More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0001 on replicon NC_011885
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011885  Cyan7425_0001  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
516 aa  1060  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.743652 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1257  AMP-dependent synthetase and ligase  43.71 
 
 
518 aa  466  1e-130  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0553  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 
527 aa  259  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0361  acyl-CoA synthetase  30.83 
 
 
577 aa  253  6e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0371  acyl-CoA synthetase  30.83 
 
 
577 aa  253  6e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0341  acyl-CoA synthetase  31.35 
 
 
569 aa  252  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0350  acyl-CoA synthetase  30.63 
 
 
574 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13440  acyl-CoA synthetase  30.71 
 
 
539 aa  251  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0397  acyl-CoA synthetase  30.6 
 
 
564 aa  250  4e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835434  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10274  acyl-CoA synthetase  31.71 
 
 
560 aa  249  1e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0406036 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3694  AMP-dependent synthetase and ligase  33 
 
 
532 aa  244  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178139  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4678  AMP-dependent synthetase and ligase  33.02 
 
 
539 aa  240  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2987  AMP-dependent synthetase and ligase  31.73 
 
 
534 aa  236  7e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.734432  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2427  acyl-CoA synthetase  28.49 
 
 
535 aa  233  5e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206901  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4225  acyl-CoA synthetase  29.24 
 
 
530 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1993  acyl-CoA synthetase  28.97 
 
 
550 aa  229  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0339  AMP-dependent synthetase and ligase  30.1 
 
 
542 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00517119  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3770  acyl-CoA synthetase  29.65 
 
 
548 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3831  acyl-CoA synthetase  29.65 
 
 
548 aa  228  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.948087  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3758  acyl-CoA synthetase  29.65 
 
 
548 aa  228  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102214  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4630  AMP-dependent synthetase and ligase  31.82 
 
 
544 aa  226  6e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4127  acyl-CoA synthetase  27.61 
 
 
540 aa  226  8e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4817  AMP-dependent synthetase and ligase  31.03 
 
 
541 aa  225  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1995  AMP-dependent synthetase and ligase  29.42 
 
 
541 aa  222  1e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4103  AMP-dependent synthetase and ligase  31.84 
 
 
545 aa  219  7e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11456  acyl-CoA synthetase  28.62 
 
 
535 aa  217  5e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0248769 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3854  AMP-dependent synthetase and ligase  29.76 
 
 
550 aa  216  1e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0232  acyl-CoA synthetase  28.65 
 
 
544 aa  211  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253384  normal  0.171828 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0435  acyl-CoA synthetase  28.28 
 
 
544 aa  211  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.232692 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0051  AMP-dependent synthetase and ligase  27.4 
 
 
546 aa  209  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00256371 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  29.72 
 
 
499 aa  189  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4816  AMP-dependent synthetase and ligase  30.25 
 
 
562 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1066  AMP-dependent synthetase and ligase  29.13 
 
 
560 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  27.2 
 
 
515 aa  179  8e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2344  acyl-CoA synthetase  31.23 
 
 
531 aa  178  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657578  decreased coverage  0.0026015 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  27.45 
 
 
522 aa  173  7e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.78 
 
 
486 aa  171  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6898  AMP-dependent synthetase and ligase  28.37 
 
 
536 aa  170  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  27.66 
 
 
505 aa  169  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.94 
 
 
499 aa  168  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0392  O-succinylbenzoate-CoA ligase  25.77 
 
 
498 aa  167  3e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.172525  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  32.31 
 
 
487 aa  168  3e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.91 
 
 
500 aa  166  7e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  27.77 
 
 
510 aa  166  7e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1883  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.05 
 
 
492 aa  166  9e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1847  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.05 
 
 
492 aa  166  9e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1438  acyl-CoA synthetase  26.44 
 
 
549 aa  166  9e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.603543  decreased coverage  1.73613e-06 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  27.92 
 
 
518 aa  166  1e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2862  acyl-CoA synthetase  34.29 
 
 
528 aa  166  1e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0023  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.72 
 
 
494 aa  165  2e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692894  normal  0.83419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  26.44 
 
 
492 aa  165  2e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4949  acyl-CoA synthetase  32.3 
 
 
521 aa  165  2e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131807  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2327  AMP-dependent synthetase and ligase  29.15 
 
 
496 aa  165  2e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.940747  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  26.14 
 
 
532 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4674  acyl-CoA synthetase  27.68 
 
 
531 aa  164  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  27.62 
 
 
527 aa  163  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1672  AMP-dependent synthetase and ligase  30.75 
 
 
491 aa  163  7e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0961293 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3788  acyl-CoA synthetase  27.15 
 
 
523 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  26.38 
 
 
521 aa  162  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.9 
 
 
514 aa  162  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4891  AMP-dependent synthetase and ligase  27.03 
 
 
520 aa  161  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.862065  normal  0.74496 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3890  AMP-dependent synthetase and ligase  28.17 
 
 
517 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0529507  normal  0.227811 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0423  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.31 
 
 
509 aa  159  9e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  26.7 
 
 
508 aa  159  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  26.26 
 
 
513 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0571  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.4 
 
 
490 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.4 
 
 
501 aa  158  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  3.54644e-05 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.05 
 
 
512 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  26.73 
 
 
509 aa  158  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  28.82 
 
 
517 aa  157  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  26.32 
 
 
512 aa  157  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.92 
 
 
497 aa  157  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.92 
 
 
497 aa  157  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  26.59 
 
 
521 aa  157  5e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2385  AMP-dependent synthetase and ligase  26.37 
 
 
502 aa  157  5e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4219  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.94 
 
 
491 aa  157  5e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5528  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.25 
 
 
509 aa  157  5e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  27.54 
 
 
551 aa  157  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  30.2 
 
 
511 aa  157  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3266  AMP-dependent synthetase and ligase  26.81 
 
 
511 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.92 
 
 
513 aa  155  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  25.43 
 
 
514 aa  154  3e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  26.02 
 
 
515 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10216  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.89 
 
 
537 aa  154  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4604  AMP-dependent synthetase and ligase  26.72 
 
 
492 aa  154  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  26.02 
 
 
515 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2485  AMP-dependent synthetase and ligase  28.17 
 
 
534 aa  154  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0972  acyl-CoA synthetase  31.4 
 
 
502 aa  154  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.534904 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1502  acyl-CoA synthetase  26.21 
 
 
515 aa  153  6e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5942  AMP-dependent synthetase and ligase  29.23 
 
 
516 aa  153  6e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  26.36 
 
 
490 aa  153  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0218  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.31 
 
 
516 aa  153  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0925378 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  27.24 
 
 
515 aa  153  8e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  26.65 
 
 
512 aa  153  9e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5079  AMP-dependent synthetase and ligase  27.17 
 
 
511 aa  153  9e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11462  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4820  acyl-CoA synthetase  27.48 
 
 
533 aa  152  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.755365  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.41 
 
 
516 aa  152  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0015  acyl-CoA synthetase  27.08 
 
 
511 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3333  AMP-dependent synthetase and ligase  26.97 
 
 
519 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3146  AMP-dependent synthetase and ligase  27.22 
 
 
533 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.683024  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>