34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0020 on replicon NC_011885
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011885  Cyan7425_0020  ChaB family protein  100 
 
 
68 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2443  ChaB  60.61 
 
 
76 aa  75.9  2e-13  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2785  ChaB  55.22 
 
 
68 aa  74.7  4e-13  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.167104  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1848  ChaB family protein  50.65 
 
 
76 aa  72  3e-12  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2406  cation transport regulator  50 
 
 
76 aa  70.9  6e-12  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  1.58278e-05 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1923  cation transport regulator  50 
 
 
76 aa  70.9  6e-12  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.41011  normal  0.0497517 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01195  cation transport regulator  50 
 
 
76 aa  70.9  6e-12  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1700  cation transport regulator  50 
 
 
76 aa  70.9  6e-12  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.692804  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01205  hypothetical protein  50 
 
 
76 aa  70.9  6e-12  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2429  ChaB family protein  50 
 
 
76 aa  70.9  6e-12  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.40977  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1325  cation transport regulator  50 
 
 
76 aa  70.9  6e-12  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.109112  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1384  cation transport regulator  50 
 
 
76 aa  68.9  2e-11  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.886338  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1367  cation transport regulator  50 
 
 
76 aa  68.9  2e-11  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0817532  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2331  cation transport regulator  54.41 
 
 
76 aa  69.3  2e-11  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.704866  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2071  ChaB  52.24 
 
 
74 aa  68.6  3e-11  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0461  putative cation transport regulato, ChaB  48.53 
 
 
76 aa  68.2  4e-11  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0295  hypothetical protein  47.95 
 
 
78 aa  67.4  6e-11  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.152807 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3607  ChaB  47.95 
 
 
76 aa  67.4  7e-11  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0044472  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0349  ChaB  53.12 
 
 
78 aa  67  8e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108518 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1553  cation transport regulator  49.28 
 
 
76 aa  65.5  3e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.203336 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1369  cation transport regulator  50 
 
 
76 aa  64.7  4e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.760537  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1907  cation transport regulator  50 
 
 
76 aa  64.7  4e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1965  cation transport regulator  50 
 
 
76 aa  64.7  4e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.640932 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1901  cation transport regulator  50 
 
 
76 aa  64.7  4e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.903539  normal  0.252452 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0379  ChaB family protein  54.84 
 
 
73 aa  63.2  1e-09  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.303727  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0930  ChaB family protein  46.99 
 
 
82 aa  62  3e-09  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.176376  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3951  ChaB family protein  42.65 
 
 
82 aa  57  7e-08  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.385591  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0812  ChaB  41.79 
 
 
81 aa  54.3  5e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0519  ChaB family protein  43.28 
 
 
81 aa  53.1  1e-06  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4814  ChaB family protein  38.81 
 
 
81 aa  50.8  6e-06  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.442759  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0323  putative cation transport regulator  50 
 
 
56 aa  47  9e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.262296 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0871  ChaB family protein  43.55 
 
 
140 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1656  ChaB family protein  41.27 
 
 
69 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.572476  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4587  ChaB family protein  42.11 
 
 
138 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>