More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0844 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0844  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
183 aa  358  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0364273 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3261  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  55.42 
 
 
226 aa  173  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2860  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  55.42 
 
 
226 aa  173  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070189  hitchhiker  0.000343254 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2012  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  54.67 
 
 
219 aa  165  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4449  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.38 
 
 
207 aa  164  9e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2615  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.95 
 
 
218 aa  158  4e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.2 
 
 
217 aa  155  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2428  biopolymer transport ExbD like protein  47.92 
 
 
148 aa  137  7e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.303812 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3106  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.38 
 
 
133 aa  91.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0993721  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3016  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.38 
 
 
133 aa  91.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2305  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.84 
 
 
134 aa  88.2  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2392  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.71 
 
 
133 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.791616 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3007  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.36 
 
 
143 aa  84.3  9e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2417  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
133 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.978308  normal  0.103563 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0487  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.97 
 
 
137 aa  77.4  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.181601  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  31.5 
 
 
139 aa  72  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  31.5 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  26.92 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  30.3 
 
 
139 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.07 
 
 
138 aa  67.4  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.73754  normal  0.0224033 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.3 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.15 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0846  ExbD2-like biopolymer transport protein  28.35 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.424366  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03432  Biopolymer transport protein  26.15 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0358  biopolymer ExbD/TolR family transporter  32.06 
 
 
135 aa  63.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0309097 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2346  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.33 
 
 
145 aa  63.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0853163  normal  0.0509628 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30 
 
 
166 aa  64.3  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1190  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.23 
 
 
137 aa  63.2  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.693897  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3345  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.23 
 
 
134 aa  62.4  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2614  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.1 
 
 
132 aa  62.8  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3004  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  28.1 
 
 
132 aa  62.8  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2987  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.4 
 
 
133 aa  62  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.369399  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0912  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.69 
 
 
132 aa  62  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0769  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  28.69 
 
 
132 aa  62  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02686  Biopolymer transport protein  28.46 
 
 
139 aa  62  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00153637  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3869  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.42 
 
 
136 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000845  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.24 
 
 
134 aa  61.2  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3753  biopolymer transport exbD protein  22.03 
 
 
133 aa  60.8  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.677985  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1151  TonB system transport protein ExbD2  25.6 
 
 
134 aa  60.5  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0863  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.13 
 
 
138 aa  60.1  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0638904  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.91 
 
 
148 aa  59.3  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2345  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.01 
 
 
146 aa  59.3  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.231311  normal  0.0225242 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02811  Biopolymer transport protein  20.8 
 
 
132 aa  59.3  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0477065  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06757  hypothetical protein  24.26 
 
 
134 aa  58.9  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11800  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.17 
 
 
133 aa  58.2  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4210  TonB system transport protein ExbD type-1  33.33 
 
 
142 aa  58.2  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1512  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.15 
 
 
133 aa  57.8  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.37 
 
 
145 aa  57.8  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0592  biopolymer transport protein ExbD  31.88 
 
 
143 aa  57  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.23 
 
 
140 aa  57  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.83 
 
 
143 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523101  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0267  biopolymer transport protein ExbD  31.88 
 
 
143 aa  57  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.134786  normal  0.162508 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00634  biopolymer transport protein  21.77 
 
 
135 aa  56.6  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.52 
 
 
148 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.492419 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0673  biopolymer transport protein ExbD  31.88 
 
 
143 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.717059  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0902  TonB system transport protein ExbD3  23.14 
 
 
134 aa  56.6  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3325  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.63 
 
 
137 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.110206  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2367  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.84 
 
 
162 aa  56.6  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3472  protein TolR  30.61 
 
 
137 aa  56.6  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0578496  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  29.17 
 
 
147 aa  56.2  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0920  putative polysaccharide deacetylase  28.68 
 
 
132 aa  55.5  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0743675  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0170  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.2 
 
 
151 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1238  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.93 
 
 
137 aa  55.1  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0653  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.2 
 
 
151 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1369  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.93 
 
 
133 aa  55.5  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0114  TonB system transport protein ExbD2  21.77 
 
 
134 aa  55.1  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2569  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.07 
 
 
134 aa  55.1  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1088  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.06 
 
 
136 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00516772  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2589  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.33 
 
 
158 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382062  hitchhiker  0.000000237185 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0548  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.2 
 
 
151 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2237  biopolymer ExbD/TolR family transporter  28.47 
 
 
134 aa  54.3  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271991  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0234  TonB system transport protein ExbD  29.63 
 
 
177 aa  54.3  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3720  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.75 
 
 
139 aa  54.7  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334783  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2269  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  27.2 
 
 
133 aa  54.3  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.309606  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.78 
 
 
149 aa  54.3  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1916  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.2 
 
 
133 aa  54.3  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1230  biopolymer ExbD/TolR family transporter  32.77 
 
 
176 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1729  tolR protein  28.57 
 
 
141 aa  53.9  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2641  biopolymer ExbD/TolR family transporter  32.77 
 
 
176 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2454  biopolymer ExbD/TolR family transporter  32.77 
 
 
176 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  29.66 
 
 
146 aa  53.9  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3453  biopolymer ExbD/TolR family transporter  32.77 
 
 
176 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0564  protein TolR  26.92 
 
 
150 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.434395  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3739  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.220249 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.32 
 
 
143 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113024 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.57 
 
 
138 aa  53.9  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0898  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.53 
 
 
132 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250835  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0371  biopolymer ExbD/TolR family transporter  32.77 
 
 
176 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1573  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.01 
 
 
139 aa  53.9  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.320463 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3341  biopolymer transport protein ExbD  27.41 
 
 
141 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1210  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.6 
 
 
178 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0574  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.2 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.340528 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.13 
 
 
154 aa  53.5  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4593  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.14 
 
 
132 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2941  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.72 
 
 
140 aa  53.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000159512  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.48 
 
 
140 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.54 
 
 
137 aa  53.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1201  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.69 
 
 
131 aa  52.4  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102813 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.38 
 
 
155 aa  52.4  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2221  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.08 
 
 
134 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109447  normal  0.312711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>