More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5782 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 974 aa  1868    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  38.91 
 
 		 998 aa  379  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  41.61 
 
 		 952 aa  375  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  37.41 
 
 		 948 aa  348  4e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  39.85 
 
 		 940 aa  345  2e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  38.39 
 
 		 951 aa  342  2e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  37.18 
 
 		 932 aa  340  9.999999999999999e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  38.54 
 
 		 943 aa  303  1e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  36.42 
 
 		 960 aa  297  6e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  33.26 
 
 		 947 aa  251  6e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  35.95 
 
 		 947 aa  215  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3297  transcriptional regulator, LuxR family  31.16 
 
 		 908 aa  166  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 946 aa  157  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1178  transcriptional regulator, LuxR family  45.69 
 
 		 1104 aa  152  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00127631  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1619  Tetratricopeptide TPR_4  33.21 
 
 		 855 aa  133  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0543738  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 877 aa  120  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  28.1 
 
 		 905 aa  117  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3795  ATPase-like protein  35.44 
 
 		 925 aa  108  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.978971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  41.88 
 
 		 940 aa  103  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2421  transcriptional regulator, LuxR family  34.05 
 
 		 939 aa  103  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.924633  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  37.65 
 
 		 913 aa  102  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  29.07 
 
 		 1146 aa  99  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2696  transcriptional regulator, LuxR family  34.13 
 
 		 931 aa  98.6  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.704955  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  29.07 
 
 		 998 aa  97.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4833  LuxR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 994 aa  96.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.010143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  29.01 
 
 		 943 aa  95.9  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 1151 aa  94.7  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 937 aa  92.8  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  37.65 
 
 		 937 aa  92.8  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  37.65 
 
 		 937 aa  92.8  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  39.88 
 
 		 925 aa  92.4  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4346  LuxR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 1030 aa  92  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2716  transcriptional regulator, LuxR family  33.09 
 
 		 941 aa  91.7  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000419619  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  29.55 
 
 		 855 aa  90.5  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  51.64 
 
 		 889 aa  90.5  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3178  transcriptional regulator, LuxR family  36.63 
 
 		 1074 aa  89.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00421599  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  29.85 
 
 		 1685 aa  89.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  37.74 
 
 		 919 aa  89.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  45.31 
 
 		 921 aa  89.4  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  35.29 
 
 		 917 aa  89  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 1015 aa  89  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 921 aa  89  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  28.78 
 
 		 1118 aa  89  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  45.31 
 
 		 921 aa  89  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  29.87 
 
 		 956 aa  88.6  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4595  regulatory protein, LuxR  37.14 
 
 		 336 aa  87.8  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.878319  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  35.44 
 
 		 910 aa  87.8  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  37.17 
 
 		 995 aa  87  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  38.34 
 
 		 940 aa  87.8  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  30.48 
 
 		 1685 aa  86.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  37.22 
 
 		 879 aa  85.9  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 919 aa  84.7  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  36.99 
 
 		 919 aa  84.7  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  36.02 
 
 		 893 aa  84.3  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  28.79 
 
 		 956 aa  83.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  26.31 
 
 		 1029 aa  83.2  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  31.02 
 
 		 1075 aa  82.8  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  27.08 
 
 		 1013 aa  82.4  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  29.25 
 
 		 910 aa  82.4  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  35.86 
 
 		 903 aa  82.4  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  37.4 
 
 		 919 aa  82.4  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  42.15 
 
 		 977 aa  81.6  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  40.59 
 
 		 923 aa  81.6  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  29.17 
 
 		 983 aa  78.6  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  30.05 
 
 		 970 aa  77.8  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 881 aa  77.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 881 aa  77.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 876 aa  77.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  44.86 
 
 		 923 aa  77  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2953  transcriptional regulator, LuxR family  26.61 
 
 		 901 aa  76.6  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  39.85 
 
 		 938 aa  76.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  28.14 
 
 		 1123 aa  76.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 1000 aa  75.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  25.55 
 
 		 1160 aa  75.5  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  34 
 
 		 959 aa  75.5  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  27.52 
 
 		 1403 aa  75.1  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  34.55 
 
 		 936 aa  74.7  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.5 
 
 		 1666 aa  73.9  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  38.21 
 
 		 918 aa  73.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  39.58 
 
 		 927 aa  73.2  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5315  transcriptional regulator, LuxR family  29.02 
 
 		 965 aa  73.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00819594  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  29.92 
 
 		 1054 aa  72.8  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  28.33 
 
 		 923 aa  72.8  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  28.78 
 
 		 1339 aa  72.8  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  38.81 
 
 		 930 aa  72.8  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  27.43 
 
 		 928 aa  72.8  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  37.96 
 
 		 894 aa  72.8  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  30.1 
 
 		 1235 aa  72.8  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  48.48 
 
 		 928 aa  72.4  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2326  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.04 
 
 		 981 aa  72.4  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645479 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  38.81 
 
 		 189 aa  71.6  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  38.66 
 
 		 927 aa  71.2  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  27.14 
 
 		 1029 aa  70.5  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  39.38 
 
 		 921 aa  70.5  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4797  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.79 
 
 		 1468 aa  70.5  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  44.79 
 
 		 904 aa  70.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  26.82 
 
 		 1142 aa  69.7  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  39.53 
 
 		 953 aa  70.1  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  34.78 
 
 		 929 aa  70.1  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  34.42 
 
 		 911 aa  69.3  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>