238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0109 on replicon NC_011885
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011885  Cyan7425_0109  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  100 
 
 		 191 aa  397  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  47.89 
 
 		 193 aa  189  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  43.39 
 
 		 195 aa  158  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  42.33 
 
 		 195 aa  155  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3207  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.22 
 
 		 191 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.535635  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32930  dihydrofolate reductase  40 
 
 		 194 aa  150  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5023  deaminase-reductase domain-containing protein  39.29 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.499982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  43.16 
 
 		 193 aa  149  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4096  RibD domain protein  39.27 
 
 		 192 aa  144  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4561  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.5 
 
 		 197 aa  143  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7185  RibD domain protein  39.13 
 
 		 190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2516  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.98 
 
 		 189 aa  134  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.367324  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0724  dihydrofolate reductase family protein  38.14 
 
 		 197 aa  132  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.758945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3848  dihydrofolate reductase family protein  37.3 
 
 		 190 aa  132  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347395  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5799  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  36.79 
 
 		 191 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00712237  normal  0.320855 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0271  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.7 
 
 		 191 aa  132  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.011161  hitchhiker  0.00121534 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3404  riboflavin biosynthesis protein RibD  36.84 
 
 		 196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1936  dihydrofolate reductase family protein  33.86 
 
 		 191 aa  111  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422248  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  34.21 
 
 		 173 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  33.68 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  33.68 
 
 		 173 aa  106  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  33.68 
 
 		 173 aa  106  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  32.63 
 
 		 173 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  32.63 
 
 		 173 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  33.51 
 
 		 173 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  32.11 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  32.63 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5690  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.44 
 
 		 179 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.172276  normal  0.519116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.5 
 
 		 176 aa  102  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  32.63 
 
 		 173 aa  101  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  30.32 
 
 		 194 aa  97.4  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.29 
 
 		 181 aa  94.7  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.94 
 
 		 182 aa  94.4  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.8 
 
 		 174 aa  92.8  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  32.43 
 
 		 183 aa  92.4  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  34.03 
 
 		 180 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.98 
 
 		 178 aa  91.3  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  29.84 
 
 		 172 aa  90.9  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  30.16 
 
 		 192 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1850  bifunctional deaminase-reductase-like  29.26 
 
 		 176 aa  87.4  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.184998 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  30.81 
 
 		 182 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  28.93 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  29.32 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.41 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  29.47 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  30.69 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.03 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  30.16 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.23 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  27.81 
 
 		 175 aa  71.2  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.47 
 
 		 177 aa  71.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2049  bifunctional deaminase-reductase-like  29.02 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  28.29 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.37 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0449  deaminase-reductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  27 
 
 		 181 aa  67  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.9 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.93 
 
 		 184 aa  67.8  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  28.88 
 
 		 183 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  30.88 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 183 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.75 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  25 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.59 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4077  dihydrofolate reductase  27.33 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1834  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.27 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  31.08 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.61 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.25 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2025  deaminase-reductase domain-containing protein  25.27 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  25.5 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.11 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.91 
 
 		 187 aa  62  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  27.13 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.44 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.63 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.5 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  30.1 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  23.08 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  22.58 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3715  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.53 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.91 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.15 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.62 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  23.71 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  32.06 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.81 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  26.29 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.17 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  25.53 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  28.05 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4307  bifunctional deaminase-reductase-like  30.34 
 
 		 167 aa  57.8  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.912167  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5832  deaminase-reductase domain-containing protein  26.6 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  27.13 
 
 		 390 aa  57  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  23.83 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.5 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  24.04 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  29.5 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  27.07 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>