More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0832 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_19381  Fe-S oxidoreductase  64.76 
 
 
537 aa  721    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1063  Fe-S oxidoreductase  65.35 
 
 
537 aa  721    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.297828  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1258  radical SAM family protein  80.89 
 
 
529 aa  897    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2963  Radical SAM domain protein  76.82 
 
 
522 aa  877    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16191  Fe-S oxidoreductase  66.6 
 
 
544 aa  736    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.468335  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2035  Elongator protein 3/MiaB/NifB  68.99 
 
 
518 aa  749    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16891  Fe-S oxidoreductase  60.93 
 
 
539 aa  688    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.779533  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0308  Elongator protein 3/MiaB/NifB  68.65 
 
 
529 aa  758    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2065  Radical SAM domain protein  79.17 
 
 
530 aa  898    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1590  Fe-S oxidoreductase  61.51 
 
 
539 aa  690    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00141696  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0799  Elongator protein 3  77.59 
 
 
526 aa  862    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17011  Fe-S oxidoreductase  61.32 
 
 
539 aa  689    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0832  Radical SAM domain protein  100 
 
 
527 aa  1090    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23771  Fe-S oxidoreductase  67.56 
 
 
538 aa  736    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0282707 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16781  Fe-S oxidoreductase  61.36 
 
 
539 aa  690    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0679  radical SAM domain-containing protein  79.53 
 
 
532 aa  878    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.538704  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2089  Radical SAM domain protein  80.08 
 
 
530 aa  897    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.670556 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0238  radical SAM domain-containing protein  31.11 
 
 
461 aa  125  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140637  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1693  radical SAM family protein  26.01 
 
 
467 aa  107  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2195  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 
460 aa  103  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.565929  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3608  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 
459 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  25.52 
 
 
520 aa  92.8  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2523  Radical SAM domain protein  25.09 
 
 
424 aa  89  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0388324 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3090  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  24.92 
 
 
476 aa  87.4  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000038537  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1699  Radical SAM domain protein  25 
 
 
424 aa  87  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000206113  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0820  Radical SAM domain protein  31.46 
 
 
583 aa  84.3  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0920  radical SAM domain-containing protein  26.01 
 
 
451 aa  82.4  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2577  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  26.64 
 
 
674 aa  81.6  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.451691  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  25.4 
 
 
459 aa  81.3  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1016  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester oxidative cyclase  27.62 
 
 
584 aa  80.1  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2351  Radical SAM domain protein  22.67 
 
 
426 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4225  radical SAM domain-containing protein  29.21 
 
 
576 aa  79.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0454  radical SAM domain-containing protein  29.21 
 
 
576 aa  79.3  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2963  radical SAM domain-containing protein  23.25 
 
 
476 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000286011  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2283  Radical SAM domain protein  25.89 
 
 
473 aa  76.3  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.257116  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2416  radical SAM family protein  25.08 
 
 
475 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000137144  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  22.92 
 
 
529 aa  73.6  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3569  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.4 
 
 
478 aa  73.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.663184 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  26.07 
 
 
472 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1150  oxidative cyclase-related protein  24.42 
 
 
475 aa  72  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  22.78 
 
 
459 aa  72  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0909  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  23.96 
 
 
681 aa  72.8  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0840  cobalamin B12-binding domain protein  24.64 
 
 
590 aa  72  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2825  radical SAM domain-containing protein  22.22 
 
 
476 aa  71.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000393045  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1735  cobalamin B12-binding domain protein  25.82 
 
 
590 aa  71.2  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2566  radical SAM domain-containing protein  23.5 
 
 
426 aa  70.9  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.162584  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2473  radical SAM domain-containing protein  23.76 
 
 
468 aa  70.1  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0785227  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1038  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  26.09 
 
 
479 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3415  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  27.56 
 
 
472 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1590  Radical SAM domain protein  25.2 
 
 
488 aa  70.1  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3553  Radical SAM domain protein  25.16 
 
 
474 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4964  radical SAM family protein  22.97 
 
 
476 aa  70.1  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.576294  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1009  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  26.09 
 
 
479 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0710  radical SAM domain-containing protein  25.59 
 
 
516 aa  69.7  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4199  cobalamin B12-binding:radical SAM family protein  24.73 
 
 
548 aa  69.3  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.122489 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0797  Radical SAM domain protein  28.02 
 
 
489 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  27.05 
 
 
450 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  23.88 
 
 
441 aa  68.6  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3382  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  24.08 
 
 
473 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0878  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  23.75 
 
 
473 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.858521  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0042  radical SAM family protein  23.55 
 
 
502 aa  67.8  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1125  Fe-S oxidoreductase  22.13 
 
 
555 aa  67.4  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0762  Fe-S oxidoreductase  25.09 
 
 
484 aa  67.4  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151938  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 
441 aa  67.4  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1034  radical SAM domain-containing protein  25.65 
 
 
393 aa  67  0.0000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.851598  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2424  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  25.18 
 
 
551 aa  67  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3186  radical SAM family protein  24.91 
 
 
583 aa  66.6  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
1250 aa  66.6  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2171  Radical SAM domain protein  25.76 
 
 
509 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2185  Radical SAM domain protein  24.47 
 
 
473 aa  65.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000424629  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0233  Radical SAM domain protein  23.65 
 
 
723 aa  65.5  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.677011 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0143  cobalamin B12-binding domain-containing protein  23.3 
 
 
583 aa  65.1  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0605658  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1626  Radical SAM domain protein  22.49 
 
 
444 aa  64.7  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3195  Radical SAM domain protein  22.81 
 
 
552 aa  64.7  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00554212 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3593  radical SAM domain-containing protein  24.57 
 
 
472 aa  64.3  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000974767  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4478  radical SAM family protein  26.12 
 
 
554 aa  64.3  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.140837  normal  0.22726 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0154  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.6 
 
 
479 aa  63.9  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000374319  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3504  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  23.24 
 
 
677 aa  63.9  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1927  cobalamin B12-binding domain protein  33.59 
 
 
288 aa  63.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.2434  normal  0.204325 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4901  radical SAM family protein  25.57 
 
 
474 aa  63.9  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.413487  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2273  radical SAM domain-containing protein  26.4 
 
 
498 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2171  radical SAM domain-containing protein  26.96 
 
 
512 aa  62.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2929  radical SAM domain-containing protein  27.87 
 
 
497 aa  63.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43282  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1836  radical SAM domain-containing protein  24.8 
 
 
474 aa  63.2  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4087  radical SAM domain-containing protein  28.17 
 
 
458 aa  63.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1750  radical SAM domain-containing protein  25.28 
 
 
473 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.499976  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0577  radical SAM domain-containing protein  25.28 
 
 
473 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2852  radical SAM domain-containing protein  25.28 
 
 
481 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2859  Fe-S oxidoreductase  25.28 
 
 
473 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0376  radical SAM domain-containing protein  23.74 
 
 
433 aa  62.4  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 
471 aa  62.4  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2796  radical SAM domain-containing protein  25.28 
 
 
481 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0536346  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1767  radical SAM domain-containing protein  25.28 
 
 
503 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580532  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  24.23 
 
 
398 aa  62.8  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2737  radical SAM domain-containing protein  25.28 
 
 
481 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3233  radical SAM domain-containing protein  27.14 
 
 
531 aa  62  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1487  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  22.73 
 
 
567 aa  62  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0100  radical SAM domain-containing protein  24.08 
 
 
705 aa  62  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0253265  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  25.76 
 
 
461 aa  62  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2319  radical SAM family Fe-S protein  25.7 
 
 
501 aa  62  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518236  normal  0.0137531 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>