More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0888 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1446  sodium/hydrogen exchanger  63.8 
 
 
641 aa  716  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2740  Sodium/hydrogen exchanger  61.16 
 
 
629 aa  698  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0956  sodium/hydrogen exchanger  60.17 
 
 
639 aa  681  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3229  sodium/hydrogen exchanger  63.64 
 
 
652 aa  726  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0888  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
628 aa  1235  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.043911 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0859  sodium/hydrogen exchanger  64.3 
 
 
640 aa  722  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2891  sodium/hydrogen exchanger  63.64 
 
 
652 aa  725  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2394  Na+/H+ antiporter  61.52 
 
 
593 aa  406  1e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00954713  hitchhiker  0.00302602 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2292  sodium/hydrogen exchanger  36.02 
 
 
637 aa  328  2e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.042334  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4478  sodium/hydrogen exchanger  38.43 
 
 
602 aa  296  8e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5185  sodium/hydrogen exchanger  43.01 
 
 
660 aa  292  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1380  putative sodium/hydrogen antiporter  39.14 
 
 
611 aa  285  1e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00463957  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16030  putative sodium/hydrogen antiporter  38.95 
 
 
611 aa  285  1e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4152  sodium/hydrogen exchanger  38.34 
 
 
608 aa  285  2e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.561792 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0220  hypothetical protein  35.09 
 
 
598 aa  280  5e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1072  sodium/hydrogen exchanger  37.04 
 
 
601 aa  277  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.558941  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0511  sodium/hydrogen exchanger  35.17 
 
 
622 aa  276  6e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1024  Sodium/hydrogen exchanger  39.57 
 
 
602 aa  276  1e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30796  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1467  sodium/hydrogen exchanger  38.18 
 
 
601 aa  270  5e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4254  sodium/hydrogen exchanger  38.18 
 
 
601 aa  270  8e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  32.7 
 
 
610 aa  268  2e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000727  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  36.76 
 
 
599 aa  268  3e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  32.29 
 
 
612 aa  268  3e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1871  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.24 
 
 
666 aa  267  5e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1211  Sodium/hydrogen exchanger  35.67 
 
 
611 aa  266  7e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04922  Na+/K+/H+ antiporter  36.07 
 
 
597 aa  266  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0146  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  33.85 
 
 
763 aa  263  9e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269507 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03225  Na(+):H(+) antiporter, CPA1 family protein  35.85 
 
 
625 aa  262  1e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0127  sodium/hydrogen exchanger  32.24 
 
 
760 aa  261  2e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.302904  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0156  sodium/hydrogen exchanger  33.68 
 
 
764 aa  259  8e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00461  Na+/H+ antiporter  36.1 
 
 
569 aa  259  9e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2605  sodium/hydrogen exchanger  36.53 
 
 
637 aa  258  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00858761  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3909  Na+/H+ antiporter  33.66 
 
 
607 aa  257  5e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0707  sodium/hydrogen exchanger  36.52 
 
 
651 aa  255  2e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0472  CPA1 family Na+/H+ antiporter  42.09 
 
 
399 aa  253  9e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0494569  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0850  sodium/hydrogen exchanger  32.23 
 
 
617 aa  252  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1982  sodium/hydrogen exchanger  34.86 
 
 
619 aa  252  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05361  CPA1 family Na+/H+ antiporter  42.09 
 
 
399 aa  251  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  34.2 
 
 
741 aa  247  4e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04971  CPA1 family Na+/H+ antiporter  43.37 
 
 
401 aa  242  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05271  CPA1 family Na+/H+ antiporter  43.37 
 
 
401 aa  240  5e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0377759  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2318  sodium/hydrogen exchanger  32.99 
 
 
599 aa  240  5e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0395796  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0477  sodium/hydrogen exchanger  36.81 
 
 
616 aa  239  9e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0802705  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  37.08 
 
 
620 aa  239  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0521  Sodium/hydrogen exchanger  32.05 
 
 
604 aa  239  1e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2224  sodium/hydrogen exchanger  36.02 
 
 
673 aa  239  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00760493  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2324  sodium/hydrogen exchanger  33.28 
 
 
670 aa  238  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.339898  normal  0.580137 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2147  sodium/hydrogen exchanger  36.04 
 
 
670 aa  239  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251145  normal  0.368531 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2400  sodium/hydrogen exchanger  33.64 
 
 
625 aa  237  4e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.30765e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  29.42 
 
 
617 aa  237  5e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2321  sodium/hydrogen exchanger  36.83 
 
 
660 aa  237  6e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.545125  hitchhiker  0.000203679 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2537  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.32 
 
 
669 aa  237  6e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2065  sodium/hydrogen exchanger  36.83 
 
 
660 aa  236  8e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  5.62767e-05  hitchhiker  0.000963897 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2017  sodium/hydrogen exchanger  36.83 
 
 
660 aa  236  8e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  1.55921e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2308  sodium/hydrogen exchanger  36.83 
 
 
660 aa  236  1e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2109  sodium/hydrogen exchanger  36.56 
 
 
643 aa  233  8e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1861  sodium/hydrogen exchanger  37.85 
 
 
719 aa  228  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.182882  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1998  sodium/hydrogen exchanger  35.01 
 
 
616 aa  226  8e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.12153e-05 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  30.16 
 
 
617 aa  225  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06781  putative Na+/H+ antiporter, CPA1 family  41.05 
 
 
421 aa  223  7e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0424  sodium/hydrogen exchanger  35 
 
 
852 aa  221  2e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4654  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.19 
 
 
596 aa  220  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4781  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.19 
 
 
596 aa  220  5e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4275  Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)  31.19 
 
 
596 aa  220  6e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.19 
 
 
596 aa  220  6e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4436  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.19 
 
 
596 aa  219  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  5.477e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4667  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.19 
 
 
596 aa  219  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1732  sodium/hydrogen exchanger  37.58 
 
 
702 aa  219  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4369  sodium/hydrogen exchanger  30.99 
 
 
596 aa  216  7e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  32.63 
 
 
626 aa  216  8e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2869  sodium/hydrogen exchanger  32.18 
 
 
623 aa  216  9e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.824474  normal  0.920346 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0042  sodium/hydrogen exchanger  32.52 
 
 
607 aa  214  4e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126585  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0868  Na(+):H(+) antiporter  30.51 
 
 
606 aa  214  4e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0759  sodium/hydrogen exchanger  34.23 
 
 
584 aa  209  9e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135673  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05281  CPA1 family Na+/H+ antiporter  40.72 
 
 
414 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0626531  normal  0.0646135 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04731  CPA1 family Na+/H+ antiporter  40.22 
 
 
402 aa  208  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.281963  normal  0.831051 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1805  CPA1 family Na+/H+ antiporter  40.72 
 
 
414 aa  207  4e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1720  CPA1 family Na+/H+ antiporter  41.79 
 
 
414 aa  206  9e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  32.72 
 
 
628 aa  203  9e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  29.85 
 
 
630 aa  202  1e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4282  sodium/hydrogen exchanger  33.86 
 
 
609 aa  192  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2077  Na+/H+ antiporter, putative  28.66 
 
 
595 aa  180  6e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0640  CPA1 family Na+/H+ antiporter  40.78 
 
 
421 aa  180  6e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19170  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  28.8 
 
 
640 aa  159  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.490991  normal  0.0684118 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3821  sodium/hydrogen exchanger  34.02 
 
 
407 aa  132  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  28.32 
 
 
597 aa  121  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  29.67 
 
 
598 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0298  potassium/proton antiporter  29.19 
 
 
505 aa  102  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12158  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  27.76 
 
 
596 aa  97.8  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2667  sodium/hydrogen exchanger  28.37 
 
 
767 aa  97.4  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  27.94 
 
 
597 aa  95.1  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  23.6 
 
 
498 aa  94.4  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1831  sodium/hydrogen exchanger  30.95 
 
 
598 aa  94  8e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205605 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5023  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.77 
 
 
598 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0502  potassium/proton antiporter  25.77 
 
 
580 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3692  potassium/proton antiporter  30.02 
 
 
500 aa  90.9  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000164721  normal  0.675965 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  26.54 
 
 
572 aa  88.6  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1109  sodium/hydrogen exchanger  25.19 
 
 
402 aa  88.2  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1985  sodium/hydrogen exchanger  29.55 
 
 
406 aa  87.8  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3583  sodium/hydrogen exchanger  24.55 
 
 
402 aa  87.8  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>