More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5787 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  100 
 
 
358 aa  716    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  59.72 
 
 
356 aa  430  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  59.72 
 
 
358 aa  422  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  56.74 
 
 
355 aa  409  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  55.77 
 
 
355 aa  398  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  55.62 
 
 
355 aa  395  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  55.9 
 
 
355 aa  397  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  53.93 
 
 
355 aa  395  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  56.34 
 
 
355 aa  395  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  52.26 
 
 
357 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  53.11 
 
 
357 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  53.11 
 
 
357 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  52.54 
 
 
357 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  55.37 
 
 
357 aa  386  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  55.77 
 
 
355 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.69 
 
 
364 aa  384  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  50.99 
 
 
358 aa  372  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.56 
 
 
355 aa  371  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.96 
 
 
354 aa  370  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  53.24 
 
 
355 aa  368  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.83 
 
 
356 aa  357  9.999999999999999e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.69 
 
 
356 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.75 
 
 
355 aa  347  2e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.18 
 
 
376 aa  346  3e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50 
 
 
355 aa  345  8.999999999999999e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.26 
 
 
357 aa  340  2.9999999999999998e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.88 
 
 
357 aa  339  5e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.6 
 
 
355 aa  332  6e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.32 
 
 
355 aa  330  2e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.44 
 
 
359 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.47 
 
 
357 aa  319  3.9999999999999996e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.48 
 
 
349 aa  305  8.000000000000001e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.63 
 
 
354 aa  303  3.0000000000000004e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.94 
 
 
358 aa  301  1e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.2 
 
 
353 aa  290  3e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.21 
 
 
355 aa  280  4e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.36 
 
 
344 aa  279  6e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.29 
 
 
354 aa  278  1e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.9 
 
 
351 aa  249  5e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  32.77 
 
 
365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0479  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.26 
 
 
320 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000000331909  decreased coverage  0.00000000439199 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3859  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.94 
 
 
290 aa  186  7e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2629  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.77 
 
 
298 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.357597  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.71 
 
 
397 aa  182  6e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1399  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  42.26 
 
 
290 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2032  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  43.7 
 
 
312 aa  181  2e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2558  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.66 
 
 
295 aa  181  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5509  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  43.28 
 
 
296 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  42.62 
 
 
296 aa  180  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0305  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.66 
 
 
294 aa  179  5.999999999999999e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.132763  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4118  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.08 
 
 
290 aa  179  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00952178  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13103  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.82 
 
 
286 aa  179  7e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2458  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.34 
 
 
291 aa  179  7e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3013  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  42.92 
 
 
296 aa  179  9e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.515318  hitchhiker  0.00164401 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15940  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  42.19 
 
 
293 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2131  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41 
 
 
297 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0539  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.42 
 
 
294 aa  176  5e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911631  normal  0.057049 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0555  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.35 
 
 
296 aa  176  7e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0637  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, long form  42.19 
 
 
310 aa  176  7e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.210198  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0504  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.66 
 
 
295 aa  176  7e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0219924  normal  0.028839 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1836  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.76 
 
 
290 aa  176  8e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2993  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.76 
 
 
298 aa  175  9e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.776676  normal  0.308092 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2130  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.82 
 
 
288 aa  175  9e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03170  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.49 
 
 
295 aa  175  9e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1423  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.4 
 
 
291 aa  175  9e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0054  Nucleotidyl transferase  38.03 
 
 
243 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3841  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.83 
 
 
290 aa  175  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14400  Glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.27 
 
 
300 aa  175  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.856501  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1570  dTDP-glucose pyrophosphorylase  39.08 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1069  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.83 
 
 
296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.69912  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.92 
 
 
294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000187637 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1619  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.66 
 
 
295 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4018  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.24 
 
 
305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4141  Nucleotidyl transferase  37.1 
 
 
253 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000020886 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2220  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.92 
 
 
294 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.281714  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2083  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.18 
 
 
300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2435  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.92 
 
 
294 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000704371 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2059  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.34 
 
 
302 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2862  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.18 
 
 
301 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000105024  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01945  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.92 
 
 
292 aa  173  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01934  hypothetical protein  37.92 
 
 
270 aa  173  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4130  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.49 
 
 
294 aa  173  5e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3286  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.08 
 
 
288 aa  173  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2319  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.93 
 
 
293 aa  173  5e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2713  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.93 
 
 
289 aa  173  5e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2548  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.1 
 
 
299 aa  173  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.257224  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  34.12 
 
 
396 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1238  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.08 
 
 
296 aa  172  7.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1351  Nucleotidyl transferase  35.2 
 
 
257 aa  172  9e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397002  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4290  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.42 
 
 
290 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.314543 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1603  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.5 
 
 
292 aa  172  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.982513  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0416  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, long form  39.58 
 
 
292 aa  171  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2321  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.5 
 
 
294 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00736153 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5902  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.35 
 
 
293 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2330  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.5 
 
 
292 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0550352  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1194  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.5 
 
 
292 aa  171  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0303  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.29 
 
 
298 aa  171  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1618  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.92 
 
 
293 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0952229  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1079  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.33 
 
 
296 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.857116  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3489  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.59 
 
 
295 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.374251 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>