More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0008 on replicon NC_011885
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011885  Cyan7425_0008  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 195 aa  396  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.643837 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5205  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 194 aa  143  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.278778  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 204 aa  62  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2437  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 216 aa  62  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  47.69 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 330 aa  58.2  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3730  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  23.92 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  41.1 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  26.47 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 332 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0550  regulatory protein, TetR  37.65 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3211  regulatory protein, TetR  45.45 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0245  transcriptional regulator  39.68 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  44.44 
 
 		 186 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  44.44 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  24.55 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2368  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000142624 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  25.37 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 183 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 209 aa  52.4  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  20.94 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2259  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  23.28 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 209 aa  52  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 209 aa  52  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3483  TetR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 218 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 197 aa  52  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 193 aa  52  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 297 aa  51.6  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 202 aa  51.6  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  43.55 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 217 aa  52  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 225 aa  52  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2506  transcriptional regulator, TetR family  23.32 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.733789  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 212 aa  51.6  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  36.11 
 
 		 226 aa  51.6  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 189 aa  51.6  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 216 aa  51.6  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0388  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 249 aa  51.6  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 273 aa  51.6  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0503  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 193 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2680  transcriptional regulator  29.37 
 
 		 198 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.291962  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 210 aa  51.2  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  25.26 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2010  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 193 aa  50.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.267977  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0370  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0503  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>