118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_R0011 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_R0011  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0110448 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0025  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0013  tRNA-Thr  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145689  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t10  tRNA-Thr  93.1 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000121578  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0005  tRNA-Thr  93.1 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.134807  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0016  tRNA-Thr  93.1 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000825993  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0017  tRNA-Thr  93.1 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000663854  decreased coverage  0.0000968931 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0012  tRNA-Thr  93.1 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000200408  hitchhiker  0.00313302 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0054  tRNA-Thr  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000720671  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0033  tRNA-Thr  95.92 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0030  tRNA-Thr  94.23 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tThr03  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 79 bp  77.8  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.739012 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0046  tRNA-Thr  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000374178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0042  tRNA-Thr  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000011183  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0399  tRNA-Thr  89.39 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00000357697  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5648  tRNA-Thr  93.88 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000502297  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000184905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000633532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000222462  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0025  tRNA-Thr  95.92 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000411074  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  93.88 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186681  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0034  tRNA-Thr  93.88 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000453984  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0189  tRNA-Thr  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000000579129  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5651  tRNA-Thr  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000701056  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0168  tRNA-Thr  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00852327 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00332161  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0007  tRNA-Thr  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22668  hitchhiker  0.0000658151 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0018  tRNA-Ala  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.916069 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0010  tRNA-Thr  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0535352  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0025  tRNA-Thr  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.821281  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0048  tRNA-Thr  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.397818  normal  0.996159 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0026  tRNA-Thr  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0006  tRNA-Thr  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000288516  hitchhiker  0.0000067546 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0310  tRNA-Thr  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00278593  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0065  tRNA-Thr  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337548 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0042  tRNA-Thr  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000280206  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0034  tRNA-Thr  91.84 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.175686  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5147  tRNA-Thr  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000364084  normal  0.477803 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0035  tRNA-Thr  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0436953  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0052  tRNA-Ala  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.786637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0054  tRNA-Ala  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0042  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0209686  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0055  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000011398  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0013  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0563085  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0003  tRNA-Ala  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0157571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1871  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0184728  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0317  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000144022  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0018  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000226987  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt06  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt06  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0024  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.831109  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0017  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0034  tRNA-Thr  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.49295 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09730  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000000907355  hitchhiker  0.0000119481 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0054  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0047  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R22  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0247278  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0002  tRNA-Ala  88.14 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.716765  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0012  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000603563  normal  0.0893983 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0014  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14002  tRNA-Ala  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0051  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0067  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0193127 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0068  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0550455 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0053  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0059  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0055  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.623624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0041  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0054  tRNA-Thr  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0389191  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0052  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000639553  hitchhiker  0.00795761 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1361  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0038  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000920806  hitchhiker  0.00000030744 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0016  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.35256e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1326  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00274987  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0013  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0369049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0035  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0047  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0039  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0054  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000041401  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0009  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.630653 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t07  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000225857  unclonable  0.000000193462 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t07  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.222466  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0013  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0927028  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0030  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0510531  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0007  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140228  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0012  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.569258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0006  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0010  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376153 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAAlaVIMSS1309124  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.127335  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0006  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAAlaVIMSS1309149  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0382478  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0016  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000237824  normal  0.0237533 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14006  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0190792 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0020  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000056123  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0019  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0144795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0084  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000286992  normal  0.992402 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0028  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0020  tRNA-Thr  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000441917  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0017  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00199817  normal  0.0150591 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>