More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0189 on replicon NC_011885
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011885  Cyan7425_0189  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 360 aa  748    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.166962 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1643  transcriptional regulator, AraC family  61.16 
 
 		 351 aa  423  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.671722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  41.67 
 
 		 345 aa  291  9e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  39.08 
 
 		 347 aa  265  8e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1599  transcriptional regulator  39.63 
 
 		 361 aa  261  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.97604  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0622  transcriptional regulator  37.85 
 
 		 340 aa  243  5e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553854  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3712  transcriptional regulator  34.35 
 
 		 336 aa  230  3e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.990015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2846  AraC family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01004  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  33.54 
 
 		 329 aa  195  9e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0283206  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 332 aa  186  8e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2142  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 324 aa  182  6e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3975  transcriptional regulator  32.15 
 
 		 337 aa  181  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4589  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  32.42 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0860  AraC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 348 aa  179  5.999999999999999e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  34.03 
 
 		 334 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321471  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1313  AraC family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4536  AraC family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 334 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3263  transcriptional regulator, AraC family  32.07 
 
 		 326 aa  173  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0920  AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 334 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4083  AraC family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 341 aa  169  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0474473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05287  transcriptional activator FtrA  30.63 
 
 		 320 aa  169  6e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2762  transcriptional regulator, AraC family  34.36 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0171097 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2508  transcriptional regulator  32.3 
 
 		 336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4697  transcriptional regulator  35.02 
 
 		 331 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207414  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  33.68 
 
 		 335 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  34.9 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4427  transcriptional regulator, AraC family  34.63 
 
 		 336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.326492  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57630  AraC family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 299 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.963773 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3787  transcriptional regulator  29.12 
 
 		 321 aa  162  7e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  31.91 
 
 		 330 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5008  putative transcriptional regulator  34.6 
 
 		 332 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3759  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.78 
 
 		 326 aa  160  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1553  transcriptional regulator  32.34 
 
 		 331 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1182  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.03 
 
 		 324 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 326 aa  160  3e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016714 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1246  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 332 aa  158  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5208  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000934033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1705  helix-turn-helix domain-containing protein  30.77 
 
 		 320 aa  157  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.29723  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1778  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.52 
 
 		 325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal  0.0235367 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3344  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.17 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1229  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.07 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2599  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1489  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.62 
 
 		 323 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.616641 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2301  transcriptional regulator  27.48 
 
 		 324 aa  151  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2426  transcriptional regulator, AraC family  29.37 
 
 		 326 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971153  normal  0.0916341 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0314  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0068  transcriptional regulator  31.14 
 
 		 347 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1330  transcriptional regulator, AraC family  28.17 
 
 		 326 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.521973  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0070  transcriptional regulator  30.84 
 
 		 347 aa  149  9e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.020859 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  29.62 
 
 		 330 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1772  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.53 
 
 		 293 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0120296 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0072  transcriptional regulator  30.54 
 
 		 347 aa  147  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4869  AraC family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 337 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2675  transcriptional regulator, AraC family  28.66 
 
 		 344 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307401  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4511  transcriptional regulator, AraC family  34.36 
 
 		 339 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.64274 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1918  transcriptional regulator, AraC family  29.6 
 
 		 327 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3506  AraC family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.939341  normal  0.0589755 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1857  AraC family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 338 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18222 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2234  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 330 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.962439 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5041  transcriptional regulator  30.57 
 
 		 331 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00544571 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0104  AraC family transcriptional regulator  27.79 
 
 		 328 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0442  hypothetical protein  31.47 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 329 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3785  AraC family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 323 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4194  AraC family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0109567  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0974  helix-turn-helix domain-containing protein  32.33 
 
 		 314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3593  AraC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 342 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 342 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1733  transcriptional regulator, AraC family  28.2 
 
 		 322 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2740  transcriptional activator FtrA  30.41 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4788  AraC family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 344 aa  127  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2723  transcriptional regulator, AraC family  28.61 
 
 		 331 aa  127  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 333 aa  126  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2955  transcriptional regulator, AraC family  30.07 
 
 		 317 aa  125  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012422  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6432  AraC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5650  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  31.62 
 
 		 313 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0059  AraC family transcription regulator  28.2 
 
 		 404 aa  123  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4339  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 334 aa  122  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.400268 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2641  AraC family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 338 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6340  transcriptional regulator, AraC family  27.8 
 
 		 326 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351976 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3318  AraC family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0070  AraC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0068  AraC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  32.76 
 
 		 362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  28.28 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  30.04 
 
 		 328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0686  AraC family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 330 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  28.14 
 
 		 338 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1180  AraC family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 320 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.688099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2995  transcriptional regulator, AraC family  28.66 
 
 		 341 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4043  transcriptional regulator, AraC family  26.54 
 
 		 321 aa  120  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8583  transcriptional regulator, AraC family  26.15 
 
 		 331 aa  119  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1506  AraC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 345 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570084  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6323  AraC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 345 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.879961  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>