More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5711 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5711  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
550 aa  1109    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5706  extracellular solute-binding protein family 5  48.11 
 
 
552 aa  510  1e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6175  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  46.49 
 
 
541 aa  482  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.510583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4848  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  41.94 
 
 
539 aa  403  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2236  extracellular solute-binding protein family 5  40.64 
 
 
547 aa  385  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0669965  normal  0.364829 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5044  extracellular solute-binding protein family 5  38.64 
 
 
566 aa  358  9.999999999999999e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3349  extracellular solute-binding protein family 5  29.77 
 
 
559 aa  181  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.109598  normal  0.0359992 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  32.77 
 
 
531 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.58 
 
 
510 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 
510 aa  170  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0750  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  28.75 
 
 
559 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0146598  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.73 
 
 
534 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  29.4 
 
 
519 aa  167  6.9999999999999995e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5265  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  27.8 
 
 
515 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154423  normal  0.0706788 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  28.6 
 
 
515 aa  160  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  27.64 
 
 
537 aa  158  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 
510 aa  157  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 
512 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 
512 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 
512 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  27.81 
 
 
509 aa  156  8e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  26.67 
 
 
535 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  28.54 
 
 
495 aa  155  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  30.7 
 
 
528 aa  155  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4792  extracellular solute-binding protein  28.39 
 
 
528 aa  154  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3541  extracellular solute-binding protein family 5  27.5 
 
 
528 aa  154  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4139  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 
528 aa  154  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.414652 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  27.99 
 
 
489 aa  154  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  29.32 
 
 
520 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 
511 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1300  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 
526 aa  150  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  26.5 
 
 
535 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0936  extracellular solute-binding protein  27.89 
 
 
526 aa  147  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  29.34 
 
 
523 aa  147  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 
541 aa  147  6e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.9 
 
 
539 aa  146  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3596  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 
526 aa  145  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0833  extracellular solute-binding protein family 5  28.73 
 
 
532 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54369  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  23.6 
 
 
521 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.6 
 
 
521 aa  144  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  27.02 
 
 
512 aa  144  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  23.6 
 
 
521 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  26.63 
 
 
576 aa  144  4e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  23.6 
 
 
521 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3028  twin-arginine translocation pathway signal  29.25 
 
 
562 aa  143  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  28.18 
 
 
509 aa  144  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.53 
 
 
538 aa  143  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  28.19 
 
 
515 aa  143  7e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  26.86 
 
 
517 aa  143  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  26.71 
 
 
532 aa  143  9e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3842  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 
568 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0450891  normal  0.108057 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  23.42 
 
 
521 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 
505 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  27.22 
 
 
529 aa  142  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  27.05 
 
 
509 aa  141  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0816  extracellular solute-binding protein family 5  29.53 
 
 
496 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0887  extracellular solute-binding protein  29.53 
 
 
496 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.545524  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3144  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 
526 aa  140  6e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000116165  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3619  extracellular solute-binding protein  29.52 
 
 
495 aa  140  7e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.43082  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0756  extracellular solute-binding protein family 5  24.29 
 
 
549 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1219  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 
531 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0111682 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7194  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.25 
 
 
528 aa  139  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169026  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0688  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 
523 aa  139  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110035  normal  0.066295 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  25.64 
 
 
516 aa  138  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  23.61 
 
 
527 aa  139  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0115  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  24.41 
 
 
536 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.65 
 
 
531 aa  139  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1612  extracellular solute-binding protein family 5  25.19 
 
 
549 aa  139  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  26.72 
 
 
505 aa  138  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0666  extracellular solute-binding protein family 5  28.42 
 
 
523 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.404568  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6010  extracellular solute-binding protein family 5  26.82 
 
 
527 aa  138  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  28 
 
 
526 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0232  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 
517 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.84 
 
 
542 aa  137  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2187  extracellular solute-binding protein  28.82 
 
 
519 aa  137  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.843737  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2372  extracellular solute-binding protein family 5  26.69 
 
 
543 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.220552  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0249  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.9 
 
 
545 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3843  extracellular solute-binding protein family 5  24.51 
 
 
530 aa  136  9e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0512301  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  25.92 
 
 
508 aa  136  9e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.35 
 
 
530 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 
525 aa  136  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5794  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 
520 aa  136  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000436692  decreased coverage  0.000177852 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 
501 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 
565 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.79 
 
 
508 aa  135  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0183  solute-binding family 5 protein  23.67 
 
 
546 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0157  twin-arginine translocation pathway signal  26.71 
 
 
545 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.695568  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0226  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 
533 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0058  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 
539 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112335  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0196  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.67 
 
 
546 aa  135  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0186  solute-binding family 5 protein  23.67 
 
 
546 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0215  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.67 
 
 
546 aa  135  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0195  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.67 
 
 
546 aa  135  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 
516 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 
528 aa  135  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 
525 aa  134  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2238  extracellular solute-binding protein family 5  25.84 
 
 
534 aa  134  3.9999999999999996e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00707838  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 
549 aa  134  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1483  extracellular solute-binding protein  23.34 
 
 
542 aa  134  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0180  4-phytase  23.79 
 
 
546 aa  134  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>