More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0271 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0271  Polynucleotide adenylyltransferase region  100 
 
 
424 aa  852    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00875656 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3833  polynucleotide adenylyltransferase region  50.23 
 
 
422 aa  395  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1064  polynucleotide adenylyltransferase region  46.43 
 
 
423 aa  379  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191372  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0184  Polynucleotide adenylyltransferase region  47.78 
 
 
408 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2997  polynucleotide adenylyltransferase region  45.95 
 
 
423 aa  367  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.337378  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1970  Polynucleotide adenylyltransferase region  45.5 
 
 
420 aa  338  8e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1997  Polynucleotide adenylyltransferase region  45.5 
 
 
420 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.600969  normal  0.0824458 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0791  polyA polymerase  44.05 
 
 
412 aa  292  9e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.11993 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1507  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  30.27 
 
 
395 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01691  poly A polymerase family protein  27.72 
 
 
415 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01561  poly A polymerase family protein  32.53 
 
 
397 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02131  poly A polymerase family protein  32.45 
 
 
395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0143  poly A polymerase family protein  26.54 
 
 
406 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01601  poly A polymerase family protein  27.56 
 
 
405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.100479  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2392  poly A polymerase family protein  33.73 
 
 
397 aa  160  6e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0301  poly A polymerase family protein  33.89 
 
 
398 aa  155  1e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01581  poly A polymerase family protein  27.01 
 
 
405 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.178246  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14390  poly(A) polymerase/tRNA nucleotidyl transferase  30.06 
 
 
478 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101542  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2184  polyA polymerase family protein  33.08 
 
 
430 aa  150  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.459849  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3120  polynucleotide adenylyltransferase region  31.58 
 
 
450 aa  145  9e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0314  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.63 
 
 
498 aa  139  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000179563  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_276  polymerase  27.77 
 
 
501 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000457601  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1521  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  23.66 
 
 
469 aa  127  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26611  Poly A polymerase family protein  30.51 
 
 
412 aa  126  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0334  polyA polymerase family protein  26.9 
 
 
493 aa  125  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000707313  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1045  Polynucleotide adenylyltransferase region  24.55 
 
 
474 aa  124  4e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1238  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  24.03 
 
 
500 aa  122  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0264  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  40.21 
 
 
517 aa  116  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2285  polynucleotide adenylyltransferase region  29.26 
 
 
431 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0369543  normal  0.29262 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0756  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  29.09 
 
 
401 aa  112  9e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.525982  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0158  metal dependent phosphohydrolase  34.78 
 
 
472 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2857  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.17 
 
 
484 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.858546  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1260  tRNA CCA-pyrophosphorylase  26.16 
 
 
397 aa  104  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4574  HDIG domain-containing protein  36.24 
 
 
485 aa  103  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5092  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.33 
 
 
485 aa  102  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588683 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0026  polyA polymerase family protein  25 
 
 
424 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3712  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  38.64 
 
 
507 aa  101  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.353872  normal  0.0967324 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1645  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  36.81 
 
 
438 aa  101  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115731  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0026  polyA polymerase family protein  25.93 
 
 
422 aa  101  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1341  tRNA CCA-pyrophosphorylase  25.67 
 
 
402 aa  99.4  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.293124  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6436  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.88 
 
 
473 aa  98.2  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2216  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  38.94 
 
 
426 aa  98.6  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3067  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.45 
 
 
489 aa  97.4  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263831  hitchhiker  0.000000430788 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3827  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.19 
 
 
459 aa  97.1  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1306  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.74 
 
 
489 aa  97.1  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3362  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.96 
 
 
500 aa  96.7  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2393  Polynucleotide adenylyltransferase region  36.78 
 
 
529 aa  96.3  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9036  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.56 
 
 
491 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1525  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  25.49 
 
 
475 aa  95.1  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1023  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  26.56 
 
 
464 aa  95.1  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1012  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  33.33 
 
 
399 aa  95.5  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.200696  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2353  tRNA cytidylyltransferase  33.47 
 
 
434 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.103855  normal  0.215704 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0065  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.32 
 
 
467 aa  94.7  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000449224  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2407  tRNA adenylyltransferase  29.48 
 
 
471 aa  94.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0060  tRNA adenylyltransferase  33.06 
 
 
475 aa  94.4  4e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.451798 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06110  tRNA nucleotidyltransferase  26.05 
 
 
477 aa  94  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1449  tRNA nucleotidyltransferase  30.29 
 
 
471 aa  93.6  6e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0767  tRNA CCA-pyrophosphorylase  25.66 
 
 
403 aa  92.4  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.746315  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37890  tRNA adenylyltransferase  38.02 
 
 
488 aa  92.8  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1162  poly(A) polymerase I  32.03 
 
 
482 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000172758  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0727  polynucleotide adenylyltransferase  23.23 
 
 
410 aa  92  2e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.43886  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1703  tRNA CCA-pyrophosphorylase  24.75 
 
 
397 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.026033  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2295  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.38 
 
 
448 aa  91.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.730804  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23340  tRNA adenylyltransferase  37.1 
 
 
483 aa  91.7  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3116  poly(A) polymerase I  32.03 
 
 
482 aa  90.9  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0612  metal dependent phosphohydrolase  29.31 
 
 
433 aa  91.3  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.319596 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4207  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.51 
 
 
483 aa  90.9  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0722  HDIG  26.17 
 
 
476 aa  90.5  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.314731  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1636  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.73 
 
 
464 aa  90.9  4e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.841879  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0665  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.96 
 
 
484 aa  90.9  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0990908 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2139  metal dependent phosphohydrolase  36.57 
 
 
525 aa  90.9  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0390  poly(A) polymerase  34.85 
 
 
439 aa  90.5  5e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0179793  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1495  Poly(A) polymerase (PAP) (plasmid copy number protein)  31.51 
 
 
423 aa  90.5  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2058  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  24.83 
 
 
469 aa  90.5  5e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0632  multifunctional tRNA nucleotidyl transferase/2'3'-cyclic phosphodiesterase/2'nucleotidase/phosphatase  37.56 
 
 
416 aa  90.5  5e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2535  tRNA adenylyltransferase (tRNA nucleotidyl transferase)  29.82 
 
 
479 aa  90.1  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0669  poly(A) polymerase  34.82 
 
 
455 aa  90.1  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.598779  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0854  Polynucleotide adenylyltransferase region  26.46 
 
 
468 aa  90.1  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00520307 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1653  tRNA CCA-pyrophosphorylase  27.86 
 
 
402 aa  89.7  8e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1665  tRNA CCA-pyrophosphorylase  24.51 
 
 
397 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1446  tRNA CCA-pyrophosphorylase  24.75 
 
 
397 aa  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1418  tRNA CCA-pyrophosphorylase  24.75 
 
 
397 aa  89.7  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1488  Poly(A) polymerase (PAP) (plasmid copy number protein)  31.51 
 
 
423 aa  89.7  9e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1630  tRNA CCA-pyrophosphorylase  24.75 
 
 
397 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.16656 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1559  tRNA CCA-pyrophosphorylase  24.75 
 
 
397 aa  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978785  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1564  polynucleotide adenylyltransferase region  21.36 
 
 
388 aa  89.4  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3415  multifunctional tRNA nucleotidyl transferase/2'3'-cyclic phosphodiesterase/2'nucleotidase/phosphatase  37.88 
 
 
406 aa  89.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.617389 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1528  poly(A) polymerase  32.31 
 
 
484 aa  89.4  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000410456  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1389  metal dependent phosphohydrolase  33.5 
 
 
442 aa  89  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.23743  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1795  poly(A) polymerase  34.34 
 
 
439 aa  89.4  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.649421  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2803  polynucleotide adenylyltransferase region  33.78 
 
 
510 aa  89.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39600  tRNA adenylyltransferase  36.27 
 
 
523 aa  89.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1419  tRNA CCA-pyrophosphorylase  24.75 
 
 
397 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1592  tRNA CCA-pyrophosphorylase  25.3 
 
 
397 aa  89  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.441077  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1480  polynucleotide adenylyltransferase region  34.03 
 
 
436 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.846111  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4531  metal dependent phosphohydrolase  38.07 
 
 
502 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  24.23 
 
 
877 aa  88.6  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0461  tRNA CCA-pyrophosphorylase  33.18 
 
 
402 aa  89  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4906  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.49 
 
 
495 aa  89  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2475  tRNA cytidylyltransferase  33.51 
 
 
436 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>