More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0788 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4753  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.09 
 
 		 630 aa  660    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0788  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 634 aa  1294    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  56.89 
 
 		 714 aa  610  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.756709  normal  0.201817 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  57.54 
 
 		 759 aa  606  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  55.66 
 
 		 1122 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  54.76 
 
 		 1418 aa  569  1e-161  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  55.05 
 
 		 576 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.413012  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0674  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.6 
 
 		 1021 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0320  multi-sensor hybrid histidine kinase  54.44 
 
 		 838 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2234  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.07 
 
 		 935 aa  539  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.57 
 
 		 1432 aa  538  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.24 
 
 		 1344 aa  533  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  53.57 
 
 		 1081 aa  529  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2408  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.83 
 
 		 647 aa  521  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385618  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2693  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.6 
 
 		 873 aa  521  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2816  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.17 
 
 		 682 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0864703 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3457  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.1 
 
 		 1070 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2659  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.3 
 
 		 1070 aa  498  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.337944  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0435  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.37 
 
 		 703 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.9 
 
 		 654 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.56 
 
 		 1428 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1127  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  43.76 
 
 		 989 aa  437  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476664 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3071  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.5 
 
 		 1222 aa  428  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997499 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0945  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.27 
 
 		 926 aa  407  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0933  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.74 
 
 		 760 aa  395  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3560  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.14 
 
 		 712 aa  385  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4428  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.35 
 
 		 622 aa  292  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.724504 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 		 822 aa  291  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.88 
 
 		 650 aa  290  4e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.21 
 
 		 859 aa  277  5e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.89 
 
 		 853 aa  273  6e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2358  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.61 
 
 		 916 aa  270  7e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 		 1260 aa  268  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.49 
 
 		 637 aa  265  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0463  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 		 642 aa  266  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 		 1260 aa  265  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.21 
 
 		 796 aa  265  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.94 
 
 		 557 aa  263  6e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.42 
 
 		 639 aa  263  8e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.5 
 
 		 1076 aa  263  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2264  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.8 
 
 		 692 aa  262  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.09 
 
 		 983 aa  261  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 		 845 aa  261  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.12 
 
 		 874 aa  260  4e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0139218  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1414  sensory box histidine kinase/response regulator  33.33 
 
 		 844 aa  260  6e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 		 897 aa  259  9e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.09 
 
 		 796 aa  259  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1952  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.84 
 
 		 692 aa  259  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5491  cell cycle control histidine kinase CckA  36.94 
 
 		 892 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.57 
 
 		 673 aa  258  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 		 1113 aa  258  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1039  sensory box histidine kinase/response regulator  35.18 
 
 		 945 aa  257  4e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2463  two component sensor kinase  36.19 
 
 		 872 aa  257  5e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.899501  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.18 
 
 		 743 aa  256  9e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.02 
 
 		 673 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4134  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.98 
 
 		 711 aa  256  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.734876  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4271  histidine kinase  31.61 
 
 		 525 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.52 
 
 		 845 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1524  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 		 853 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.334346 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2943  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 		 981 aa  255  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.19 
 
 		 677 aa  254  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.61 
 
 		 1132 aa  254  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.94 
 
 		 641 aa  254  3e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1004  sensory box histidine kinase/response regulator  34.94 
 
 		 945 aa  254  4.0000000000000004e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.22 
 
 		 661 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 		 1079 aa  253  6e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 		 867 aa  253  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.126106 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2124  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 		 857 aa  252  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104313  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.51 
 
 		 1322 aa  252  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 		 769 aa  251  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1398  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 		 853 aa  252  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2401  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 991 aa  252  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2707  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.95 
 
 		 776 aa  251  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.65 
 
 		 819 aa  251  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.12 
 
 		 645 aa  251  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0685  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.7 
 
 		 770 aa  251  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000495863 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2173  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.38 
 
 		 867 aa  251  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00129243  normal  0.0294734 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2089  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.63 
 
 		 802 aa  250  5e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0236176  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4635  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.08 
 
 		 857 aa  250  6e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576155  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0936  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.87 
 
 		 803 aa  250  7e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0173561 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.68 
 
 		 1108 aa  250  7e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.19 
 
 		 1279 aa  249  8e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4405  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.77 
 
 		 880 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0198095  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3256  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 		 802 aa  249  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0454  multisensor hybrid histidine kinase  34.9 
 
 		 766 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2107  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.9 
 
 		 770 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0284  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.69 
 
 		 1105 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0846765 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.84 
 
 		 817 aa  248  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0672  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.32 
 
 		 770 aa  248  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1138  Signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 888 aa  247  4e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.408537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0545  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.7 
 
 		 1053 aa  247  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0920041 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  32.61 
 
 		 1112 aa  246  8e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.74 
 
 		 962 aa  246  9e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  31.8 
 
 		 812 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1740  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  34.22 
 
 		 866 aa  245  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223971  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1525  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.03 
 
 		 872 aa  246  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 		 1106 aa  244  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1984  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.2 
 
 		 752 aa  244  3e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0542  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.94 
 
 		 1050 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.757487  normal  0.763027 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1723  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.32 
 
 		 664 aa  244  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>