 
 
146 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  32.81 
 
 
163 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  35.71 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.21 
 
 
157 aa  55.1  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  38.33 
 
 
159 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  35.71 
 
 
151 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  35.71 
 
 
151 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  35.71 
 
 
151 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  30.56 
 
 
146 aa  54.7  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  35.71 
 
 
151 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  35.71 
 
 
151 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  35.59 
 
 
150 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  39.66 
 
 
149 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  35.59 
 
 
150 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  35.59 
 
 
150 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  30 
 
 
146 aa  54.3  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  35.59 
 
 
150 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  35.59 
 
 
150 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  40 
 
 
168 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  35.59 
 
 
150 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  35.59 
 
 
150 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  36.21 
 
 
156 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  35.59 
 
 
154 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  37.29 
 
 
150 aa  53.9  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  40.68 
 
 
142 aa  53.9  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
150 aa  53.9  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  36.67 
 
 
166 aa  53.9  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.11 
 
 
163 aa  53.9  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  37.1 
 
 
144 aa  53.9  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  33.82 
 
 
149 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1032  general secretion pathway protein G  36.21 
 
 
153 aa  53.5  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.71 
 
 
193 aa  53.9  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  33.82 
 
 
149 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0224  general secretion pathway protein G  36.21 
 
 
150 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2666  general secretion pathway protein G  36.21 
 
 
150 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0011  general secretion pathway protein G  36.21 
 
 
150 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0012  general secretion pathway protein G  36.21 
 
 
150 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127302  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0012  general secretion pathway protein G  36.21 
 
 
150 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  28.43 
 
 
175 aa  53.5  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3514  general secretion pathway protein G  36.21 
 
 
150 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>