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for query gene Cyan7425_0056 on replicon NC_011885
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
198 aa  404  1e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
205 aa  152  3e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  41.62 
 
 
200 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  41.62 
 
 
200 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 
191 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  40.22 
 
 
289 aa  135  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  38.97 
 
 
236 aa  131  8e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  37.95 
 
 
218 aa  89.4  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
214 aa  81.3  9e-15  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
202 aa  76.6  2e-13  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 
226 aa  75.5  4e-13  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 
210 aa  74.3  1e-12  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  40.16 
 
 
214 aa  73.6  2e-12  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  33.07 
 
 
207 aa  72.8  3e-12  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2444  TetR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
217 aa  71.6  7e-12  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  30.87 
 
 
206 aa  71.6  7e-12  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
202 aa  71.2  1e-11  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
244 aa  70.5  2e-11  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
232 aa  69.7  2e-11  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 
209 aa  70.1  2e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
234 aa  70.1  2e-11  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 
212 aa  70.1  2e-11  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  32.85 
 
 
206 aa  69.3  3e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  35.25 
 
 
213 aa  69.7  3e-11  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 
210 aa  69.3  3e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
273 aa  69.3  3e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3682  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
540 aa  69.3  3e-11  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0191871  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 
208 aa  68.9  4e-11  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  31.95 
 
 
213 aa  68.6  5e-11  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  35.83 
 
 
221 aa  68.2  7e-11  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
247 aa  68.2  8e-11  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
247 aa  68.2  8e-11  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
210 aa  68.2  8e-11  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
212 aa  68.2  8e-11  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  26.53 
 
 
228 aa  67.8  9e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
242 aa  67.4  1e-10  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
207 aa  67.8  1e-10  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  31.01 
 
 
207 aa  67.4  1e-10  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
213 aa  67.4  1e-10  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
216 aa  66.6  2e-10  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 
228 aa  67  2e-10  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 
210 aa  66.2  3e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
219 aa  66.2  3e-10  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 
209 aa  66.2  3e-10  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 
207 aa  65.5  4e-10  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
225 aa  65.5  5e-10  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 
220 aa  65.1  6e-10  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 
207 aa  65.1  6e-10  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 
207 aa  65.1  6e-10  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 
233 aa  65.1  6e-10  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
204 aa  65.1  7e-10  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 
217 aa  65.1  7e-10  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 
209 aa  65.1  7e-10  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 
220 aa  65.1  7e-10  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 
225 aa  64.7  9e-10  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5253  transcriptional regulator, TetR family  37.3 
 
 
215 aa  64.7  9e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  32.8 
 
 
209 aa  64.7  9e-10  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
266 aa  64.7  9e-10  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 
222 aa  64.3  1e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 
238 aa  63.9  1e-09  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 
231 aa  63.9  1e-09  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  33.33 
 
 
220 aa  64.3  1e-09  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 
218 aa  63.2  2e-09  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
214 aa  63.2  2e-09  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
225 aa  63.5  2e-09  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
220 aa  63.5  2e-09  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 
192 aa  63.2  2e-09  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  28.8 
 
 
246 aa  62.8  3e-09  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  28.14 
 
 
205 aa  63.2  3e-09  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
214 aa  62.8  3e-09  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  39.67 
 
 
217 aa  62.8  3e-09  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
228 aa  62.8  3e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5533  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 
215 aa  62.8  4e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374337  normal  0.0421471 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1709  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
224 aa  62.4  4e-09  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.400859  normal  0.0301663 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
207 aa  62.8  4e-09  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
218 aa  62  5e-09  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 
255 aa  62  5e-09  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 
221 aa  61.6  6e-09  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
209 aa  62  6e-09  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
210 aa  62  6e-09  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 
247 aa  62  6e-09  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  39.67 
 
 
217 aa  62  6e-09  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3517  transcriptional regulator protein  30.53 
 
 
208 aa  61.6  7e-09  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873146  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  30.3 
 
 
227 aa  61.6  7e-09  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
212 aa  61.2  9e-09  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
235 aa  61.2  9e-09  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
211 aa  61.2  9e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3711  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
420 aa  60.8  1e-08  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0336995  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3896  transcriptional regulator, TetR family  33.62 
 
 
211 aa  60.8  1e-08  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  37.19 
 
 
216 aa  60.8  1e-08  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
214 aa  61.2  1e-08  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 
207 aa  60.5  1e-08  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 
207 aa  60.5  1e-08  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  28.99 
 
 
207 aa  60.8  1e-08  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 
221 aa  60.8  1e-08  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  58.82 
 
 
204 aa  60.5  1e-08  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 
220 aa  60.8  1e-08  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
208 aa  60.8  1e-08  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0518509 
 
 
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NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
195 aa  60.8  1e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007778  RPB_3273  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
210 aa  60.5  1e-08  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.346529  normal  0.756983 
 
 
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