187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5949 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  100 
 
 
132 aa  247  4e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  47.75 
 
 
114 aa  79.7  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  38.71 
 
 
115 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  34.26 
 
 
115 aa  75.1  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  38.71 
 
 
115 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  38.71 
 
 
119 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  38.71 
 
 
119 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  38.71 
 
 
119 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  38.71 
 
 
119 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  47.17 
 
 
116 aa  75.1  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  38.71 
 
 
119 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  47.17 
 
 
116 aa  75.1  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  39.78 
 
 
115 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  39.78 
 
 
115 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  38.71 
 
 
115 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  35.14 
 
 
117 aa  73.9  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  35.14 
 
 
117 aa  73.9  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  42.86 
 
 
121 aa  72.8  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  37.63 
 
 
115 aa  72  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1863  RNase P protein component  41.18 
 
 
122 aa  70.9  0.000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.546361  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  37.5 
 
 
125 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  37.5 
 
 
125 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  36.27 
 
 
116 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2064  ribonuclease P  40.23 
 
 
116 aa  68.2  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0143582  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  37.61 
 
 
120 aa  67.8  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  42.67 
 
 
116 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  39.53 
 
 
116 aa  66.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  39.76 
 
 
115 aa  66.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1897  ribonuclease P  39.13 
 
 
122 aa  65.1  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.53987e-16  hitchhiker  4.71177e-26 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  32.38 
 
 
109 aa  65.5  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  32.38 
 
 
121 aa  63.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  38.75 
 
 
121 aa  62.8  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  34.19 
 
 
117 aa  62  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  28.7 
 
 
126 aa  62.8  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  37.65 
 
 
109 aa  61.6  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  37.72 
 
 
130 aa  61.6  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  40.96 
 
 
113 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  32.43 
 
 
117 aa  60.8  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  33.91 
 
 
126 aa  60.5  0.000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1331  ribonuclease P protein component  33 
 
 
117 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271159  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  47.13 
 
 
120 aa  59.7  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1355  ribonuclease P protein component  35.05 
 
 
117 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00991852  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  42.35 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  47.25 
 
 
116 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  38.78 
 
 
154 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  36.21 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  46.15 
 
 
116 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  46.15 
 
 
116 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2237  ribonuclease P protein component  42.17 
 
 
109 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.648118  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  34.95 
 
 
111 aa  55.5  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  35.09 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  30.43 
 
 
118 aa  55.5  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  34.88 
 
 
119 aa  55.5  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  32.95 
 
 
111 aa  54.3  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13958  ribonuclease P  34.62 
 
 
125 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  30.28 
 
 
131 aa  54.3  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4203  ribonuclease P protein  34.71 
 
 
123 aa  53.9  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0154701  decreased coverage  0.00202105 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2883  ribonuclease P protein component  39.78 
 
 
123 aa  54.3  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0117467  normal  0.419637 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2602  ribonuclease P protein component  41.18 
 
 
116 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.201057  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4171  ribonuclease P protein component  38.18 
 
 
136 aa  53.5  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00326173  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  36.94 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1919  ribonuclease P protein component  42.67 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.100919  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0890  ribonuclease P protein component  36.54 
 
 
180 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0029715 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3076  hypothetical protein  33.66 
 
 
114 aa  52  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2932  hypothetical protein  33.66 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1542  ribonuclease P protein component  38.54 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.200332  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  30.91 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  38.38 
 
 
130 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2760  ribonuclease P  35.59 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000461705  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682  ribonuclease P protein component  32.89 
 
 
110 aa  50.8  0.000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  27.5 
 
 
107 aa  50.8  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  34.88 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1229  ribonuclease P protein component  43.59 
 
 
122 aa  50.8  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0151351  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  31.97 
 
 
131 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4863  ribonuclease P protein component  36.08 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4984  ribonuclease P protein component  35.96 
 
 
122 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  38.24 
 
 
159 aa  49.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3595  ribonuclease P protein component  39.29 
 
 
124 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183825  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  23.89 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2390  ribonuclease P protein component  29.2 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102633  hitchhiker  0.0000000753131 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1040  ribonuclease P protein component  24.77 
 
 
129 aa  50.1  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1265  ribonuclease P protein component  32.18 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000149389  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2198  ribonuclease P protein component  36.47 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000952989  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0869  ribonuclease P protein component  26.85 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4065  ribonuclease P  31.36 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000140717  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4044  ribonuclease P protein component  39.08 
 
 
152 aa  49.7  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.534814 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2315  ribonuclease P  39.22 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3936  ribonuclease P protein component  44.83 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0766  ribonuclease P protein component  34.71 
 
 
123 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000948284  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  35.96 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3327  ribonuclease P protein component  38.36 
 
 
227 aa  47.8  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.542591  normal  0.0367737 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2762  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 
119 aa  47.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000158886  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4314  ribonuclease P protein component  30.17 
 
 
120 aa  47.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2225  ribonuclease P  39.22 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1256  ribonuclease P protein component  34.52 
 
 
115 aa  47.8  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000286956  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  40.48 
 
 
129 aa  47.4  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4004  ribonuclease P  32.46 
 
 
118 aa  47.4  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119749  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3777  ribonuclease P  31.36 
 
 
118 aa  47.4  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000556747  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0375  ribonuclease P  41.76 
 
 
120 aa  47.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.174091  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4259  ribonuclease P  36.59 
 
 
120 aa  47.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000742435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>