More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5712 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5712  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 223 aa  446  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  39.27 
 
 		 223 aa  155  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  36.08 
 
 		 238 aa  125  6e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  34.23 
 
 		 254 aa  115  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 247 aa  109  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 233 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1420  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2747  transcriptional regulator, GntR family  32.26 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.756614  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  30.59 
 
 		 262 aa  99  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2501  transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 		 262 aa  99  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 239 aa  98.6  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1161  transcriptional regulator GntR  30.99 
 
 		 228 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480758  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  30.52 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 231 aa  95.9  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3836  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 312 aa  95.1  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155558  normal  0.0735717 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 243 aa  95.1  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0677  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 254 aa  91.7  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2564  transcriptional regulator GntR  30.73 
 
 		 246 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1235  GntR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0705  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 243 aa  89.4  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6449  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 236 aa  89.4  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  normal  0.091376 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 225 aa  85.1  8e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 252 aa  85.1  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1461  transcriptional regulator, GntR family  32.56 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  27.59 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  31.07 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  31.65 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1829  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  30.46 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  29.32 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16960  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.916885 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  33.83 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5236  transcriptional regulator, GntR family  27.1 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  29.7 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5826  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000644703 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0882  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20136  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 255 aa  78.6  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  31.75 
 
 		 221 aa  78.2  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0069  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2825  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0997376 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0185  transcriptional regulator, GntR family  31.44 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.27943  normal  0.15963 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  28.22 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3952  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.942603  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1244  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.487831 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0735  transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000113476  decreased coverage  0.0012324 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4063  GntR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 243 aa  75.1  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.299746  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0978  transcriptional regulator, GntR family  32.81 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134109  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4461  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  31.43 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3274  hypothetical protein  33.85 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00273184  normal  0.0615385 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3224  GntR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3141  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5269  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  27.36 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  31.32 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  28.71 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1988  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0497005  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  32.16 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  27.92 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  31.63 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1405  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359865 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1044  transcriptional regulator  30.52 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000547437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2755  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 229 aa  72  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1793  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 254 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0110  transcriptional regulator, GntR family  27.32 
 
 		 229 aa  72  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2360  GntR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 247 aa  72  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68775 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0602  GntR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 220 aa  72  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0180782  normal  0.364212 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 228 aa  72  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2897  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 234 aa  72  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>