More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0282 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0282  glutamine synthetase, type III  100 
 
 
436 aa  907    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.903176  normal  0.0152238 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2296  L-glutamine synthetase  69.68 
 
 
434 aa  646    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4698  glutamine synthetase catalytic region  67.05 
 
 
453 aa  612  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1572  glutamine synthetase, type III  66.28 
 
 
432 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49312  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1135  glutamate--ammonia ligase  66.06 
 
 
432 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1659  glutamine synthetase, type III  65.83 
 
 
432 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4807  glutamine synthetase, type III  65.6 
 
 
432 aa  599  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.602864  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1945  L-glutamine synthetase  65.83 
 
 
432 aa  597  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.593814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1941  glutamine synthetase, type III  66.06 
 
 
432 aa  586  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2635  glutamine synthetase, type III  62.61 
 
 
435 aa  580  1e-164  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6005  glutamine synthetase catalytic region  61.7 
 
 
435 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0483742  decreased coverage  0.00440887 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6578  glutamine synthetase, type III  60.92 
 
 
435 aa  558  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0536435 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5752  glutamine synthetase  61.15 
 
 
435 aa  560  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23975  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3294  glutamine synthetase catalytic region  60.78 
 
 
461 aa  558  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5641  glutamine synthetase, type III  61.15 
 
 
435 aa  558  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294213  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1867  glutamine synthetase 3  61.36 
 
 
438 aa  556  1e-157  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.60357 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1798  glutamate--ammonia ligase  41.38 
 
 
451 aa  338  8e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.44484  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1347  glutamate--ammonia ligase  41.41 
 
 
444 aa  335  7e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.353165  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1698  glutamine synthetase, type III  42.25 
 
 
444 aa  330  3e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.738423  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0166  glutamine synthetase, type III  44.04 
 
 
464 aa  328  1.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0794  glutamine synthetase, type III  43.06 
 
 
461 aa  326  6e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.827759  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3034  glutamate--ammonia ligase  43.44 
 
 
463 aa  324  2e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  41.06 
 
 
446 aa  322  6e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3468  L-glutamine synthetase  40.87 
 
 
444 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409179  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5918  glutamine synthetase, type III  41.99 
 
 
442 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0618649  normal  0.505098 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2247  glutamine synthetase, type III  41.36 
 
 
444 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0077  L-glutamine synthetase  39.04 
 
 
453 aa  318  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2273  glutamate--ammonia ligase  39.95 
 
 
444 aa  317  3e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0123313 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1856  L-glutamine synthetase  40.18 
 
 
453 aa  317  3e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0456  L-glutamine synthetase  42.09 
 
 
459 aa  316  4e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.251652  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3085  glutamine synthetase, type III  41.14 
 
 
455 aa  315  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3525  glutamine synthetase, type III  42.32 
 
 
480 aa  313  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0706395 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2562  L-glutamine synthetase  40.41 
 
 
452 aa  310  4e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3904  glutamine synthetase, type III  40.36 
 
 
457 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.157451 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4021  glutamine synthetase, type III  40.14 
 
 
457 aa  301  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3726  glutamine synthetase, type III  40.14 
 
 
457 aa  301  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.681575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4892  glutamate--ammonia ligase  40.99 
 
 
436 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5260  glutamate--ammonia ligase  40.99 
 
 
436 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4981  glutamate--ammonia ligase  40.99 
 
 
436 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4807  glutamine synthetase, type III  41.91 
 
 
456 aa  299  6e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5509  glutamate--ammonia ligase  40.99 
 
 
435 aa  296  7e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.163874 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1300  glutamate--ammonia ligase  40.77 
 
 
435 aa  295  8e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.646608 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1911  L-glutamine synthetase  40.14 
 
 
451 aa  288  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  0.325105 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5723  L-glutamine synthetase  38.24 
 
 
451 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5344  L-glutamine synthetase  38.01 
 
 
451 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.567522  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5433  L-glutamine synthetase  38.01 
 
 
451 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  35.47 
 
 
444 aa  266  8e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  36.47 
 
 
456 aa  261  2e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  34.02 
 
 
443 aa  256  5e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  35.14 
 
 
443 aa  254  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2370  glutamine synthetase, type III  35.02 
 
 
452 aa  248  1e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  34.85 
 
 
452 aa  248  2e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0870  glutamate--ammonia ligase  33.26 
 
 
453 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  34.32 
 
 
443 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0887  glutamate--ammonia ligase  33.26 
 
 
453 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0876  glutamate--ammonia ligase  33.03 
 
 
453 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  34.09 
 
 
444 aa  241  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  35.76 
 
 
445 aa  242  1e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  34.46 
 
 
437 aa  241  2e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  32.87 
 
 
441 aa  240  4e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  34.56 
 
 
442 aa  240  4e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  33.79 
 
 
433 aa  239  1e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  32.52 
 
 
444 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2909  glutamine synthetase, type I  35.37 
 
 
446 aa  236  6e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113408  normal  0.593319 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  34.37 
 
 
444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  33.26 
 
 
445 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  32.05 
 
 
449 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0924  glutamine synthetase, type I  35.31 
 
 
453 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.0517431 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  34.68 
 
 
444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3106  glutamine synthetase, type I  34.69 
 
 
453 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000021484  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3598  glutamine synthetase, type I  35.15 
 
 
446 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  31.74 
 
 
443 aa  233  7.000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  34.4 
 
 
451 aa  231  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1497  glutamine synthetase, type I  34.85 
 
 
446 aa  232  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.293618  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3339  L-glutamine synthetase  34.92 
 
 
446 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0399179  normal  0.158604 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3328  L-glutamine synthetase  34.92 
 
 
446 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.954484  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3390  L-glutamine synthetase  34.92 
 
 
446 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  34.38 
 
 
444 aa  230  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  31.4 
 
 
445 aa  231  3e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  37.02 
 
 
451 aa  231  3e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  32.5 
 
 
440 aa  230  4e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  32.81 
 
 
442 aa  230  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  33.94 
 
 
442 aa  230  5e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  33.48 
 
 
447 aa  229  7e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  33.18 
 
 
444 aa  229  7e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  34.46 
 
 
456 aa  228  1e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  33.93 
 
 
444 aa  228  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  31.97 
 
 
446 aa  228  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07430  L-glutamine synthetase  33.94 
 
 
447 aa  228  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  33.03 
 
 
444 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  33.41 
 
 
446 aa  227  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  33.41 
 
 
446 aa  227  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  34.17 
 
 
453 aa  227  3e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  32.6 
 
 
445 aa  227  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  33.71 
 
 
444 aa  227  4e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  33.71 
 
 
444 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  32.27 
 
 
443 aa  226  6e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  34.9 
 
 
445 aa  226  8e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12251  glutamine synthetase glnA2  33.79 
 
 
446 aa  226  8e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  33.41 
 
 
446 aa  226  9e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>