More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0060 on replicon NC_011885
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011885  Cyan7425_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  100 
 
 
252 aa  519  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.34 
 
 
250 aa  205  6e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4557  hypothetical protein  48.18 
 
 
247 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278817  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1652  hypothetical protein  44.49 
 
 
255 aa  189  3e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27560  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  43.03 
 
 
258 aa  186  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.235843  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0228  NmrA family protein  40.71 
 
 
255 aa  186  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8718  NmrA family protein  42.35 
 
 
256 aa  185  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  hitchhiker  0.00954025 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5088  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.54 
 
 
264 aa  183  2e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1698  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.34 
 
 
259 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.8 
 
 
275 aa  172  6e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3102  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.65 
 
 
248 aa  161  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.346824  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.56 
 
 
248 aa  155  5e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4107  NmrA family protein  35.8 
 
 
269 aa  149  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.824515 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4049  hypothetical protein  39.04 
 
 
261 aa  134  1e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000562723  normal  0.100478 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05170  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  35.06 
 
 
251 aa  132  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2101  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.53 
 
 
244 aa  129  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5577  NmrA family protein  35.97 
 
 
251 aa  126  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1560  hypothetical protein  39.46 
 
 
263 aa  126  4e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0351056  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4675  NmrA family protein  36.24 
 
 
254 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.764449 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3992  NmrA family protein  37.61 
 
 
248 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5821  NmrA family protein  33.99 
 
 
250 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35 
 
 
258 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.716316  hitchhiker  4.15542e-08 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35 
 
 
258 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0611  NmrA family protein  35.35 
 
 
253 aa  122  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3321  NmrA family protein  36.73 
 
 
279 aa  121  1e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3002  NmrA family protein  34.26 
 
 
249 aa  120  2e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.284221  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4738  NmrA family protein  32.55 
 
 
254 aa  119  5e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210315  normal  0.761332 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3222  NmrA family protein  34.88 
 
 
264 aa  116  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0940  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.95 
 
 
253 aa  116  4e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.681358  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5446  NmrA family protein  31.89 
 
 
267 aa  115  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2275  NmrA-like  35.78 
 
 
251 aa  114  1e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.489802  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5747  NmrA family protein  34.42 
 
 
247 aa  114  2e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9038  hypothetical protein  34.72 
 
 
247 aa  114  2e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1995  NmrA family protein  34.11 
 
 
255 aa  113  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1579  NAD-dependent epimerase/dehydratase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase:NmrA-like  34.63 
 
 
250 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5436  hypothetical protein  39.63 
 
 
244 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5558  NmrA family protein  35.81 
 
 
247 aa  111  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5255  NmrA-like  33.07 
 
 
251 aa  111  1e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7641  NmrA family protein  36.05 
 
 
251 aa  111  1e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0787849  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5604  NmrA family protein  33.07 
 
 
251 aa  111  1e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5787  NmrA family protein  34.88 
 
 
247 aa  111  1e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4281  NmrA family protein  35.65 
 
 
250 aa  110  2e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5191  NmrA family protein  34.88 
 
 
250 aa  110  2e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0102681  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.65 
 
 
251 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3574  NmrA family protein  38.18 
 
 
244 aa  109  4e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.764024 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2517  NmrA family protein  33.49 
 
 
251 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192065  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2773  NmrA family protein  33.33 
 
 
251 aa  108  7e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.298271  normal  0.534883 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4624  NmrA family protein  34.58 
 
 
251 aa  108  9e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000639596 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4349  NmrA family protein  33.49 
 
 
250 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.971724  normal  0.637435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5169  NmrA-like protein  34.7 
 
 
251 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269967  hitchhiker  0.0024207 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5460  NmrA family protein  33.99 
 
 
250 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13563  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1115  NmrA-like  31.3 
 
 
273 aa  106  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  1.2808e-05 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5436  NmrA family protein  36.87 
 
 
251 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.63 
 
 
246 aa  105  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01680  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  35 
 
 
253 aa  104  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576893  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4579  NmrA family protein  34.9 
 
 
250 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.421298 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4584  NmrA family protein  34.9 
 
 
250 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.907742 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3956  GCN5-related N-acetyltransferase  35.8 
 
 
402 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0442969 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5937  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.48 
 
 
254 aa  102  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2094  NmrA family protein  36.07 
 
 
246 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2341  NmrA family protein  34.7 
 
 
251 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.49 
 
 
251 aa  99.4  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.349092 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0904  NmrA family protein  34.12 
 
 
246 aa  98.2  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.705633  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1606  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.31 
 
 
482 aa  97.8  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2861  NmrA family protein  31.8 
 
 
266 aa  96.7  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2924  NmrA-like  33.33 
 
 
250 aa  96.7  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0991  NmrA family protein  34.62 
 
 
243 aa  94.7  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20710  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  31.36 
 
 
251 aa  94  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1279  hypothetical protein  37.93 
 
 
312 aa  94  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0266126  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4374  hypothetical protein  33.19 
 
 
244 aa  94  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.04339  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.64 
 
 
308 aa  93.2  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5001  NmrA family protein  32.87 
 
 
252 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7959  NmrA family protein  31.19 
 
 
252 aa  90.1  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.757877  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0905  NmrA family protein  32.09 
 
 
251 aa  88.2  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.596498  normal  0.269728 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1322  NmrA family protein  30.74 
 
 
513 aa  87  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.180223  normal  0.0774954 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.58 
 
 
325 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.99 
 
 
301 aa  86.3  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05940  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  30.31 
 
 
252 aa  85.5  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511116  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  24.37 
 
 
302 aa  83.6  2e-15  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.64 
 
 
320 aa  84  2e-15  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.27 
 
 
296 aa  83.6  3e-15  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.89 
 
 
309 aa  83.2  4e-15  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.46 
 
 
298 aa  82.8  5e-15  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0487  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.61 
 
 
305 aa  82  8e-15  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00126012  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1442  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.33 
 
 
327 aa  82  8e-15  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229904  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.23 
 
 
301 aa  82  9e-15  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  6.31185e-07 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.58 
 
 
306 aa  81.6  1e-14  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.34 
 
 
459 aa  80.9  2e-14  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0520232 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  25.54 
 
 
327 aa  80.5  3e-14  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.35 
 
 
320 aa  80.1  3e-14  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7062  NmrA family protein  29.36 
 
 
512 aa  80.5  3e-14  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 
296 aa  79.7  4e-14  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.527248  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.68 
 
 
249 aa  79.3  5e-14  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40627  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  27.27 
 
 
332 aa  79  7e-14  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.82 
 
 
326 aa  78.6  8e-14  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000218299  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5307  NmrA family protein  31.51 
 
 
254 aa  78.6  9e-14  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.37 
 
 
302 aa  78.6  9e-14  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219396  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4925  NmrA-like protein  31.67 
 
 
252 aa  78.2  1e-13  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5014  NmrA family protein  31.67 
 
 
252 aa  78.2  1e-13  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.519146  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0761  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.05 
 
 
324 aa  77.8  2e-13  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.926297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>