13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0091 on replicon NC_011885
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011885  Cyan7425_0091  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 
113 aa  233  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.18498 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2100  cupin region  60.71 
 
 
119 aa  155  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2136  hypothetical protein  45.13 
 
 
107 aa  97.4  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.0212795 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0205  cupin 2 domain-containing protein  51.72 
 
 
110 aa  95.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.633388  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3324  cupin 2 domain-containing protein  44.14 
 
 
110 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3841  cupin 2 domain-containing protein  50.56 
 
 
110 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.325051 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1726  cupin 2 domain-containing protein  47.25 
 
 
144 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.334039  normal  0.571645 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1115  cupin 2 domain-containing protein  35.38 
 
 
106 aa  47.8  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.378995 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07738  hypothetical protein  46.15 
 
 
173 aa  43.5  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2960  cupin 2 domain-containing protein  25.81 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.13 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28660  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  36.59 
 
 
300 aa  41.6  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 
108 aa  40.8  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>