More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0013 on replicon NC_011885
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
388 aa  745  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  39.19 
 
 
397 aa  269  7e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 
381 aa  262  8e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  36.84 
 
 
421 aa  231  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1855  major facilitator superfamily protein  31.98 
 
 
423 aa  199  5e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.14226  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2059  major facilitator superfamily protein  31.71 
 
 
423 aa  198  1e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1679  major facilitator superfamily protein  31.71 
 
 
423 aa  197  2e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  33.77 
 
 
414 aa  196  6e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  36.87 
 
 
373 aa  189  9e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  35.15 
 
 
414 aa  187  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3203  major facilitator family transporter  35.34 
 
 
396 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  35.43 
 
 
404 aa  186  9e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0679  major facilitator transporter  42.81 
 
 
357 aa  184  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2112  major facilitator transporter  35.41 
 
 
408 aa  173  5e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3196  major facilitator transporter  35.06 
 
 
414 aa  170  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6118  major facilitator transporter  34.2 
 
 
409 aa  164  2e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  33.24 
 
 
403 aa  162  8e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  32.39 
 
 
402 aa  158  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5599  MFS permease  31.01 
 
 
409 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0103411  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6406  major facilitator transporter  34.78 
 
 
409 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6916  major facilitator transporter  34.49 
 
 
409 aa  146  7e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4891  major facilitator transporter  34.49 
 
 
409 aa  146  7e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390253  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3273  major facilitator transporter  34.49 
 
 
409 aa  146  7e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0542458 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0711  major facilitator transporter  29.23 
 
 
410 aa  132  1e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 
404 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 
385 aa  123  6e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 
411 aa  112  8e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2079  major facilitator transporter  29.89 
 
 
423 aa  112  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.816032  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 
388 aa  111  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 
400 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  28.49 
 
 
384 aa  103  7e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3637  major facilitator transporter  26.36 
 
 
405 aa  102  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476152  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 
391 aa  97.4  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  1.91868e-06  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3739  major facilitator transporter  27.12 
 
 
403 aa  93.6  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  26.65 
 
 
388 aa  93.2  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 
394 aa  90.9  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  26.69 
 
 
415 aa  90.1  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  23.03 
 
 
405 aa  88.6  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  28.2 
 
 
399 aa  85.5  1e-15  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  24.6 
 
 
386 aa  85.5  1e-15  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 
383 aa  85.5  1e-15  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1574  major facilitator superfamily permease  28.05 
 
 
403 aa  84.3  3e-15  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2090  major facilitator transporter  26.99 
 
 
410 aa  81.6  2e-14  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106737  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 
439 aa  78.2  2e-13  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2576  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 
420 aa  78.6  2e-13  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.309715  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3218  major facilitator transporter  24.23 
 
 
385 aa  77.8  3e-13  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21760  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 
400 aa  75.5  1e-12  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1860  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 
407 aa  75.9  1e-12  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.209124 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  26.11 
 
 
408 aa  72.4  1e-11  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1778  major facilitator transporter  30.41 
 
 
474 aa  72.4  1e-11  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  9.29318e-05  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0874  major facilitator superfamily permease  23.6 
 
 
399 aa  72.4  1e-11  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0134  major facilitator superfamily permease  27.41 
 
 
332 aa  71.6  2e-11  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1678  major facilitator transporter  25.07 
 
 
474 aa  70.5  4e-11  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 
397 aa  70.9  4e-11  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  23.84 
 
 
406 aa  70.5  5e-11  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  28.37 
 
 
487 aa  70.1  7e-11  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  2.09922e-09  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 
387 aa  69.7  7e-11  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  3.58317e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3646  major facilitator transporter  26.53 
 
 
410 aa  70.1  7e-11  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0827  major facilitator superfamily permease  25.9 
 
 
392 aa  69.7  9e-11  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  26.98 
 
 
405 aa  69.3  1e-10  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0734  major facilitator superfamily permease  26.27 
 
 
401 aa  69.3  1e-10  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00142824  normal  0.0126136 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  26.96 
 
 
406 aa  69.3  1e-10  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0383  major facilitator superfamily permease  24.52 
 
 
396 aa  67.8  3e-10  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  34.15 
 
 
392 aa  67  5e-10  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  5.24014e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1308  major facilitator transporter  26.27 
 
 
404 aa  66.2  8e-10  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000644714  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0207  major facilitator superfamily permease  26.37 
 
 
387 aa  65.1  2e-09  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000553672  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 
399 aa  65.1  2e-09  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1990  putative multidrug resistance protein  26.06 
 
 
409 aa  64.3  3e-09  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.492861  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1096  major facilitator transporter  25.94 
 
 
399 aa  64.7  3e-09  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  32.09 
 
 
396 aa  64.3  3e-09  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 
408 aa  64.7  3e-09  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  34.9 
 
 
414 aa  64.3  4e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  24.79 
 
 
421 aa  64.3  4e-09  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  34.39 
 
 
421 aa  63.9  5e-09  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2058  major facilitator transporter  30.33 
 
 
471 aa  63.5  5e-09  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.844529 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1543  major facilitator transporter  21.68 
 
 
405 aa  63.5  5e-09  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  8.74493e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 
414 aa  63.9  5e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2281  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.65 
 
 
412 aa  63.9  5e-09  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.1602e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  24.67 
 
 
411 aa  62.4  1e-08  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  21.38 
 
 
387 aa  62.4  1e-08  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  26.36 
 
 
435 aa  62.4  1e-08  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 
411 aa  62.4  1e-08  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.09307e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1767  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 
399 aa  61.6  2e-08  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18145 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.42 
 
 
410 aa  62  2e-08  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  24.15 
 
 
415 aa  62  2e-08  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  24.05 
 
 
391 aa  62  2e-08  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0010  multidrug-efflux transporter  24.17 
 
 
430 aa  61.2  3e-08  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  35.15 
 
 
408 aa  61.2  3e-08  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2685  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 
400 aa  60.8  4e-08  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1857  major facilitator transporter  29.69 
 
 
566 aa  60.8  4e-08  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.906774  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1015  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.61 
 
 
561 aa  60.8  4e-08  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  25.7 
 
 
422 aa  60.8  4e-08  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  28.08 
 
 
455 aa  60.8  4e-08  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  27.6 
 
 
426 aa  60.8  4e-08  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  1.11783e-05  unclonable  7.56922e-10 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  34.22 
 
 
426 aa  60.5  5e-08  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1022  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 
479 aa  60.5  5e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.333797  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1851  major facilitator transporter  28.25 
 
 
409 aa  60.5  5e-08  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29974  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  29.5 
 
 
401 aa  60.5  5e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  27.27 
 
 
449 aa  60.1  6e-08  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.54 
 
 
400 aa  60.1  7e-08  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>