More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0721 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0721  aminotransferase class V  100 
 
 		 389 aa  796    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2941  aminotransferase class V  56.12 
 
 		 384 aa  448  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01753  putative isopenicillin N epimerase protein  46.23 
 
 		 419 aa  348  1e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73332  normal  0.379334 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2502  aminotransferase class V  43.41 
 
 		 399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1746  aminotransferase class V  43.88 
 
 		 407 aa  296  3e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.676598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3584  aminotransferase class V  40.98 
 
 		 388 aa  288  8e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1377  aminotransferase, class V  41.34 
 
 		 390 aa  281  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1215  selenocysteine lyase  38.76 
 
 		 385 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00299865  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1739  putative isopenicillin N epimerase  38.5 
 
 		 385 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0692  putative isopenicillin N epimerase  38.5 
 
 		 385 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1140  isopenicillin N epimerase  38.5 
 
 		 385 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0775  putative isopenicillin N epimerase  38.5 
 
 		 464 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2417  putative aminotransferase class-V  38.24 
 
 		 385 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1607  aminotransferase class V  38.66 
 
 		 399 aa  238  1e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5559  aminotransferase class V  33.51 
 
 		 388 aa  200  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237097  normal  0.949284 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2195  aminotransferase class V  30.75 
 
 		 390 aa  199  7.999999999999999e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06227  aminotransferase family protein (LolT), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13295)  31.89 
 
 		 470 aa  177  4e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00480  conserved hypothetical protein  28.54 
 
 		 684 aa  158  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64026  cysteine desulfurase Selenocysteine lyase  27.86 
 
 		 421 aa  151  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.867854  normal  0.0377472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3487  selenocysteine lyase / isopenicillin N epimerase  29.58 
 
 		 426 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0293361  normal  0.0990887 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  29.16 
 
 		 437 aa  144  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0174  aminotransferase class V  30.13 
 
 		 389 aa  142  8e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0764904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61494  cysteine desulfurase Selenocysteine lyase  26.72 
 
 		 430 aa  140  3e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0727802 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4359  aminotransferase, class V  32.89 
 
 		 393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4973  putative aminotransferase  25.77 
 
 		 437 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6132  aminotransferase class V  24.62 
 
 		 422 aa  126  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  21.99 
 
 		 438 aa  126  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3047  aminotransferase class V  23.87 
 
 		 428 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.500863  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3648  aminotransferase class V  32.33 
 
 		 461 aa  123  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1124  aminotransferase, class V  26.29 
 
 		 488 aa  123  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.994048 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5319  aminotransferase class V  29.79 
 
 		 495 aa  120  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837464 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46105  predicted protein  25.54 
 
 		 485 aa  119  9e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916775  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001209  aminotransferase ScrA  28.94 
 
 		 469 aa  117  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2039  aminotransferase class V  32.79 
 
 		 460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04996  cysteine desulfurase  29.92 
 
 		 476 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  31.76 
 
 		 415 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3800  aminotransferase class V  27.14 
 
 		 433 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  30.04 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  31.3 
 
 		 395 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  29.31 
 
 		 404 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1478  twin-arginine translocation pathway signal  25.59 
 
 		 441 aa  111  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  29.52 
 
 		 401 aa  110  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4279  aminotransferase class V  29.91 
 
 		 462 aa  109  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  30.43 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  28.85 
 
 		 414 aa  107  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  30.17 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  26.39 
 
 		 368 aa  100  5e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  27.54 
 
 		 380 aa  98.2  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  25.72 
 
 		 367 aa  98.6  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  30.74 
 
 		 394 aa  97.8  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2611  aminotransferase, class V  23.42 
 
 		 441 aa  97.8  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.189769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  28.03 
 
 		 381 aa  97.1  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.55 
 
 		 406 aa  95.9  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2309  aminotransferase, class V  34.23 
 
 		 287 aa  95.1  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.422271  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  30.25 
 
 		 376 aa  94.7  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1584  aminotransferase class V  29.96 
 
 		 363 aa  94.4  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.504943 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  26.64 
 
 		 376 aa  93.6  5e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3786  aminotransferase, class V  26.36 
 
 		 430 aa  94  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2155  aminotransferase, class V  24.8 
 
 		 427 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0697123  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  31.11 
 
 		 395 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.37 
 
 		 406 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.57 
 
 		 419 aa  91.3  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0027  aminotransferase class V  26.7 
 
 		 455 aa  91.3  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3921  aminotransferase class V  22.19 
 
 		 445 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.37 
 
 		 406 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.37 
 
 		 406 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1470  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.12 
 
 		 406 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244975  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  31.89 
 
 		 380 aa  90.9  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.37 
 
 		 406 aa  90.5  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.09 
 
 		 407 aa  90.1  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  26.54 
 
 		 391 aa  90.1  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  24.87 
 
 		 401 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  26.59 
 
 		 408 aa  89.7  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.85 
 
 		 414 aa  90.1  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1965  twin-arginine translocation pathway signal  24.38 
 
 		 426 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0412227  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  27.9 
 
 		 880 aa  89.4  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  28.99 
 
 		 393 aa  88.6  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.58 
 
 		 416 aa  88.6  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  27.52 
 
 		 393 aa  87.8  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.72 
 
 		 406 aa  87.8  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  25.11 
 
 		 372 aa  87.4  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  29.79 
 
 		 393 aa  87  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  26.98 
 
 		 380 aa  86.7  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5397  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.84 
 
 		 414 aa  86.3  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  27.27 
 
 		 382 aa  86.3  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.71 
 
 		 406 aa  86.3  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1642  aminotransferase, class V  25.1 
 
 		 429 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.13 
 
 		 406 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1896  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  24.13 
 
 		 406 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554851  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1687  twin-arginine translocation pathway signal  23.14 
 
 		 440 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  24.13 
 
 		 406 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  25.99 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  31.35 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3538  aminotransferase class V  26.61 
 
 		 423 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  24.13 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.09 
 
 		 413 aa  83.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  25.67 
 
 		 393 aa  83.6  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  23.12 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1863  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.71 
 
 		 416 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  25.82 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>