59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0600 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_2072  single-stranded nucleic acid-binding R3H domain-containing protein  72.12 
 
 
579 aa  828    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1230  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  70.09 
 
 
602 aa  800    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.479745  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0600  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  100 
 
 
584 aa  1172    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767642  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4555  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  69.71 
 
 
605 aa  800    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0126  single-stranded nucleic acid binding R3H  72.9 
 
 
579 aa  838    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1201  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  70.09 
 
 
602 aa  800    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0625  single-stranded nucleic acid binding R3H  70.54 
 
 
588 aa  799    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.57022  normal  0.210072 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3015  single-stranded nucleic acid binding R3H  67.63 
 
 
590 aa  796    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0100908 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0379  ATPase  55.06 
 
 
546 aa  550  1e-155  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.788965  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22991  AAA ATPase superfamily protein  54.18 
 
 
545 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1951  ATPase  53.46 
 
 
539 aa  540  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0499  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  48.8 
 
 
565 aa  525  1e-148  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000861102  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0684  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  50.09 
 
 
551 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3721  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  48.19 
 
 
538 aa  509  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0059695 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3233  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  48.21 
 
 
538 aa  501  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.384079  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_683  R3H domain protein  49.48 
 
 
537 aa  499  1e-140  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0777  R3H domain-containing protein  49.65 
 
 
509 aa  497  1e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.191929  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0872  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  49.02 
 
 
515 aa  494  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.559562  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0703  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  48.86 
 
 
509 aa  490  1e-137  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2939  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  47.99 
 
 
540 aa  489  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  normal  0.269188 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_1953  predicted protein  46.79 
 
 
552 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2975  single-stranded nucleic acid binding R3H  48.7 
 
 
496 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.38424  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0032  AAA ATPase  49.38 
 
 
445 aa  444  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0786  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  68.52 
 
 
515 aa  441  9.999999999999999e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4406  predicted protein  66.16 
 
 
335 aa  426  1e-118  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.746499 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0513  AAA ATPase  38.78 
 
 
322 aa  199  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.203614 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0528  AAA ATPase  38.14 
 
 
318 aa  198  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.162948 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3621  AAA ATPase  34.83 
 
 
386 aa  178  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2960  AAA ATPase  34.63 
 
 
322 aa  158  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1801  stage III sporulation protein AA  26.91 
 
 
294 aa  82  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2087  stage III sporulation protein AA  26.91 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.963065  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1713  stage III sporulation protein AA  30.37 
 
 
322 aa  77  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1525  AAA ATPase  33.58 
 
 
332 aa  69.7  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4323  stage III sporulation protein AA  23.51 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4266  stage III sporulation protein AA  23.51 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3946  stage III sporulation protein AA  24.06 
 
 
308 aa  67  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4303  stage III sporulation protein AA  23.53 
 
 
308 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0931  stage III sporulation protein AA  24.07 
 
 
308 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.719213 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3935  stage III sporulation protein AA  23.68 
 
 
308 aa  64.7  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4417  stage III sporulation protein AA  23.68 
 
 
308 aa  64.7  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0235  stage III sporulation protein AA  24.35 
 
 
306 aa  64.7  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4097  stage III sporulation protein AA  23.68 
 
 
308 aa  64.7  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4213  stage III sporulation protein AA  23.68 
 
 
308 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0252456 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4046  sporulation stage III protein AA  24.42 
 
 
308 aa  64.7  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0990  AAA ATPase  26.09 
 
 
313 aa  58.9  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2336  stage III sporulation protein AA  23.3 
 
 
308 aa  58.9  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06170  Sporulation stage III protein AA  31.06 
 
 
316 aa  57.8  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2887  sporulation stage III protein AA  22.67 
 
 
307 aa  57.8  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1916  stage III sporulation protein AA  28.66 
 
 
331 aa  57  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0845  stage III sporulation protein spoIIIAA  30.13 
 
 
336 aa  57.4  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000346466  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1536  hypothetical protein  23.46 
 
 
350 aa  53.9  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.127679 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1056  hypothetical protein  29.26 
 
 
337 aa  52  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0117191  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2611  stage III sporulation protein AA  29.63 
 
 
345 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1007  AAA ATPase  27.69 
 
 
332 aa  47  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0550  stage III sporulation protein spoIIIAA  29.25 
 
 
313 aa  46.6  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.852342  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1329  type II secretion system protein E  26.75 
 
 
342 aa  45.8  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.336325  normal  0.041455 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2157  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  45 
 
 
199 aa  44.7  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3516  stage III sporulation protein AA  28.05 
 
 
361 aa  44.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00709627  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1054  type II secretion system protein E  30.71 
 
 
342 aa  43.9  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.143641 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>