155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0068 on replicon NC_011885
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011885  Cyan7425_0068  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
486 aa  997    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4188  extracellular solute-binding protein  47.35 
 
 
465 aa  431  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6832  putative ABC transporter substrate-binding protein  34.47 
 
 
460 aa  301  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0145789  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3687  extracellular solute-binding protein family 1  34 
 
 
461 aa  290  5.0000000000000004e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3529  extracellular solute-binding protein  34.49 
 
 
458 aa  283  7.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00601615  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1243  extracellular solute-binding protein  33.19 
 
 
461 aa  282  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1393  extracellular solute-binding protein  34.9 
 
 
461 aa  280  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.435309  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2928  extracellular solute-binding protein  32.57 
 
 
458 aa  266  8.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.486606 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1619  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 
450 aa  94  5e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1413  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 
436 aa  93.2  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0822  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 
436 aa  89.7  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1258  twin-arginine translocation pathway signal  24.41 
 
 
442 aa  89  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0502  extracellular solute-binding protein  22.2 
 
 
437 aa  89  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0531  extracellular solute-binding protein family 1  23.34 
 
 
437 aa  80.5  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5337  extracellular solute-binding protein family 1  21.23 
 
 
434 aa  79.7  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.122337 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2892  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 
436 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  20.8 
 
 
438 aa  78.6  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4328  extracellular solute-binding protein  21.34 
 
 
434 aa  78.2  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0170975 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5713  extracellular solute-binding protein family 1  21.14 
 
 
434 aa  77.8  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3646  twin-arginine translocation pathway signal  23.01 
 
 
441 aa  75.1  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.17089  normal  0.182494 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2910  twin-arginine translocation pathway signal  24.55 
 
 
490 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0986419  normal  0.0603659 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2546  twin-arginine translocation pathway signal  24.45 
 
 
461 aa  73.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 
411 aa  72  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  24.73 
 
 
428 aa  70.1  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2097  twin-arginine translocation pathway signal  23.04 
 
 
441 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.380982  hitchhiker  0.00612544 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  22.66 
 
 
410 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0127  extracellular solute-binding protein family 1  23.06 
 
 
442 aa  63.9  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  21.6 
 
 
424 aa  63.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3960  extracellular solute-binding protein family 1  21.92 
 
 
441 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  23.24 
 
 
424 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3322  twin-arginine translocation pathway signal  22.22 
 
 
441 aa  60.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  22.47 
 
 
412 aa  60.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  22.02 
 
 
401 aa  60.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4117  ABC transporter substrate-binding protein, periplasmic component  22.59 
 
 
446 aa  58.9  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.16072  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  22.88 
 
 
421 aa  58.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  26.01 
 
 
427 aa  57.8  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  22.01 
 
 
412 aa  57.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  21.15 
 
 
422 aa  57.4  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  20.5 
 
 
459 aa  57.4  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  22.15 
 
 
459 aa  57  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0475  extracellular solute-binding protein family 1  21.28 
 
 
397 aa  57  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  21.01 
 
 
420 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2057  extracellular solute-binding protein family 1  23.34 
 
 
421 aa  55.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112802  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5306  extracellular solute-binding protein  22.15 
 
 
431 aa  55.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  21.82 
 
 
426 aa  53.9  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0074  extracellular solute-binding protein  22.9 
 
 
429 aa  53.9  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4989  extracellular solute-binding protein family 1  21.21 
 
 
436 aa  53.5  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192631  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  23.18 
 
 
411 aa  53.1  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3554  putative ABC transporter periplasmic-binding protein  22.16 
 
 
440 aa  53.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263542  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.18 
 
 
366 aa  53.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  20.54 
 
 
423 aa  53.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 
441 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1353  extracellular solute-binding protein family 1  21.47 
 
 
434 aa  53.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6240  ABC transporter substrate binding protein (maltose)  21.97 
 
 
407 aa  53.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0994607  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1321  extracellular solute-binding protein family 1  23 
 
 
410 aa  53.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 
410 aa  52.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  21.5 
 
 
427 aa  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6732  extracellular solute-binding protein family 1  22.9 
 
 
425 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255639  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2958  extracellular solute-binding protein family 1  22.8 
 
 
410 aa  51.6  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.347864  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2305  extracellular solute-binding protein  18.06 
 
 
459 aa  52  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 
446 aa  51.6  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  22.09 
 
 
415 aa  51.2  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  21.03 
 
 
522 aa  51.2  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  22.18 
 
 
411 aa  51.2  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1524  extracellular solute-binding protein family 1  22.63 
 
 
439 aa  50.8  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  27.55 
 
 
420 aa  50.8  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  27.55 
 
 
420 aa  50.8  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2338  maltose-binding periplasmic protein precursor  25.56 
 
 
408 aa  50.4  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  23.62 
 
 
410 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2297  extracellular solute-binding protein  20.05 
 
 
422 aa  50.1  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  20.87 
 
 
399 aa  50.1  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  18.66 
 
 
421 aa  49.7  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0699  extracellular solute-binding protein  21.6 
 
 
443 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  22.88 
 
 
410 aa  49.7  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2652  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, maltose/maltodextrin-binding protein  24.87 
 
 
408 aa  50.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  21.27 
 
 
414 aa  50.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3883  maltose/maltodextrin ABC transporter periplasmic maltose/maltodextrin-binding protein  24.78 
 
 
411 aa  49.7  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.265603 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0968  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 
411 aa  49.7  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155665  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01287  predicted sugar transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  21.17 
 
 
430 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2336  extracellular solute-binding protein family 1  21.17 
 
 
430 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01298  hypothetical protein  21.17 
 
 
430 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  22.9 
 
 
410 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3306  extracellular solute-binding protein  21.69 
 
 
431 aa  48.9  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0914  maltose/maltodextrin ABC transporter, periplasmic maltose/maltodextrin-binding protein  24.78 
 
 
411 aa  49.3  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.459005  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1425  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  21.17 
 
 
430 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2315  extracellular solute-binding protein  21.17 
 
 
430 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62001  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2659  extracellular solute-binding protein family 1  20.92 
 
 
431 aa  48.5  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00136924  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3119  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  21.24 
 
 
442 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.657036  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1206  twin-arginine translocation pathway signal  20.63 
 
 
446 aa  48.5  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5858  extracellular solute-binding protein  22.67 
 
 
435 aa  48.5  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.437643  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  19.81 
 
 
422 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1520  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  21.17 
 
 
430 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  19.81 
 
 
422 aa  48.5  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0013  extracellular solute-binding protein family 1  25.41 
 
 
511 aa  48.5  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.957035  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  19.81 
 
 
422 aa  48.5  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1812  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  22.22 
 
 
430 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1120  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  21.96 
 
 
419 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000383609  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  20.23 
 
 
419 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4644  extracellular solute-binding protein  21 
 
 
409 aa  48.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0265502  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  21.65 
 
 
420 aa  47.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.228974 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>