More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0072 on replicon NC_011885
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011885  Cyan7425_0072  histidine kinase  100 
 
 
810 aa  1649  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2699  multi-sensor hybrid histidine kinase  60.57 
 
 
1099 aa  538  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117538 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  53.85 
 
 
800 aa  505  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.78 
 
 
1068 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.21 
 
 
1090 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.21 
 
 
1090 aa  470  1e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.42 
 
 
844 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.79 
 
 
1058 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.42 
 
 
844 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.62 
 
 
1002 aa  456  1e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.62 
 
 
1002 aa  456  1e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.38 
 
 
1578 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.17 
 
 
1611 aa  450  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.24 
 
 
1322 aa  439  1e-122  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  46.56 
 
 
1285 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5067  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.87 
 
 
1002 aa  429  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4631  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.83 
 
 
1672 aa  384  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.659803  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1005  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.25 
 
 
747 aa  337  4e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6547  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.74 
 
 
865 aa  320  9e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.325935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  39.57 
 
 
2051 aa  318  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0067  histidine kinase  52.96 
 
 
486 aa  306  9e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.19 
 
 
721 aa  305  2e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2998  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.47 
 
 
807 aa  304  5e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.745142 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.55 
 
 
1323 aa  298  4e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 
937 aa  296  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6560  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.22 
 
 
720 aa  295  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.646619 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2088  histidine kinase  36.38 
 
 
857 aa  296  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2132  histidine kinase  36.38 
 
 
857 aa  296  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.880976 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0133  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.29 
 
 
766 aa  295  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.834667 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3975  Cache sensor hybrid histidine kinase  32.91 
 
 
811 aa  293  9e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  2.22358e-05  hitchhiker  0.00723661 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.65 
 
 
939 aa  291  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1574  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.97 
 
 
841 aa  287  5e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1719  histidine kinase  43.89 
 
 
1257 aa  286  1e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0583268  normal  0.402469 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  37.53 
 
 
1323 aa  286  2e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.71 
 
 
1075 aa  285  3e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0808  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.14 
 
 
929 aa  284  4e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.95 
 
 
922 aa  283  6e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  3.70631e-07  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2508  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.9 
 
 
784 aa  278  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.033945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3211  histidine kinase  39.44 
 
 
781 aa  277  7e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.306218  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4154  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.84 
 
 
750 aa  276  1e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.22479  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.64 
 
 
770 aa  275  4e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.25 
 
 
1691 aa  270  5e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.17 
 
 
1127 aa  270  9e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3586  sensor histidine kinase/response regulator  39.95 
 
 
1153 aa  269  1e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4079  sensor histidine kinase/response regulator  37.58 
 
 
1161 aa  268  3e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  37.23 
 
 
544 aa  268  4e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.85 
 
 
935 aa  268  4e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2946  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  42.24 
 
 
777 aa  266  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  42.01 
 
 
620 aa  266  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3135  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.91 
 
 
1187 aa  264  5e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1351  histidine kinase  41.01 
 
 
596 aa  263  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57626  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  42.09 
 
 
724 aa  263  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3320  histidine kinase  36.3 
 
 
1128 aa  263  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.515444 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.95 
 
 
803 aa  262  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.39 
 
 
674 aa  262  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.67 
 
 
989 aa  261  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3065  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.54 
 
 
1128 aa  260  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.79 
 
 
989 aa  259  9e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0915  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.4 
 
 
822 aa  259  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.28 
 
 
718 aa  259  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.25842e-05 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.63 
 
 
945 aa  259  2e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.55 
 
 
699 aa  259  2e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1762  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 
1146 aa  257  6e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.468259  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0975  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.57 
 
 
1130 aa  256  8e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.537982 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.56 
 
 
1433 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.99 
 
 
1596 aa  254  4e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.65 
 
 
882 aa  254  5e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2985  fused histidine kinase sensor/response regulator  37.88 
 
 
1121 aa  254  5e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.446873 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4715  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.68 
 
 
1350 aa  253  8e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726459  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  38.56 
 
 
1028 aa  253  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  38.53 
 
 
655 aa  253  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.05 
 
 
1313 aa  253  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0958  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 
734 aa  252  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.31 
 
 
874 aa  252  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.93 
 
 
827 aa  252  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1372  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.46 
 
 
1362 aa  252  2e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  39.2 
 
 
900 aa  251  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3398  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.07 
 
 
1202 aa  251  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.613847  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0307  response regulator, histidine kinase  34.67 
 
 
755 aa  251  4e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  35.64 
 
 
736 aa  251  5e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0232  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  37.89 
 
 
738 aa  251  5e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  39.22 
 
 
968 aa  251  5e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 
817 aa  251  5e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 
995 aa  250  9e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4279  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.55 
 
 
951 aa  249  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4180  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.49 
 
 
1126 aa  249  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0796198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.79 
 
 
1350 aa  249  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3868  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.79 
 
 
1127 aa  248  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  38.08 
 
 
794 aa  248  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.63 
 
 
860 aa  249  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.01 
 
 
791 aa  249  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0973  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.59 
 
 
1064 aa  249  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3277  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.43 
 
 
741 aa  248  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3821  Cache sensor hybrid histidine kinase  37.38 
 
 
759 aa  248  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  38.46 
 
 
1560 aa  248  4e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.11 
 
 
911 aa  247  5e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.49 
 
 
1407 aa  246  9e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3498  two component sensor kinase  35.1 
 
 
1125 aa  246  9e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  35.24 
 
 
735 aa  246  1e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  38.68 
 
 
651 aa  246  1e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>