More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0384 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  64.33 
 
 
503 aa  677    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20701  lysyl-tRNA synthetase  63.05 
 
 
513 aa  653    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1195  lysyl-tRNA synthetase  63.05 
 
 
513 aa  655    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  77.98 
 
 
561 aa  805    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  73.48 
 
 
573 aa  775    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  65.59 
 
 
502 aa  671    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  75.1 
 
 
573 aa  804    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  65.59 
 
 
502 aa  674    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  74.8 
 
 
504 aa  766    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  72.69 
 
 
573 aa  767    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  66.13 
 
 
508 aa  681    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 
509 aa  1044    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18101  lysyl-tRNA synthetase  58.35 
 
 
512 aa  615  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18071  lysyl-tRNA synthetase  58.75 
 
 
512 aa  615  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66414  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1711  lysyl-tRNA synthetase  57.75 
 
 
512 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18281  lysyl-tRNA synthetase  58.87 
 
 
488 aa  604  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505849  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32202  predicted protein  59.75 
 
 
485 aa  585  1e-166  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.334711  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  55.27 
 
 
510 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_50879  predicted protein  55.96 
 
 
607 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0733722 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 
497 aa  556  1e-157  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  58.08 
 
 
489 aa  558  1e-157  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  55.83 
 
 
491 aa  549  1e-155  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  54.97 
 
 
494 aa  551  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  55.85 
 
 
495 aa  547  1e-154  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  55.28 
 
 
489 aa  545  1e-154  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 
494 aa  545  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  53.56 
 
 
499 aa  543  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  53.59 
 
 
489 aa  539  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  53.05 
 
 
493 aa  535  1e-151  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  54.58 
 
 
488 aa  532  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  54.99 
 
 
490 aa  530  1e-149  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  51.47 
 
 
503 aa  528  1e-148  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  51.91 
 
 
499 aa  526  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 
499 aa  524  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  51.41 
 
 
499 aa  522  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  51.41 
 
 
499 aa  522  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  51.41 
 
 
499 aa  522  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  51.41 
 
 
499 aa  522  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  51.41 
 
 
499 aa  523  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 
499 aa  524  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  51.21 
 
 
499 aa  519  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  52.86 
 
 
499 aa  521  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  51.21 
 
 
499 aa  518  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  51.21 
 
 
499 aa  520  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  51.08 
 
 
499 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  51.63 
 
 
501 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  51.84 
 
 
501 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 
495 aa  511  1e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 
515 aa  511  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 
515 aa  511  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 
647 aa  506  9.999999999999999e-143  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  52.02 
 
 
491 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  52.43 
 
 
523 aa  504  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 
509 aa  501  1e-140  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  51 
 
 
499 aa  501  1e-140  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  51.6 
 
 
508 aa  499  1e-140  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000549631  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 
494 aa  497  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2354  lysyl-tRNA synthetase  52.24 
 
 
496 aa  495  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0808673  decreased coverage  0.00196891 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 
494 aa  496  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 
491 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0750  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 
496 aa  492  9.999999999999999e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1118  lysyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 
505 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0417  lysyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 
494 aa  492  9.999999999999999e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 
492 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1034  lysyl-tRNA synthetase  51.45 
 
 
496 aa  489  1e-137  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  49.6 
 
 
631 aa  490  1e-137  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0190  lysyl-tRNA synthetase (class II)  49.5 
 
 
496 aa  491  1e-137  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1028  lysyl-tRNA synthetase  49.71 
 
 
510 aa  487  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296051  normal  0.894371 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 
502 aa  487  1e-136  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000393607  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 
494 aa  487  1e-136  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2331  lysyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 
514 aa  485  1e-136  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1667  lysyl-tRNA synthetase  49.22 
 
 
515 aa  487  1e-136  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.208313  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 
502 aa  487  1e-136  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2136  lysyl-tRNA synthetase  50.87 
 
 
508 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251549 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5959  lysyl-tRNA synthetase  50.87 
 
 
508 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 
492 aa  486  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0406  lysyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 
495 aa  486  1e-136  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2118  lysyl-tRNA synthetase  50.87 
 
 
508 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414372  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  50.1 
 
 
505 aa  482  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 
505 aa  482  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2028  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 
508 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 
505 aa  483  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5424  lysyl-tRNA synthetase  50.19 
 
 
524 aa  484  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3296  lysyl-tRNA synthetase  48.92 
 
 
505 aa  484  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 
1118 aa  484  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  50.1 
 
 
505 aa  482  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 
492 aa  483  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0009  lysyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 
489 aa  484  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00617172  hitchhiker  0.00000378083 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3422  lysyl-tRNA synthetase  49.42 
 
 
505 aa  484  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231607  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0726  lysyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 
507 aa  483  1e-135  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2155  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 
508 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351617  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0733  lysyl-tRNA synthetase  49 
 
 
496 aa  484  1e-135  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.874449  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  51.11 
 
 
503 aa  482  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 
505 aa  483  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0007  lysyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 
497 aa  482  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 
508 aa  478  1e-134  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 
505 aa  481  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1378  lysyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 
502 aa  480  1e-134  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 
505 aa  481  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 
505 aa  481  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>