92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0064 on replicon NC_011885
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2696  homocysteine S-methyltransferase  98.44 
 
 
328 aa  659  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274652 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0064  homocysteine S-methyltransferase  100 
 
 
328 aa  684  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1107  homocysteine S-methyltransferase  61.09 
 
 
313 aa  386  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0120891  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0984  homocysteine S-methyltransferase  56.23 
 
 
315 aa  362  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0597  homocysteine S-methyltransferase  54.63 
 
 
322 aa  356  4e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0624  homocysteine S-methyltransferase  56.59 
 
 
312 aa  354  9e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.537919  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5017  homocysteine S-methyltransferase  54.02 
 
 
312 aa  350  1e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2467  homocysteine S-methyltransferase  55.41 
 
 
330 aa  347  2e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0417  homocysteine S-methyltransferase  54.17 
 
 
314 aa  345  6e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0769316  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3671  homocysteine S-methyltransferase  52.73 
 
 
316 aa  335  5e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0089  homocysteine S-methyltransferase  53.7 
 
 
312 aa  335  7e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.898737  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6335  homocysteine S-methyltransferase  45.82 
 
 
307 aa  272  6e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0740  homocysteine S-methyltransferase  45.85 
 
 
311 aa  270  2e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1304  homocysteine S-methyltransferase  43.88 
 
 
311 aa  246  4e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.652458  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1943  putative homocysteine/selenocysteine methylase  41.75 
 
 
319 aa  234  1e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3324  homocysteine S-methyltransferase  35.69 
 
 
319 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1327  homocysteine S-methyltransferase domain-containing protein  34.15 
 
 
318 aa  160  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5337  homocysteine S-methyltransferase  32 
 
 
319 aa  143  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3632  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  26.11 
 
 
617 aa  65.5  1e-09  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0405  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  25.4 
 
 
613 aa  63.2  7e-09  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0415  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  25.4 
 
 
613 aa  63.2  7e-09  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37350  homocysteine methyltransferase  24.57 
 
 
295 aa  60.5  4e-08  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.493269 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0324  homocysteine S-methyltransferase  25.31 
 
 
413 aa  59.7  7e-08  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  25.79 
 
 
804 aa  57.4  3e-07  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  23.82 
 
 
1191 aa  57.4  4e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  3.69495e-05 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1535  homocysteine methyltransferase  23.6 
 
 
315 aa  57  4e-07  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.521433  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2200  homocysteine S-methyltransferase  23.33 
 
 
307 aa  56.6  5e-07  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558388  normal  0.514236 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2547  methionine synthase I  27.8 
 
 
340 aa  57  5e-07  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.946299 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  24.38 
 
 
807 aa  56.6  6e-07  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1146  homocysteine methyltransferase  24.37 
 
 
319 aa  56.6  6e-07  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617566 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0073  homocysteine S-methyltransferase  26.4 
 
 
290 aa  55.8  1e-06  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1042  homocysteine methyltransferase  23.79 
 
 
310 aa  55.5  1e-06  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  3.41653e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  22.77 
 
 
793 aa  54.7  2e-06  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2926  homocysteine methyltransferase  22.94 
 
 
313 aa  53.5  5e-06  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3471  homocysteine methyltransferase  24.76 
 
 
312 aa  53.5  5e-06  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1524  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  23.86 
 
 
615 aa  52  1e-05  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2815  homocysteine S-methyltransferase  24.76 
 
 
304 aa  52  1e-05  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  25.74 
 
 
804 aa  52.4  1e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  27.91 
 
 
811 aa  51.6  2e-05  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  26.34 
 
 
813 aa  50.8  3e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3952  methionine synthase I  25.26 
 
 
319 aa  50.8  3e-05  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225692  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12483  homocysteine methyltransferase  25.96 
 
 
302 aa  50.8  3e-05  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  29.61 
 
 
1136 aa  50.8  3e-05  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  30.87 
 
 
1136 aa  50.4  4e-05  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  23.05 
 
 
819 aa  50.1  5e-05  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0828  homocysteine methyltransferase  28.24 
 
 
311 aa  50.1  5e-05  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1771  methionine synthase I  27.98 
 
 
337 aa  50.1  6e-05  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  normal  0.0676063 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  25 
 
 
800 aa  49.3  8e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  22.99 
 
 
1191 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  22.99 
 
 
1191 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3344  homocysteine S-methyltransferase  24.88 
 
 
310 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0708  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  22.87 
 
 
616 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0266464  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3865  homocysteine S-methyltransferase  25.96 
 
 
300 aa  48.5  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0866  homocysteine methyltransferase  24.13 
 
 
316 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.142005  normal  0.135969 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  26.38 
 
 
1176 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1764  B12-dependent methionine synthase  31.87 
 
 
1304 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.075059  normal  0.0106397 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1700  methionine synthase  33.33 
 
 
1171 aa  46.6  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  23.6 
 
 
1208 aa  46.2  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1277  homocysteine S-methyltransferase  25.56 
 
 
300 aa  46.6  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0441893 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4837  homocysteine S-methyltransferase  27.67 
 
 
309 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.345042 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0283  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  23.57 
 
 
615 aa  46.2  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4224  B12-dependent methionine synthase  30.71 
 
 
1293 aa  45.8  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.572954  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1115  B12-dependent methionine synthase  27.35 
 
 
1241 aa  45.8  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  25.31 
 
 
841 aa  45.8  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4282  homocysteine S-methyltransferase  24.38 
 
 
309 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  24.74 
 
 
791 aa  45.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0035  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  22.04 
 
 
612 aa  45.4  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  24.8 
 
 
1223 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3243  homocysteine S-methyltransferase  25.64 
 
 
300 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.562987  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3739  B12-dependent methionine synthase  28.74 
 
 
1252 aa  45.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  25.12 
 
 
1132 aa  45.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  24.9 
 
 
1182 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05821  homocysteine S-methyltransferase  24.88 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  25.1 
 
 
804 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40670  B12-dependent methionine synthase  30.08 
 
 
1234 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0754274  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0167  homocysteine S-methyltransferase  24.36 
 
 
348 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3541  B12-dependent methionine synthase  29.79 
 
 
1293 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0988023  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3449  B12-dependent methionine synthase  30.08 
 
 
1234 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.625644  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  28.67 
 
 
1169 aa  44.3  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  25.83 
 
 
1208 aa  44.3  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  24.36 
 
 
1183 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0172  B12-dependent methionine synthase  25.49 
 
 
1239 aa  43.9  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.432955  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0333  putative methionine synthase  24.9 
 
 
1182 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3735  B12-dependent methionine synthase  29.81 
 
 
1286 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.391435  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0172  methionine synthase (B12-dependent)  23.61 
 
 
348 aa  43.5  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.727422  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  22.11 
 
 
774 aa  43.5  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  28.8 
 
 
816 aa  43.5  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  4.03798e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3100  homocysteine S-methyltransferase  30.67 
 
 
300 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5287  methionine synthase  28.57 
 
 
1266 aa  43.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212227  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3090  homocysteine S-methyltransferase  30.67 
 
 
300 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1315  homocysteine S-methyltransferase  25.22 
 
 
288 aa  42.4  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0420975  normal  0.31637 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1372  methionine synthase (B12-dependent)  23.12 
 
 
1190 aa  42.4  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.477278 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>