170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0278 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  82.2 
 
 
382 aa  667    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  82.2 
 
 
382 aa  667    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  100 
 
 
382 aa  787    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  31.87 
 
 
364 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  27.46 
 
 
362 aa  147  3e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  26.68 
 
 
370 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  26.68 
 
 
370 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  28.4 
 
 
378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  29.4 
 
 
369 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  27.27 
 
 
416 aa  139  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  25.69 
 
 
378 aa  136  8e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  28.17 
 
 
378 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  26.1 
 
 
357 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  26.87 
 
 
363 aa  134  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  26.36 
 
 
367 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  26.36 
 
 
367 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  25.52 
 
 
369 aa  133  6.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  25.65 
 
 
364 aa  130  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  25.13 
 
 
373 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  26.09 
 
 
370 aa  129  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  26.75 
 
 
363 aa  129  8.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  27.85 
 
 
390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  24.61 
 
 
365 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  29.18 
 
 
395 aa  124  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  27.25 
 
 
377 aa  122  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  27.04 
 
 
390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  26.79 
 
 
390 aa  120  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  28.18 
 
 
390 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  28.18 
 
 
390 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  24.8 
 
 
368 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  26.53 
 
 
390 aa  117  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  27.09 
 
 
395 aa  117  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  27.93 
 
 
386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  26.46 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  26.46 
 
 
390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  26.46 
 
 
390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  26.4 
 
 
410 aa  113  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  28.18 
 
 
390 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  26.21 
 
 
390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  27.3 
 
 
386 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  25.38 
 
 
370 aa  109  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  28.25 
 
 
387 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  26.7 
 
 
393 aa  109  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  25.64 
 
 
392 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1387  ATPase-like protein  27.41 
 
 
392 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365214  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  25.71 
 
 
362 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  25.56 
 
 
365 aa  107  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  25.79 
 
 
424 aa  106  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  27.98 
 
 
387 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  26.84 
 
 
388 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  24.49 
 
 
393 aa  104  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  26.63 
 
 
399 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  28.8 
 
 
398 aa  104  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  26.89 
 
 
388 aa  104  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  25.58 
 
 
411 aa  103  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  27.15 
 
 
388 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  24.81 
 
 
376 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  28.08 
 
 
397 aa  101  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  26.3 
 
 
387 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  25.95 
 
 
385 aa  100  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  26.4 
 
 
390 aa  100  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2434  hypothetical protein  25.06 
 
 
392 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329765  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  25.56 
 
 
388 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2313  hypothetical protein  25.06 
 
 
392 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.969478  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2274  hypothetical protein  25.06 
 
 
392 aa  99.8  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.618217  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  27.09 
 
 
395 aa  99.4  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1418  hypothetical protein  25.06 
 
 
436 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1230  SMC domain protein  27.97 
 
 
386 aa  99  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.086198 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1909  hypothetical protein  25.06 
 
 
436 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3395  hypothetical protein  25.06 
 
 
436 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1182  hypothetical protein  25.06 
 
 
436 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  26.72 
 
 
361 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  27.81 
 
 
388 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  24.59 
 
 
398 aa  97.1  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08280  predicted ATPase  30.4 
 
 
392 aa  97.1  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0509 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1226  hypothetical protein  25.12 
 
 
384 aa  96.7  6e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  26.33 
 
 
386 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  26.74 
 
 
393 aa  95.9  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  26.91 
 
 
394 aa  95.5  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  25.81 
 
 
394 aa  95.5  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  25.78 
 
 
409 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1910  ATPase-like protein  26.22 
 
 
391 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358131 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1796  ATPase-like protein  26.48 
 
 
391 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  21.88 
 
 
393 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  27.25 
 
 
385 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  29.8 
 
 
226 aa  94  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  22.83 
 
 
390 aa  93.6  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  27.03 
 
 
385 aa  93.2  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54090  hypothetical protein  27.4 
 
 
387 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6192  ATPase-like  26.03 
 
 
391 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1887  ATPase-like protein  26.03 
 
 
391 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5187  ATPase-like  26.29 
 
 
391 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  22.39 
 
 
395 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  27.08 
 
 
387 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  23.9 
 
 
384 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1824  ATPase-like protein  25.96 
 
 
391 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.248078  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  24.46 
 
 
399 aa  90.5  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  22.56 
 
 
395 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4659  hypothetical protein  27.61 
 
 
385 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  23.56 
 
 
367 aa  89.4  9e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>